RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455157.6

SSUH2-208, Transcript of ssu-2 homolog (C. elegans), human

TSL 2

Gene SSUH2, Length 3,219 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSUH2-208	ENST00000455157	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	LSMEM2	Q8N112	164 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	RNF38	Q9H0F5	515 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	MARCH7	Q9H992	704 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	FZD10	Q9ULW2	581 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	EVPL	Q92817	2033 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	PSME4	Q14997	1843 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	CENPBD1	B2RD01	187 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	CDK2AP1	O14519	115 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	ICMT	O60725	284 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	CRCP	O75575	148 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC4A1	P02730	911 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	DPP6	P42658	865 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	TKTL1	P51854	596 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC7A2	P52569	658 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	ATP6V0D1	P61421	351 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	CCDC58	Q4VC31	144 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	CYS1	Q717R9	158 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	DOK1	Q99704	481 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	MRGBP	Q9NV56	204 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	PIM2	Q9P1W9	311 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	FAM72C	H0Y354	149 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	DLX3	O60479	287 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	GABBR2	O75899	941 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	MYO1D	O94832	1006 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	LRPAP1	P30533	357 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	EPHX2	P34913	555 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	TPTE	P56180	551 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	CDH17	Q12864	832 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	MAPRE2	Q15555	327 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	FGD3	Q5JSP0	725 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	FAM72A	Q5TYM5	149 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	STRADA	Q7RTN6	431 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	FAM72B	Q86X60	149 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	DHFR2	Q86XF0	187 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	OR9I1	Q8NGQ6	314 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	HM13	Q8TCT9	377 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	AFG1L	Q8WV93	481 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	TNIP3	Q96KP6	325 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	IL22	Q9GZX6	179 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	CIT	O14578	2027 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	NR5A2	O00482	541 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	GRID2	O43424	1007 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	CAPNS1	P04632	268 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	CXCR2	P25025	360 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	TSPY1	Q01534	308 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	GALNT2	Q10471	571 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	UGP2	Q16851	508 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	LBX2	Q6XYB7	198 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	OSTM1	Q86WC4	334 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	PIF1	Q9H611	641 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	TRIM64B	A6NI03	449 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	GNA12	Q03113	381 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	OSMR	Q99650	979 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	PIGV	Q9NUD9	493 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58

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