RNA–Protein interactions for RNA: YER009W

NTF2, Transcript of Nuclear envelope protein, yeastyeast

Gene NTF2, Length 378 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NTF2YER009W SVF1Q05515 481 aa4.72□□□□□ -1.65
NTF2YER009W SAC7P17121 654 aa4.71□□□□□ -1.66
NTF2YER009W SHU2P38957 223 aa4.71□□□□□ -1.66
NTF2YER009W POL5P39985 1022 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
NTF2YER009W PIC2P40035 300 aa4.71□□□□□ -1.66
NTF2YER009W UTP22P53254 1237 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
NTF2YER009W PEX13P80667 386 aa4.71□□□□□ -1.66
NTF2YER009W NOG1Q02892 647 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
NTF2YER009W MSH3P25336 1018 aa4.7□□□□□ -1.66
NTF2YER009W MDJ1P35191 511 aa4.7□□□□□ -1.66
NTF2YER009W YKL077WP36081 392 aa4.7□□□□□ -1.66
NTF2YER009W RRM3P38766 723 aa4.7□□□□□ -1.66
NTF2YER009W PEX28P38848 579 aa4.7□□□□□ -1.66
NTF2YER009W NSG2P53898 299 aa4.7□□□□□ -1.66
NTF2YER009W TDA6Q06466 467 aa4.7□□□□□ -1.66
NTF2YER009W YIG1Q08956 461 aa4.7□□□□□ -1.66
NTF2YER009W EXO5P38289 585 aa4.69□□□□□ -1.66
NTF2YER009W MCX1P38323 520 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
NTF2YER009W DSE4P53753 1117 aa4.69□□□□□ -1.66
NTF2YER009W ELG1Q12050 791 aa4.69□□□□□ -1.66
NTF2YER009W TY1A-LR4P0C2I8 440 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
NTF2YER009W TY1A-DR6P0CX70 440 aa4.68□□□□□ -1.66
NTF2YER009W TY1A-ER1P0CX71 440 aa4.68□□□□□ -1.66
NTF2YER009W TY1A-LR2P0CX72 440 aa4.68□□□□□ -1.66
NTF2YER009W TY1A-PLP0CX73 440 aa4.68□□□□□ -1.66
NTF2YER009W TY1A-JR1P0CX74 440 aa4.68□□□□□ -1.66
NTF2YER009W TY1A-LR3P0CX75 440 aa4.68□□□□□ -1.66
NTF2YER009W TY1A-ML2P0CX76 440 aa4.68□□□□□ -1.66
NTF2YER009W MET10P39692 1035 aa4.68□□□□□ -1.66
NTF2YER009W GCV1P48015 400 aa4.68□□□□□ -1.66
NTF2YER009W YGL140CP53120 1219 aa4.68□□□□□ -1.66
NTF2YER009W FAR11P53917 953 aa4.68□□□□□ -1.66
NTF2YER009W JIP5Q06214 492 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
NTF2YER009W TY1A-GR1Q12085 440 aa4.68□□□□□ -1.66
NTF2YER009W TY1A-PR3Q6Q5H1 440 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
NTF2YER009W TY1A-OLQ92392 440 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
NTF2YER009W ERS1P17261 260 aa4.67□□□□□ -1.66
NTF2YER009W NAP1P25293 417 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
NTF2YER009W PET112P33893 541 aa4.67□□□□□ -1.66
NTF2YER009W MAE1P36013 669 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
NTF2YER009W SLS1P42900 643 aa4.67□□□□□ -1.66
NTF2YER009W YMR074CQ04773 145 aa4.67□□□□□ -1.66
NTF2YER009W HEM13P11353 328 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
NTF2YER009W SEC23P15303 768 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
NTF2YER009W VMA4P22203 233 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
NTF2YER009W ARL1P38116 183 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
NTF2YER009W XKS1P42826 600 aa4.66□□□□□ -1.66
NTF2YER009W MTR4P47047 1073 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
