RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636483.1

SPTAN1-232, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-232ENST00000636483 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP4□□□□□ -1.77
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SPTAN1-232ENST00000636483 SCNN1AP37088 669 aa3.99□□□□□ -1.77
SPTAN1-232ENST00000636483 RAB15P59190 212 aa3.99□□□□□ -1.77
SPTAN1-232ENST00000636483 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
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SPTAN1-232ENST00000636483 PDE4CQ08493 712 aa3.99□□□□□ -1.77
SPTAN1-232ENST00000636483 PTK7Q13308 1070 aa3.99□□□□□ -1.77
SPTAN1-232ENST00000636483 OXLD1Q5BKU9 147 aa3.99□□□□□ -1.77
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SPTAN1-232ENST00000636483 GAS2L2Q8NHY3 880 aa3.98□□□□□ -1.77
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SPTAN1-232ENST00000636483 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
SPTAN1-232ENST00000636483 SLC10A4Q96EP9 437 aa3.95□□□□□ -1.78
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SPTAN1-232ENST00000636483 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa3.95□□□□□ -1.78
SPTAN1-232ENST00000636483 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
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SPTAN1-232ENST00000636483 TMCO4Q5TGY1 634 aa3.94□□□□□ -1.78
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SPTAN1-232ENST00000636483 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
SPTAN1-232ENST00000636483 CCDC102BQ68D86 513 aa3.94□□□□□ -1.78
SPTAN1-232ENST00000636483 LARGE2Q8N3Y3 721 aa3.94□□□□□ -1.78
SPTAN1-232ENST00000636483 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP3.94□□□□□ -1.78
SPTAN1-232ENST00000636483 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
SPTAN1-232ENST00000636483 HINFPQ9BQA5 517 aa3.94□□□□□ -1.78
SPTAN1-232ENST00000636483 SIAH2O43255 324 aa3.93□□□□□ -1.78
SPTAN1-232ENST00000636483 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
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