RNA–Protein interactions for RNA: YOL004W

SIN3, Transcript of Component of both the Rpd3S and Rpd3L histone deacetylase complexes, yeastyeast

Gene SIN3, Length 4,611 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SIN3YOL004W RGA2Q06407 1009 aa3.53□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W MSH4P40965 878 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W POL30P15873 258 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W PEX28P38848 579 aa3.52□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W HEF3P53978 1044 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W RSM10Q03201 203 aa3.52□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W SUT2Q12286 268 aa3.52□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W SSM4P40318 1319 aa3.52□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W PDC1P06169 563 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W CDC48P25694 835 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W RAM2P29703 316 aa3.52□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W KEX1P09620 729 aa3.52□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W PFK1P16861 987 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W PRP9P19736 530 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W RAD53P22216 821 aa3.52□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W DTR1P38125 572 aa3.52□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W SIS2P36024 562 aa3.51□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W LAM4P38800 1345 aa3.51□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W ROM1P53046 1155 aa3.51□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W YGR125WP53273 1036 aa3.51□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W MEX67Q99257 599 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W MIP1P15801 1254 aa3.51□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W SRP40P32583 406 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W NNF1P47149 201 aa3.51□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W VID22Q05934 901 aa3.51□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W REH1Q06709 432 aa3.51□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W FMP45Q07651 309 aa3.51□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W NAB2P32505 525 aaKnown RBP RIP-Chip data3.51□□□□□ -1.85 RIP-Chip
SIN3YOL004W SGM1P47166 707 aa3.51□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W RRP14P36080 434 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W FET5P43561 622 aa3.51□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W IRC4Q03036 179 aa3.51□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W RPP0P05317 312 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W BOI1P38041 980 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W RRP6Q12149 733 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W LCB4Q12246 624 aa3.5□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W ATH1P48016 1211 aa3.5□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W SPO1P53541 631 aa3.5□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W NIS1P53939 407 aa3.5□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W YLL058WQ12198 575 aa3.5□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W TY1B-HO13535 1793 aa3.5□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W TY1B-DR5P0C2I2 1755 aa3.5□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W TY1B-DR6P0C2I3 1755 aa3.5□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W TY1B-LR2P0C2I5 1755 aa3.5□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W TY1B-LR3P0C2I6 1755 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W TY1B-PR1P0C2I9 1755 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W TY1B-PR2P0C2J0 1756 aa3.5□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W TY1B-PR3P0C2J1 1755 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W TY1B-JR1P47098 1755 aa3.5□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W TY1B-ML2Q03434 1755 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W TY1B-ER1Q03612 1755 aa3.5□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W TY1B-ML1Q04711 1755 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W TY1B-GR2Q12269 1755 aa3.5□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W TY1B-OLQ12273 1755 aa3.5□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W TY1B-PLQ12414 1755 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W SEC14P24280 304 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W BUD14P27637 709 aa3.5□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W SPE2P21182 396 aa3.5□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W OSM1P21375 501 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W SGF29P25554 259 aa3.5□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W MCM4P30665 933 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W DID4P36108 232 aa3.5□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W KIC1P38692 1080 aa3.5□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W ACA1P39970 489 aa3.5□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W RRN6P32786 894 aa3.49□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W YKL050CP35736 922 aa3.49□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W STM1P39015 273 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W FAP1P53971 965 aa3.49□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W INP2Q03824 705 aa3.49□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W RRP15Q06511 250 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W YDL206WQ12424 762 aa3.49□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W DSN1P40568 576 aa3.49□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W TRF5P48561 642 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W PRP43P53131 767 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W PHR1P05066 565 aaKnown RBP RIP-Chip data3.49□□□□□ -1.85not detected
SIN3YOL004W BIM1P40013 344 aa3.49□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W WHI4Q07655 649 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W YML133CQ03099 1374 aa3.49□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W MAK11P20484 414 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W CYM1P32898 989 aa3.48□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W FMP10P40098 244 aa3.48□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W SDS3P40505 327 aa3.48□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W OSW7P43611 510 aa3.48□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W CSN12P47130 423 aa3.48□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W NUP84P52891 726 aa3.48□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W TAM41P53230 385 aa3.48□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W OPT2Q06593 877 aa3.48□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa3.48□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W TY2B-FP0CX63 1770 aa3.48□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W TY2B-GR2P0CX64 1770 aa3.48□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W TY2B-CP25384 1770 aa3.48□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W TY2B-DR2Q03494 1770 aa3.48□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W TY1B-DR1Q03855 1755 aa3.48□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W TY2B-DR3Q07791 1770 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W TY2B-OR1Q12113 1770 aa3.48□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W TY2B-DR1Q12472 1770 aa3.48□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W TY2B-OR2Q12501 1770 aa3.48□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W KCC4P25389 1037 aa3.48□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W RCR1P38212 213 aa3.48□□□□□ -1.85
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