RNA–Protein interactions for RNA: YHR124W

NDT80, Transcript of Meiosis-specific transcription factor, yeast

Gene NDT80, Length 1,884 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NDT80	YHR124W	GCV1	P48015	400 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NDT80	YHR124W	RSC4	Q02206	625 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NDT80	YHR124W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NDT80	YHR124W	FRT1	Q99332	602 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NDT80	YHR124W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
NDT80	YHR124W	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
NDT80	YHR124W	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
NDT80	YHR124W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
NDT80	YHR124W	NPR1	P22211	790 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NDT80	YHR124W	YHL008C	P38750	627 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NDT80	YHR124W	RCM1	P53972	490 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NDT80	YHR124W	NUT2	Q06213	157 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NDT80	YHR124W	CDA2	Q06703	312 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NDT80	YHR124W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
NDT80	YHR124W	HSP78	P33416	811 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NDT80	YHR124W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
NDT80	YHR124W	YHL050C	P38721	697 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NDT80	YHR124W	YHR219W	P38900	624 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NDT80	YHR124W	MSH6	Q03834	1242 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NDT80	YHR124W	TRS120	Q04183	1289 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NDT80	YHR124W	MNL2	Q12205	849 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NDT80	YHR124W	YLL054C	Q12244	843 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NDT80	YHR124W	UFD2	P54860	961 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NDT80	YHR124W	NSI1	Q12457	570 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NDT80	YHR124W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NDT80	YHR124W	YCR015C	P25616	317 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NDT80	YHR124W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NDT80	YHR124W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NDT80	YHR124W	SAP155	P43612	1002 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NDT80	YHR124W	ALT1	P52893	592 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NDT80	YHR124W	MEC3	Q02574	474 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NDT80	YHR124W	EAR1	Q03212	550 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NDT80	YHR124W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NDT80	YHR124W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NDT80	YHR124W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NDT80	YHR124W	IPL1	P38991	367 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NDT80	YHR124W	ORC3	P54790	616 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NDT80	YHR124W	GPI13	Q07830	1017 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NDT80	YHR124W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
NDT80	YHR124W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
NDT80	YHR124W	WHI5	Q12416	295 aa		4.09	□□□□□ -1.76
NDT80	YHR124W	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
NDT80	YHR124W	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
NDT80	YHR124W	SLD2	P34252	453 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NDT80	YHR124W	THI80	P35202	319 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NDT80	YHR124W	PPX1	P38698	397 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NDT80	YHR124W	PEX7	P39108	375 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NDT80	YHR124W	ESC8	Q08119	714 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NDT80	YHR124W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
NDT80	YHR124W	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
NDT80	YHR124W	TAF1	P46677	1066 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NDT80	YHR124W	YVC1	Q12324	675 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NDT80	YHR124W	FLP1	P03870	423 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NDT80	YHR124W	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NDT80	YHR124W	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NDT80	YHR124W	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NDT80	YHR124W	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NDT80	YHR124W	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NDT80	YHR124W	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NDT80	YHR124W	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NDT80	YHR124W	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NDT80	YHR124W	ADP1	P25371	1049 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NDT80	YHR124W	MET4	P32389	672 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NDT80	YHR124W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NDT80	YHR124W	TRE1	Q08919	783 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NDT80	YHR124W	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NDT80	YHR124W	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NDT80	YHR124W	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NDT80	YHR124W	SEC20	P28791	383 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NDT80	YHR124W	YGR045C	P53229	120 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NDT80	YHR124W	YNL011C	P53980	444 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NDT80	YHR124W	CDC55	Q00362	526 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NDT80	YHR124W	SSY1	Q03770	852 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NDT80	YHR124W	YKL222C	P35995	705 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NDT80	YHR124W	NUT1	P53114	1132 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NDT80	YHR124W	YAF9	P53930	226 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NDT80	YHR124W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
NDT80	YHR124W	BSC2	Q05611	235 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NDT80	YHR124W	NFS1	P25374	497 aa		4.03	□□□□□ -1.76
NDT80	YHR124W	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
NDT80	YHR124W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
NDT80	YHR124W	IOC4	Q04213	475 aa		4.03	□□□□□ -1.76
NDT80	YHR124W	PMT7	Q06644	662 aa		4.03	□□□□□ -1.76
NDT80	YHR124W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.77
NDT80	YHR124W	PRO1	P32264	428 aa		4.03	□□□□□ -1.77
NDT80	YHR124W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.77
NDT80	YHR124W	THI12	P42883	340 aa		4.03	□□□□□ -1.77
NDT80	YHR124W	THI5	P43534	340 aa		4.03	□□□□□ -1.77
NDT80	YHR124W	THI11	P47183	340 aa		4.03	□□□□□ -1.77
NDT80	YHR124W	THI13	Q07748	340 aa		4.03	□□□□□ -1.77
NDT80	YHR124W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
NDT80	YHR124W	GIP4	P39732	760 aa		4.02	□□□□□ -1.77
NDT80	YHR124W	HEM3	P28789	327 aa		4.01	□□□□□ -1.77
NDT80	YHR124W	NNK1	P36003	928 aa		4.01	□□□□□ -1.77
NDT80	YHR124W	FLR1	P38124	548 aa		4.01	□□□□□ -1.77
NDT80	YHR124W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
NDT80	YHR124W	YDL177C	Q12257	170 aa		4.01	□□□□□ -1.77
NDT80	YHR124W	ATE1	P16639	503 aa		4.01	□□□□□ -1.77
NDT80	YHR124W	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
NDT80	YHR124W	EXO5	P38289	585 aa		4.01	□□□□□ -1.77

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