RNA–Protein interactions for RNA: YOR168W

GLN4, Transcript of Glutamine tRNA synthetase, yeast

Gene GLN4, Length 2,430 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GLN4	YOR168W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	MEF1	P25039	761 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	TFC4	P33339	1025 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	RXT2	P38255	430 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	HXT5	P38695	592 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	FIG4	P42837	879 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	PSR2	Q07949	397 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	SAM3	Q08986	587 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	DBF20	P32328	564 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	NPL4	P33755	580 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	NUP120	P35729	1037 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	VTC2	P43585	828 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	VTI1	Q04338	217 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	BDS1	Q08347	646 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
GLN4	YOR168W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	PTP2	P29461	750 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	ISC10	P32645	267 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	YHL041W	P38730	149 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	CAJ1	P39101	391 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	ATG3	P40344	310 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	YJR115W	P47152	169 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	OXR1	Q08952	273 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	AI4	P03878	556 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	AAD3	P25612	363 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	SAP185	P40856	1058 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	RSC4	Q02206	625 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	MCD1	Q12158	566 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	TEC1	P18412	486 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	YHR218W	P38899	603 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	PIC2	P40035	300 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	YDR286C	Q05530	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	SPO75	Q07798	868 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	GCR1	P07261	785 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	SPS1	P08458	490 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	MSM1	P22438	575 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	SAS3	P34218	831 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	PTH2	P34222	208 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	KTR4	P38131	464 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	DJP1	P40564	432 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	MRPS18	P42847	217 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	GNP1	P48813	663 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	ERF2	Q06551	359 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	PIB1	Q06651	286 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	CDC73	Q06697	393 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	BAS1	P22035	811 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	GUT2	P32191	649 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	UGA4	P32837	571 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	SEA4	P38164	1038 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	VPS8	P39702	1274 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	MGS1	P40151	587 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	NPY1	P53164	384 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	APP1	P53933	587 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	RCF1	Q03713	159 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	ALR1	Q08269	859 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	OSH2	Q12451	1283 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	INO80	P53115	1489 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	CAB3	P36076	571 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	GDH3	P39708	457 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	SGM1	P47166	707 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	YPL109C	Q02981	657 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	HEH2	Q03281	663 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	DAL4	Q04895	635 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	YKL050C	P35736	922 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	PGC1	Q08959	321 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	MDM12	Q92328	271 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	RGP1	P16664	663 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	AGP1	P25376	633 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	KIP2	P28743	706 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	RRF1	P38771	230 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	MAM1	P40065	302 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	IRR1	P40541	1150 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GLN4	YOR168W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.5 ms