RNA–Protein interactions for RNA: YER128W

VFA1, Transcript of Protein that interacts with Vps4p and has a role in vacuolar sorting, yeastyeast

Gene VFA1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1YER128W SSY1Q03770 852 aa4.9□□□□□ -1.63
VFA1YER128W TRE1Q08919 783 aa4.9□□□□□ -1.63
VFA1YER128W CMR1Q12510 522 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
VFA1YER128W COBP00163 385 aa4.89□□□□□ -1.63
VFA1YER128W RIM11P38615 370 aa4.89□□□□□ -1.63
VFA1YER128W ORC3P54790 616 aa4.89□□□□□ -1.63
VFA1YER128W ALG6Q12001 544 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
VFA1YER128W REI1P38344 393 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
VFA1YER128W UTP22P53254 1237 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
VFA1YER128W EAR1Q03212 550 aa4.88□□□□□ -1.63
VFA1YER128W MSH6Q03834 1242 aa4.88□□□□□ -1.63
VFA1YER128W PRO1P32264 428 aa4.87□□□□□ -1.63
VFA1YER128W UFD2P54860 961 aa4.87□□□□□ -1.63
VFA1YER128W YVC1Q12324 675 aa4.87□□□□□ -1.63
VFA1YER128W PRP5P21372 849 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
VFA1YER128W NFS1P25374 497 aa4.86□□□□□ -1.63
VFA1YER128W THI80P35202 319 aa4.86□□□□□ -1.63
VFA1YER128W RSC4Q02206 625 aa4.86□□□□□ -1.63
VFA1YER128W PRP6P19735 899 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
VFA1YER128W SMY2P32909 740 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
VFA1YER128W GLO3P38682 493 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
VFA1YER128W PEX7P39108 375 aa4.85□□□□□ -1.63
VFA1YER128W LPX1Q12405 387 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
VFA1YER128W DUR3P33413 735 aa4.84□□□□□ -1.63
VFA1YER128W ELA1P53861 379 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
VFA1YER128W NNK1P36003 928 aa4.83□□□□□ -1.64
VFA1YER128W PTC7P38797 343 aa4.83□□□□□ -1.64
VFA1YER128W AVO1Q08236 1176 aa4.83□□□□□ -1.64
VFA1YER128W FLR1P38124 548 aa4.82□□□□□ -1.64
VFA1YER128W AIM3P38266 947 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
VFA1YER128W QDR1P40475 563 aa4.82□□□□□ -1.64
VFA1YER128W YGR045CP53229 120 aa4.82□□□□□ -1.64
VFA1YER128W KAR5Q04746 504 aa4.82□□□□□ -1.64
VFA1YER128W GTS1P40956 396 aa4.81□□□□□ -1.64
VFA1YER128W MRPL22P53881 309 aa4.81□□□□□ -1.64
VFA1YER128W BSC2Q05611 235 aa4.81□□□□□ -1.64
VFA1YER128W HDA2Q06629 674 aa4.81□□□□□ -1.64
VFA1YER128W ARL1P38116 183 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
VFA1YER128W SAP155P43612 1002 aa4.8□□□□□ -1.64
VFA1YER128W YNL011CP53980 444 aa4.8□□□□□ -1.64
VFA1YER128W PMT7Q06644 662 aa4.8□□□□□ -1.64
VFA1YER128W FLP1P03870 423 aa4.79□□□□□ -1.64
VFA1YER128W EBP2P36049 427 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
VFA1YER128W CAB3P36076 571 aa4.79□□□□□ -1.64
VFA1YER128W RIM8P53179 542 aa4.79□□□□□ -1.64
VFA1YER128W TY1A-LR4P0C2I8 440 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
VFA1YER128W TY1A-DR6P0CX70 440 aa4.78□□□□□ -1.64
VFA1YER128W TY1A-ER1P0CX71 440 aa4.78□□□□□ -1.64
VFA1YER128W TY1A-LR2P0CX72 440 aa4.78□□□□□ -1.64
VFA1YER128W TY1A-PLP0CX73 440 aa4.78□□□□□ -1.64
VFA1YER128W TY1A-JR1P0CX74 440 aa4.78□□□□□ -1.64
