RNA–Protein interactions for RNA: YMR008C

PLB1, Transcript of Phospholipase B (lysophospholipase) involved in lipid metabolism, yeast

Gene PLB1, Length 1,995 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PLB1	YMR008C	GRX6	Q12438	231 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PLB1	YMR008C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PLB1	YMR008C	GSY2	P27472	705 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PLB1	YMR008C	RXT2	P38255	430 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PLB1	YMR008C	PCI8	P40512	444 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PLB1	YMR008C	ALG2	P43636	503 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PLB1	YMR008C	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PLB1	YMR008C	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
PLB1	YMR008C	PUS6	P53294	404 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PLB1	YMR008C	GDE1	Q02979	1223 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PLB1	YMR008C	TIM50	Q02776	476 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PLB1	YMR008C	TFC8	Q12308	588 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PLB1	YMR008C	EAF6	P47128	113 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PLB1	YMR008C	CYC8	P14922	966 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PLB1	YMR008C	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
PLB1	YMR008C	ASF1	P32447	279 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PLB1	YMR008C	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
PLB1	YMR008C	MNN4	P36044	1178 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PLB1	YMR008C	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
PLB1	YMR008C	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
PLB1	YMR008C	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
PLB1	YMR008C	CSC1	Q06538	782 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PLB1	YMR008C	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
PLB1	YMR008C	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
PLB1	YMR008C	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
PLB1	YMR008C	PTC5	Q12511	572 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PLB1	YMR008C	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
PLB1	YMR008C	YKU70	P32807	602 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PLB1	YMR008C	TIF4632	P39936	914 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
PLB1	YMR008C	KIN4	Q01919	800 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PLB1	YMR008C	WAR1	Q03631	944 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PLB1	YMR008C	VPS8	P39702	1274 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PLB1	YMR008C	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
PLB1	YMR008C	FLO11	P08640	1367 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PLB1	YMR008C	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
PLB1	YMR008C	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
PLB1	YMR008C	CEX1	Q12453	761 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PLB1	YMR008C	CTT1	P06115	562 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PLB1	YMR008C	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PLB1	YMR008C	DPL1	Q05567	589 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PLB1	YMR008C	MMR1	Q06324	491 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PLB1	YMR008C	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PLB1	YMR008C	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.62
PLB1	YMR008C	YGL138C	P53122	345 aa		11.21	□□□□□ -0.62
PLB1	YMR008C	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
PLB1	YMR008C	ESC2	Q06340	456 aa		11.21	□□□□□ -0.62
PLB1	YMR008C	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.62
PLB1	YMR008C	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PLB1	YMR008C	PSY4	P38193	441 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PLB1	YMR008C	GIS4	Q04233	774 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PLB1	YMR008C	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.19	□□□□□ -0.62	not detected
PLB1	YMR008C	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PLB1	YMR008C	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PLB1	YMR008C	ACE2	P21192	770 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PLB1	YMR008C	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PLB1	YMR008C	LYS14	P40971	790 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PLB1	YMR008C	YOR296W	Q08748	1289 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PLB1	YMR008C	CIT1	P00890	479 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PLB1	YMR008C	AFG2	P32794	780 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PLB1	YMR008C	ALG1	P16661	449 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PLB1	YMR008C	PRE8	P23639	250 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PLB1	YMR008C	MNR2	P35724	969 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PLB1	YMR008C	STU2	P46675	888 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PLB1	YMR008C	DSE3	Q08729	430 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PLB1	YMR008C	TIP41	Q12199	356 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PLB1	YMR008C	SRM1	P21827	482 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PLB1	YMR008C	CHS3	P29465	1165 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PLB1	YMR008C	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PLB1	YMR008C	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PLB1	YMR008C	VPS30	Q02948	557 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PLB1	YMR008C	TMA16	Q08687	178 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PLB1	YMR008C	FOL1	P53848	824 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PLB1	YMR008C	AFT2	Q08957	416 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PLB1	YMR008C	PCL8	Q08966	492 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PLB1	YMR008C	DIP2	Q12220	943 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PLB1	YMR008C	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PLB1	YMR008C	CDC15	P27636	974 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PLB1	YMR008C	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PLB1	YMR008C	YJL171C	P46992	396 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PLB1	YMR008C	RTC4	P53850	401 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PLB1	YMR008C	MDM1	Q01846	1127 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PLB1	YMR008C	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PLB1	YMR008C	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PLB1	YMR008C	DAK2	P43550	591 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PLB1	YMR008C	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PLB1	YMR008C	SKG3	Q06315	1026 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PLB1	YMR008C	NUC1	P08466	329 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PLB1	YMR008C	MAK11	P20484	414 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PLB1	YMR008C	GSC2	P40989	1895 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PLB1	YMR008C	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PLB1	YMR008C	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PLB1	YMR008C	RET3	P53600	189 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PLB1	YMR008C	TRS120	Q04183	1289 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PLB1	YMR008C	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PLB1	YMR008C	TOP1	P04786	769 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PLB1	YMR008C	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PLB1	YMR008C	SPB4	P25808	606 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PLB1	YMR008C	HIR1	P32479	840 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PLB1	YMR008C	PSR2	Q07949	397 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PLB1	YMR008C	MYO1	P08964	1928 aa		11.13	□□□□□ -0.63

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