RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641949.1

MFSD8-256, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 8, human

BASIC

Gene MFSD8, Length 1,640 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD8-256	ENST00000641949	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		10.39	□□□□□ -0.75
MFSD8-256	ENST00000641949	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		10.39	□□□□□ -0.75
MFSD8-256	ENST00000641949	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		10.39	□□□□□ -0.75
MFSD8-256	ENST00000641949	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		10.39	□□□□□ -0.75
MFSD8-256	ENST00000641949	DIP2A	Q14689	1571 aa		10.38	□□□□□ -0.75
MFSD8-256	ENST00000641949	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		10.38	□□□□□ -0.75
MFSD8-256	ENST00000641949	TOM1	O60784	492 aa		10.38	□□□□□ -0.75
MFSD8-256	ENST00000641949	PPL	O60437	1756 aa		10.38	□□□□□ -0.75
MFSD8-256	ENST00000641949	BHMG1	C9JSJ3	638 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
MFSD8-256	ENST00000641949	FBXO41	Q8TF61	875 aa		10.37	□□□□□ -0.75
MFSD8-256	ENST00000641949	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
MFSD8-256	ENST00000641949	PIK3C2G	O75747	1445 aa		10.37	□□□□□ -0.75
MFSD8-256	ENST00000641949	TMEM94	Q12767	1356 aa		10.37	□□□□□ -0.75
MFSD8-256	ENST00000641949	TONSL	Q96HA7	1378 aa		10.37	□□□□□ -0.75
MFSD8-256	ENST00000641949	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		10.37	□□□□□ -0.75
MFSD8-256	ENST00000641949	HCST	Q9UBK5	93 aa		10.36	□□□□□ -0.75
MFSD8-256	ENST00000641949	ALK	Q9UM73	1620 aa		10.36	□□□□□ -0.75
MFSD8-256	ENST00000641949	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		10.36	□□□□□ -0.75
MFSD8-256	ENST00000641949	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
MFSD8-256	ENST00000641949	MYOM2	P54296	1465 aa		10.36	□□□□□ -0.75
MFSD8-256	ENST00000641949	COL9A1	P20849	921 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MFSD8-256	ENST00000641949	CFAP44	Q96MT7	982 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MFSD8-256	ENST00000641949	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MFSD8-256	ENST00000641949	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
MFSD8-256	ENST00000641949	PTPRU	Q92729	1446 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MFSD8-256	ENST00000641949	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
MFSD8-256	ENST00000641949	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MFSD8-256	ENST00000641949	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MFSD8-256	ENST00000641949	ATF3	P18847	181 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MFSD8-256	ENST00000641949	PIP4K2B	P78356	416 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MFSD8-256	ENST00000641949	MSH6	P52701	1360 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MFSD8-256	ENST00000641949	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MFSD8-256	ENST00000641949	PHF14	O94880	888 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MFSD8-256	ENST00000641949	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
MFSD8-256	ENST00000641949	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MFSD8-256	ENST00000641949	IFT172	Q9UG01	1749 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MFSD8-256	ENST00000641949	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MFSD8-256	ENST00000641949	POGK	Q9P215	609 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MFSD8-256	ENST00000641949	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MFSD8-256	ENST00000641949	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MFSD8-256	ENST00000641949		Q6ZNB5	142 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MFSD8-256	ENST00000641949	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MFSD8-256	ENST00000641949	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MFSD8-256	ENST00000641949	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
MFSD8-256	ENST00000641949	ABCC11	Q96J66	1382 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MFSD8-256	ENST00000641949	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
MFSD8-256	ENST00000641949	PROX2	Q3B8N5	592 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MFSD8-256	ENST00000641949	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MFSD8-256	ENST00000641949	SIRT1	Q96EB6	747 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MFSD8-256	ENST00000641949	SLAIN2	Q9P270	581 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MFSD8-256	ENST00000641949	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MFSD8-256	ENST00000641949	NWD1	Q149M9	1564 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MFSD8-256	ENST00000641949	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MFSD8-256	ENST00000641949	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	10.3	□□□□□ -0.76
MFSD8-256	ENST00000641949	PRAM1	Q96QH2	718 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MFSD8-256	ENST00000641949	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MFSD8-256	ENST00000641949	DDX12P	Q92771	950 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MFSD8-256	ENST00000641949	FBXW7	Q969H0	707 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MFSD8-256	ENST00000641949	PTCH1	Q13635	1447 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MFSD8-256	ENST00000641949	LAMC1	P11047	1609 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MFSD8-256	ENST00000641949	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MFSD8-256	ENST00000641949	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.76
MFSD8-256	ENST00000641949	PTPN5	P54829	565 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MFSD8-256	ENST00000641949	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
MFSD8-256	ENST00000641949	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
MFSD8-256	ENST00000641949	TECPR2	O15040	1411 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MFSD8-256	ENST00000641949	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MFSD8-256	ENST00000641949	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MFSD8-256	ENST00000641949	EPAS1	Q99814	870 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MFSD8-256	ENST00000641949	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MFSD8-256	ENST00000641949	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MFSD8-256	ENST00000641949	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
MFSD8-256	ENST00000641949	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MFSD8-256	ENST00000641949	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MFSD8-256	ENST00000641949	NUTM2F	A1L443	756 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MFSD8-256	ENST00000641949	PDIA6	Q15084	440 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MFSD8-256	ENST00000641949	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
MFSD8-256	ENST00000641949	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MFSD8-256	ENST00000641949	ADGRB1	O14514	1584 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MFSD8-256	ENST00000641949	DCC	P43146	1447 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MFSD8-256	ENST00000641949	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
MFSD8-256	ENST00000641949	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
MFSD8-256	ENST00000641949	E2F4	Q16254	413 aa		10.23	□□□□□ -0.77
MFSD8-256	ENST00000641949	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		10.23	□□□□□ -0.77
MFSD8-256	ENST00000641949	WNT2B	Q93097	391 aa		10.23	□□□□□ -0.77
MFSD8-256	ENST00000641949	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		10.23	□□□□□ -0.77
MFSD8-256	ENST00000641949	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
MFSD8-256	ENST00000641949	HSPA1L	P34931	641 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MFSD8-256	ENST00000641949	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
MFSD8-256	ENST00000641949	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
MFSD8-256	ENST00000641949	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MFSD8-256	ENST00000641949	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MFSD8-256	ENST00000641949	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
MFSD8-256	ENST00000641949	DLC1	Q96QB1	1528 aa		10.21	□□□□□ -0.77
MFSD8-256	ENST00000641949	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.78
MFSD8-256	ENST00000641949	BRINP3	Q76B58	766 aa		10.21	□□□□□ -0.78
MFSD8-256	ENST00000641949	ORAI2	Q96SN7	254 aa		10.21	□□□□□ -0.78
MFSD8-256	ENST00000641949	NBPF3	Q9H094	633 aa		10.21	□□□□□ -0.78
MFSD8-256	ENST00000641949	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		10.21	□□□□□ -0.78
MFSD8-256	ENST00000641949	NBR1	Q14596	966 aa		10.2	□□□□□ -0.78

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