RNA–Protein interactions for RNA: tK(UUU)D

tK(UUU)D, Transcript of Lysine tRNA (tRNA-Lys), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tK(UUU)D, Length 73 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tK(UUU)DtK(UUU)D UBX5Q06682 500 aa3.83□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D ICL2Q12031 575 aa3.83□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D RAD50P12753 1312 aa3.83□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D FIG2P25653 1609 aa3.82□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D RAD18P10862 487 aa3.82□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D PRE10P21242 288 aaKnown RBP RIP-Chip data3.82□□□□□ -1.8not detected
tK(UUU)DtK(UUU)D SRP40P32583 406 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D RGT1P32862 1170 aa3.82□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D TIM23P32897 222 aa3.82□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D WHI3P34761 661 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D TIF4631P39935 952 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D UBP9P39967 754 aa3.82□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D YMR147WP40218 223 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D TPM2P40414 161 aa3.82□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D EPS1P40557 701 aa3.82□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D VPS53P47061 822 aa3.82□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D PTK2P47116 818 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D PIB2P53191 635 aa3.82□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D YML037CQ03703 340 aa3.82□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D PIB1Q06651 286 aa3.82□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D TUS1Q06412 1307 aa3.81□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D NUC1P08466 329 aa3.81□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D HEM1P09950 548 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D KRS1P15180 591 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D MCM4P30665 933 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D ANP1P32629 500 aa3.81□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D AVT3P36062 692 aa3.81□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D MAL31P38156 614 aa3.81□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D ILV3P39522 585 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D YJR107WP47145 328 aa3.81□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D YGR125WP53273 1036 aa3.81□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D VPS62P53285 467 aa3.81□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D UFD2P54860 961 aa3.81□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D RPT6Q01939 405 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D VPS30Q02948 557 aa3.81□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D ESF1Q06344 628 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D MSC6Q08818 692 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D RIM20Q12033 661 aa3.81□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D RPL8AP17076 256 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D MAK31P23059 88 aa3.8□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D RER2P35196 286 aa3.8□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D MYO3P36006 1272 aa3.8□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D OPY1P38271 328 aa3.8□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D YPL034WQ03083 165 aa3.8□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D CSC1Q06538 782 aa3.8□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D ISA1Q07821 250 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D ISW2Q08773 1120 aa3.8□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D YOR131CQ12486 218 aa3.8□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D LAM4P38800 1345 aa3.79□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D SES1P07284 462 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D ACE2P21192 770 aa3.79□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D RIT1P23796 513 aa3.79□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D CHS3P29465 1165 aa3.79□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D TFC4P33339 1025 aa3.79□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D GPT2P36148 743 aa3.79□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D PAM1P37304 830 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D MSC7P38694 644 aa3.79□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D VPS29P38759 282 aa3.79□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D SPO22P40511 975 aa3.79□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D CLA4P48562 842 aa3.79□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D HUL5P53119 910 aa3.79□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D LIF1P53150 421 aa3.79□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D BUL2Q03758 920 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D EST2Q06163 884 aa3.79□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D SUT2Q12286 268 aa3.79□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D DUR1,2P32528 1835 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D CHO2P05374 869 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D SAM2P19358 384 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D PEP3P27801 918 aa3.78□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D IMP2'P32351 346 aa3.78□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D UTR4P32626 227 aa3.78□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D MCR1P36060 302 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D UIP5P36137 443 aa3.78□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D AAP1P37898 856 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D HMF1P40037 129 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D ALD5P40047 520 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D MDM1Q01846 1127 aa3.78□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D YML020WQ03722 664 aa3.78□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D SPH1Q06160 661 aa3.78□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D ECM30Q06673 1274 aa3.78□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D UTP4Q06679 776 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D GUD1Q07729 489 aa3.78□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D MDM20Q12387 796 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
tK(UUU)DtK(UUU)D TKL1P23254 680 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
tK(UUU)DtK(UUU)D DBP1P24784 617 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
tK(UUU)DtK(UUU)D TGL1P34163 548 aa3.77□□□□□ -1.81
tK(UUU)DtK(UUU)D PHO88P38264 188 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
tK(UUU)DtK(UUU)D KSP1P38691 1029 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
tK(UUU)DtK(UUU)D YHL050CP38721 697 aa3.77□□□□□ -1.81
tK(UUU)DtK(UUU)D CCT3P39077 534 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
tK(UUU)DtK(UUU)D FIR1P40020 876 aa3.77□□□□□ -1.81
tK(UUU)DtK(UUU)D KRI1P42846 591 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
tK(UUU)DtK(UUU)D FMS1P50264 508 aa3.77□□□□□ -1.81
tK(UUU)DtK(UUU)D GCR2Q01722 534 aa3.77□□□□□ -1.81
tK(UUU)DtK(UUU)D SLD5Q03406 294 aa3.77□□□□□ -1.81
tK(UUU)DtK(UUU)D MYO5Q04439 1219 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
tK(UUU)DtK(UUU)D CSM3Q04659 317 aa3.77□□□□□ -1.81
tK(UUU)DtK(UUU)D DUS4Q06063 367 aa3.77□□□□□ -1.81
tK(UUU)DtK(UUU)D VIP1Q06685 1146 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
tK(UUU)DtK(UUU)D DSE3Q08729 430 aa3.77□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 72.8 ms