VFA1YER128W TY1A-LR3P0CX75 440 aa4.78□□□□□ -1.64
VFA1YER128W TY1A-ML2P0CX76 440 aa4.78□□□□□ -1.64
VFA1YER128W NUT1P53114 1132 aa4.78□□□□□ -1.64
VFA1YER128W YAF9P53930 226 aa4.78□□□□□ -1.64
VFA1YER128W TPP1Q03796 238 aa4.78□□□□□ -1.64
VFA1YER128W PUS7Q08647 676 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
VFA1YER128W TY1A-GR1Q12085 440 aa4.78□□□□□ -1.64
VFA1YER128W YDL177CQ12257 170 aa4.78□□□□□ -1.64
VFA1YER128W TY1A-PR3Q6Q5H1 440 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
VFA1YER128W TY1A-OLQ92392 440 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
VFA1YER128W MCM5P29496 775 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
VFA1YER128W ETP1P38748 585 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
VFA1YER128W ATG1P53104 897 aa4.77□□□□□ -1.65
VFA1YER128W TRS120Q04183 1289 aa4.77□□□□□ -1.65
VFA1YER128W SUB2Q07478 446 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
VFA1YER128W YKL077WP36081 392 aa4.76□□□□□ -1.65
VFA1YER128W FOL2P51601 243 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
VFA1YER128W CDC55Q00362 526 aa4.76□□□□□ -1.65
VFA1YER128W ACF4P47129 309 aa4.75□□□□□ -1.65
VFA1YER128W RPL34AP87262 121 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
VFA1YER128W SOD2P00447 233 aa4.74□□□□□ -1.65
VFA1YER128W TOD6P34219 525 aa4.74□□□□□ -1.65
VFA1YER128W SHU2P38957 223 aa4.74□□□□□ -1.65
VFA1YER128W RVS167P39743 482 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
VFA1YER128W INP54Q08227 384 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
VFA1YER128W YHL012WP38709 493 aa4.73□□□□□ -1.65
VFA1YER128W NOP2P40991 618 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
VFA1YER128W SLS1P42900 643 aa4.73□□□□□ -1.65
VFA1YER128W MON1P53129 644 aa4.73□□□□□ -1.65
VFA1YER128W MNL2Q12205 849 aa4.73□□□□□ -1.65
VFA1YER128W RPS13P05756 151 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
VFA1YER128W EXO5P38289 585 aa4.72□□□□□ -1.65
VFA1YER128W YAR028WP39548 234 aa4.72□□□□□ -1.65
VFA1YER128W SNO2P53823 222 aa4.72□□□□□ -1.65
VFA1YER128W GIS1Q03833 894 aa4.72□□□□□ -1.65
VFA1YER128W YPL277CQ08989 487 aa4.72□□□□□ -1.65
VFA1YER128W NMD3P38861 518 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
VFA1YER128W MTR4P47047 1073 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
VFA1YER128W GSF2Q04697 403 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
VFA1YER128W YLR257WQ06146 321 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
VFA1YER128W SAM35P14693 329 aa4.7□□□□□ -1.66
VFA1YER128W RET1P22276 1149 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
VFA1YER128W MDL2P33311 773 aa4.7□□□□□ -1.66
VFA1YER128W HSE1P38753 452 aa4.7□□□□□ -1.66
VFA1YER128W NEM1P38757 446 aa4.7□□□□□ -1.66
VFA1YER128W HRK1Q08732 759 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
VFA1YER128W AIM26P32858 118 aa4.68□□□□□ -1.66
VFA1YER128W ATG14P38270 344 aa4.68□□□□□ -1.66
VFA1YER128W CLU1Q03690 1277 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
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