NTF2YER009W BUD9P53226 547 aa4.66□□□□□ -1.66
NTF2YER009W MEC3Q02574 474 aa4.66□□□□□ -1.66
NTF2YER009W GAS5Q08193 484 aa4.66□□□□□ -1.66
NTF2YER009W YLL054CQ12244 843 aa4.66□□□□□ -1.66
NTF2YER009W TY1A-NL1Q12391 440 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
NTF2YER009W GCR1P07261 785 aa4.65□□□□□ -1.67
NTF2YER009W SFA1P32771 386 aa4.65□□□□□ -1.67
NTF2YER009W MNR2P35724 969 aa4.65□□□□□ -1.67
NTF2YER009W RDH54P38086 958 aa4.65□□□□□ -1.67
NTF2YER009W REI1P38344 393 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
NTF2YER009W NEM1P38757 446 aa4.65□□□□□ -1.67
NTF2YER009W CCT8P47079 568 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
NTF2YER009W KIP3P53086 805 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
NTF2YER009W TAF13P11747 167 aa4.64□□□□□ -1.67
NTF2YER009W MAD1P40957 749 aa4.64□□□□□ -1.67
NTF2YER009W PRY1P47032 299 aa4.64□□□□□ -1.67
NTF2YER009W YMR187CQ03236 431 aa4.64□□□□□ -1.67
NTF2YER009W UTP5Q04177 643 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
NTF2YER009W MRL1Q06815 381 aa4.64□□□□□ -1.67
NTF2YER009W YDR215CQ12240 137 aa4.64□□□□□ -1.67
NTF2YER009W YPR053CQ6Q5F3 151 aa4.64□□□□□ -1.67
NTF2YER009W AI3P03877 415 aa4.63□□□□□ -1.67
NTF2YER009W SCP160P06105 1222 aaKnown RBP RIP-Chip data4.63□□□□□ -1.67not detected
NTF2YER009W CLN2P20438 545 aa4.63□□□□□ -1.67
NTF2YER009W YCK2P23292 546 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
NTF2YER009W SLN1P39928 1220 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
NTF2YER009W VPS16Q03308 798 aa4.63□□□□□ -1.67
NTF2YER009W HDA2Q06629 674 aa4.63□□□□□ -1.67
NTF2YER009W ALG6Q12001 544 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
NTF2YER009W YOR223WQ12015 292 aa4.63□□□□□ -1.67
NTF2YER009W PIN2Q12057 282 aa4.63□□□□□ -1.67
NTF2YER009W REC8Q12188 680 aa4.63□□□□□ -1.67
NTF2YER009W CDC34P14682 295 aa4.62□□□□□ -1.67
NTF2YER009W RSC6P25632 483 aa4.62□□□□□ -1.67
NTF2YER009W GNP1P48813 663 aa4.62□□□□□ -1.67
NTF2YER009W NCE103P53615 221 aa4.62□□□□□ -1.67
NTF2YER009W MAG2Q06436 670 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
NTF2YER009W RTT10Q08924 1013 aa4.62□□□□□ -1.67
NTF2YER009W DUT1P33317 147 aa4.61□□□□□ -1.67
NTF2YER009W ADD66P36040 267 aa4.61□□□□□ -1.67
NTF2YER009W ATG14P38270 344 aa4.61□□□□□ -1.67
NTF2YER009W SPO74P45819 413 aa4.61□□□□□ -1.67
NTF2YER009W YGR045CP53229 120 aa4.61□□□□□ -1.67
NTF2YER009W SIW14P53965 281 aa4.61□□□□□ -1.67
NTF2YER009W DOT1Q04089 582 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
NTF2YER009W EST2Q06163 884 aa4.61□□□□□ -1.67
NTF2YER009W AVO1Q08236 1176 aa4.61□□□□□ -1.67
NTF2YER009W DED1P06634 604 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
NTF2YER009W RAD27P26793 382 aa4.6□□□□□ -1.67
NTF2YER009W TAT1P38085 619 aa4.6□□□□□ -1.67
NTF2YER009W SKN7P38889 622 aa4.6□□□□□ -1.67
NTF2YER009W YAR028WP39548 234 aa4.6□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 125 ms