RNA–Protein interactions for RNA: YPL163C

SVS1, Transcript of Cell wall and vacuolar protein, yeast

Gene SVS1, Length 783 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SVS1	YPL163C	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SVS1	YPL163C	NUT1	P53114	1132 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SVS1	YPL163C	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SVS1	YPL163C	RCM1	P53972	490 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SVS1	YPL163C	CDC55	Q00362	526 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SVS1	YPL163C	MEC3	Q02574	474 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SVS1	YPL163C	YIG1	Q08956	461 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SVS1	YPL163C	YLL054C	Q12244	843 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SVS1	YPL163C	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SVS1	YPL163C	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SVS1	YPL163C	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SVS1	YPL163C	RNQ1	P25367	405 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SVS1	YPL163C	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SVS1	YPL163C	CIT3	P43635	486 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SVS1	YPL163C	GCV1	P48015	400 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SVS1	YPL163C	EAR1	Q03212	550 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SVS1	YPL163C	NUT2	Q06213	157 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SVS1	YPL163C	SEG2	P34250	1132 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SVS1	YPL163C	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SVS1	YPL163C	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SVS1	YPL163C	MSH6	Q03834	1242 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SVS1	YPL163C	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SVS1	YPL163C	YGR045C	P53229	120 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SVS1	YPL163C	YAF9	P53930	226 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SVS1	YPL163C	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SVS1	YPL163C	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVS1	YPL163C	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVS1	YPL163C	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVS1	YPL163C	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVS1	YPL163C	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVS1	YPL163C	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVS1	YPL163C	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVS1	YPL163C	YHL050C	P38721	697 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVS1	YPL163C	YHR219W	P38900	624 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVS1	YPL163C	PMT7	Q06644	662 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVS1	YPL163C	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SVS1	YPL163C	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVS1	YPL163C	NSI1	Q12457	570 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVS1	YPL163C	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SVS1	YPL163C	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SVS1	YPL163C	NFS1	P25374	497 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SVS1	YPL163C	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SVS1	YPL163C	SLS1	P42900	643 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SVS1	YPL163C	AVO1	Q08236	1176 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SVS1	YPL163C	YKL077W	P36081	392 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SVS1	YPL163C	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SVS1	YPL163C	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SVS1	YPL163C	SAP155	P43612	1002 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SVS1	YPL163C	DFG16	Q99234	619 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SVS1	YPL163C	HSP78	P33416	811 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SVS1	YPL163C	SSY1	Q03770	852 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SVS1	YPL163C	AOS1	Q06624	347 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SVS1	YPL163C	UBP5	P39944	805 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SVS1	YPL163C	ALT1	P52893	592 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SVS1	YPL163C	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SVS1	YPL163C	ADP1	P25371	1049 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SVS1	YPL163C	PRO1	P32264	428 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SVS1	YPL163C	ELM1	P32801	640 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SVS1	YPL163C	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SVS1	YPL163C	SAM37	P50110	327 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SVS1	YPL163C	PEX13	P80667	386 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SVS1	YPL163C	YCS4	Q06156	1176 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SVS1	YPL163C	TRE1	Q08919	783 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SVS1	YPL163C	YVC1	Q12324	675 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SVS1	YPL163C	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SVS1	YPL163C	UGA4	P32837	571 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SVS1	YPL163C	EXO5	P38289	585 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SVS1	YPL163C	YNR063W	P53749	607 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SVS1	YPL163C	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SVS1	YPL163C	MET4	P32389	672 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SVS1	YPL163C	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SVS1	YPL163C	PPX1	P38698	397 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SVS1	YPL163C	NEM1	P38757	446 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SVS1	YPL163C	ECL1	P48235	211 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SVS1	YPL163C	WHI5	Q12416	295 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SVS1	YPL163C	NNK1	P36003	928 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SVS1	YPL163C	PTC7	P38797	343 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SVS1	YPL163C	PEX7	P39108	375 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SVS1	YPL163C	GTS1	P40956	396 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SVS1	YPL163C	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SVS1	YPL163C	TPP1	Q03796	238 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SVS1	YPL163C	MSH3	P25336	1018 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SVS1	YPL163C	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SVS1	YPL163C	IPL1	P38991	367 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SVS1	YPL163C	DAL4	Q04895	635 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SVS1	YPL163C	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SVS1	YPL163C	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SVS1	YPL163C	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SVS1	YPL163C	SHU2	P38957	223 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SVS1	YPL163C	YAR028W	P39548	234 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SVS1	YPL163C	THI12	P42883	340 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SVS1	YPL163C	THI5	P43534	340 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SVS1	YPL163C	THI11	P47183	340 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SVS1	YPL163C	YML020W	Q03722	664 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SVS1	YPL163C	TOS4	Q06266	489 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SVS1	YPL163C	THI13	Q07748	340 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SVS1	YPL163C	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SVS1	YPL163C	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SVS1	YPL163C	XKS1	P42826	600 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SVS1	YPL163C	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64

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