RNA–Protein interactions for RNA: YOR160W

MTR10, Transcript of Nuclear import receptor, yeast

Gene MTR10, Length 2,919 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MTR10	YOR160W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	SEC9	P40357	651 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	RTT109	Q07794	436 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	ERP4	Q12450	207 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	MSC7	P38694	644 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	UBP12	P39538	1254 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	BOI2	P39969	1040 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	TPM2	P40414	161 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	ENT2	Q05785	613 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	HSP42	Q12329	375 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	PIF1	P07271	859 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	NNF2	P53253	936 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	YPR172W	Q06608	200 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	ADP1	P25371	1049 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	SAP190	P36123	1033 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	OCA5	P38738	679 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	ATG1	P53104	897 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	TSR4	P25040	408 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	YDJ1	P25491	409 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	MOT1	P32333	1867 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	IXR1	P33417	597 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	ACA1	P39970	489 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	YJL007C	P47080	104 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	CYB2	P00175	591 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	MPH3	P0CE00	602 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	PKC1	P24583	1151 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	MUM2	P38236	366 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	LEM3	P42838	414 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	MET7	Q08645	548 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	YLL054C	Q12244	843 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	MCD4	P36051	919 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	YPP1	P46951	817 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	VID30	P53076	958 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	STE5	P32917	917 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	BCH2	P36122	765 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	YNR014W	P53719	212 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	COG4	Q06096	861 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	LDB19	Q12502	818 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	KAR1	P11927	433 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.73	□□□□□ -1.65	not detected
MTR10	YOR160W	PIM1	P36775	1133 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	GPB2	P39717	880 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	PEX29	Q03370	554 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	SUT2	Q12286	268 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	RGT1	P32862	1170 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	UIP5	P36137	443 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	MET1	P36150	593 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	AIM20	P40451	204 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	BBC1	P47068	1157 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	MAM3	Q12296	706 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	TIM23	P32897	222 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	MGA2	P40578	1113 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	GYP5	Q12344	894 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MTR10	YOR160W	ERG12	P07277	443 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MTR10	YOR160W	EUG1	P32474	517 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MTR10	YOR160W	SWI3	P32591	825 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MTR10	YOR160W	TFC3	P34111	1160 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MTR10	YOR160W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MTR10	YOR160W	PES4	P39684	611 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MTR10	YOR160W	RNH70	P53331	553 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MTR10	YOR160W	MDM1	Q01846	1127 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MTR10	YOR160W	VTC3	Q02725	835 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MTR10	YOR160W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MTR10	YOR160W	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MTR10	YOR160W	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MTR10	YOR160W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MTR10	YOR160W	BYE1	P36106	594 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MTR10	YOR160W	YBR287W	P38355	427 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MTR10	YOR160W	GGA1	Q06336	557 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MTR10	YOR160W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MTR10	YOR160W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MTR10	YOR160W	KEL2	P50090	882 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MTR10	YOR160W	RSC2	Q06488	889 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MTR10	YOR160W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MTR10	YOR160W	CEX1	Q12453	761 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MTR10	YOR160W	YOR131C	Q12486	218 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MTR10	YOR160W	HEM3	P28789	327 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MTR10	YOR160W	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.69	□□□□□ -1.66	not detected
MTR10	YOR160W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66

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