RNA–Protein interactions for RNA: YHR069C

RRP4, Transcript of Exosome non-catalytic core component, yeastyeast

Gene RRP4, Length 1,080 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP4YHR069C EMP47P43555 445 aa6.75□□□□□ -1.33
RRP4YHR069C HAP5Q02516 242 aa6.75□□□□□ -1.33
RRP4YHR069C CHO2P05374 869 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
RRP4YHR069C TRL1P09880 827 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
RRP4YHR069C PEX21P50091 288 aa6.74□□□□□ -1.33
RRP4YHR069C ATF2P53296 535 aa6.74□□□□□ -1.33
RRP4YHR069C ELP4Q02884 456 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
RRP4YHR069C TFB4Q12004 338 aa6.74□□□□□ -1.33
RRP4YHR069C SSA4P22202 642 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RRP4YHR069C MET1P36150 593 aa6.73□□□□□ -1.33
RRP4YHR069C AIM9P40053 627 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RRP4YHR069C YIR014WP40570 242 aa6.73□□□□□ -1.33
RRP4YHR069C PIP2P52960 996 aa6.73□□□□□ -1.33
RRP4YHR069C YPR109WQ06104 294 aa6.73□□□□□ -1.33
RRP4YHR069C CBP1P07252 654 aa6.72□□□□□ -1.33
RRP4YHR069C KEL1P38853 1164 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RRP4YHR069C SEN54Q02825 467 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RRP4YHR069C PCL8Q08966 492 aa6.72□□□□□ -1.33
RRP4YHR069C AIM7Q12156 149 aa6.72□□□□□ -1.33
RRP4YHR069C YRR1Q12172 810 aa6.72□□□□□ -1.33
RRP4YHR069C PGA3Q12746 312 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RRP4YHR069C SKI2P35207 1287 aaKnown RBP RIP-Chip data6.71□□□□□ -1.34not detected
RRP4YHR069C PRE3P38624 215 aa6.71□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C RTS1P38903 757 aa6.71□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C ENP2P48234 707 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C HDA1P53973 706 aa6.71□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C RPS15Q01855 142 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C ECM23Q02710 187 aa6.71□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C SSF2Q12153 453 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C PDR1P12383 1068 aa6.7□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C KIN1P13185 1064 aa6.7□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C RAD53P22216 821 aa6.7□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C MYO3P36006 1272 aa6.7□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C CIC1P38779 376 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C CRG1P38892 291 aaRIP-Chip data6.7□□□□□ -1.34not detected
RRP4YHR069C PEA2P40091 420 aa6.7□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C YPL260WQ08977 551 aa6.7□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C KEL3Q08979 651 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C ADP1P25371 1049 aa6.69□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C SLN1P39928 1220 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C VID27P40157 782 aa6.69□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C NIT1P40447 199 aa6.69□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C MSH4P40965 878 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C PTK2P47116 818 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C SPN1Q06505 410 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C CSR2Q12734 1121 aa6.69□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C RAD61Q99359 647 aa6.69□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C PEP3P27801 918 aa6.68□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C PRO3P32263 286 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C RER2P35196 286 aa6.68□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C PNT1P38969 423 aa6.68□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C YIL089WP40500 205 aa6.68□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C UFD2P54860 961 aa6.68□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C TUB2P02557 457 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C PMA1P05030 918 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C CHL1P22516 861 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C PRE8P23639 250 aa6.67□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C IMP2'P32351 346 aa6.67□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C ANP1P32629 500 aa6.67□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C SPT23P35210 1082 aa6.67□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C YBL028CP38202 106 aa6.67□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C OPY1P38271 328 aa6.67□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C RRP8P38961 392 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C SPO22P40511 975 aa6.67□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C BNI4P53858 892 aa6.67□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C CWC15Q03772 175 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C SKG3Q06315 1026 aa6.67□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C YDL124WQ07551 312 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C TPM1P17536 199 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C CLB5P30283 435 aa6.66□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C MRD1Q06106 887 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C TYW1Q08960 810 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C RLF2Q12495 606 aa6.66□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C SRM1P21827 482 aa6.65□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C RAM1P22007 431 aa6.65□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C RIT1P23796 513 aa6.65□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C CHS3P29465 1165 aa6.65□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C VID28P40547 921 aa6.65□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C TFC6Q06339 672 aa6.65□□□□□ -1.34
RRP4YHR069C TOM1Q03280 3268 aa6.64□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C RNR2P09938 399 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C GAL2P13181 574 aa6.64□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C PFK2P16862 959 aaKnown RBP RIP-Chip data6.64□□□□□ -1.35not detected
RRP4YHR069C FBP26P32604 452 aa6.64□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C CST26P38226 397 aa6.64□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C TIF4631P39935 952 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C CSM2P40465 213 aa6.64□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C KRI1P42846 591 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C NIS1P53939 407 aa6.64□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C MYO5Q04439 1219 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C TUS1Q06412 1307 aa6.64□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C MYO1P08964 1928 aa6.64□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C PCT1P13259 424 aa6.63□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C MAK31P23059 88 aa6.63□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C NUD1P32336 851 aa6.63□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C TPS3P38426 1054 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C PTC2P39966 464 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C EST2Q06163 884 aa6.63□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C YPR015CQ12531 247 aa6.63□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C MATALPHA2P0CY08 210 aa6.62□□□□□ -1.35
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