RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630499.2

SRRM2-231, Transcript of serine/arginine repetitive matrix 2, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene SRRM2, Length 1,207 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SRRM2-231	ENST00000630499	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	31.91	■■■□□ 2.7
SRRM2-231	ENST00000630499	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		31.91	■■■□□ 2.7
SRRM2-231	ENST00000630499	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		31.91	■■■□□ 2.7
SRRM2-231	ENST00000630499	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		31.89	■■■□□ 2.7
SRRM2-231	ENST00000630499	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		31.89	■■■□□ 2.7
SRRM2-231	ENST00000630499	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		31.89	■■■□□ 2.7
SRRM2-231	ENST00000630499	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		31.88	■■■□□ 2.69
SRRM2-231	ENST00000630499	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		31.88	■■■□□ 2.69
SRRM2-231	ENST00000630499	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		31.88	■■■□□ 2.69
SRRM2-231	ENST00000630499	ABCC6	O95255	1503 aa		31.87	■■■□□ 2.69
SRRM2-231	ENST00000630499	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		31.85	■■■□□ 2.69
SRRM2-231	ENST00000630499	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	31.83	■■■□□ 2.69
SRRM2-231	ENST00000630499	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	31.83	■■■□□ 2.69
SRRM2-231	ENST00000630499	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SRRM2-231	ENST00000630499	BCL9	O00512	1426 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SRRM2-231	ENST00000630499	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		31.82	■■■□□ 2.68
SRRM2-231	ENST00000630499	USP31	Q70CQ4	1352 aa		31.81	■■■□□ 2.68
SRRM2-231	ENST00000630499	DDB1	Q16531	1140 aa		31.79	■■■□□ 2.68
SRRM2-231	ENST00000630499	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		31.78	■■■□□ 2.68
SRRM2-231	ENST00000630499	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		31.76	■■■□□ 2.67
SRRM2-231	ENST00000630499	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	31.76	■■■□□ 2.67
SRRM2-231	ENST00000630499	LTN1	O94822	1766 aa		31.76	■■■□□ 2.67
SRRM2-231	ENST00000630499	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	31.75	■■■□□ 2.67
SRRM2-231	ENST00000630499	PLSCR1	O15162	318 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SRRM2-231	ENST00000630499	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SRRM2-231	ENST00000630499	SOX12	O15370	315 aa		31.73	■■■□□ 2.67
SRRM2-231	ENST00000630499	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	31.71	■■■□□ 2.67
SRRM2-231	ENST00000630499	NBPF14	Q5TI25	921 aa		31.7	■■■□□ 2.67
SRRM2-231	ENST00000630499	CASZ1	Q86V15	1759 aa		31.7	■■■□□ 2.67
SRRM2-231	ENST00000630499	CCDC7	Q96M83	1385 aa		31.69	■■■□□ 2.66
SRRM2-231	ENST00000630499	NME9	Q86XW9	330 aa		31.69	■■■□□ 2.66
SRRM2-231	ENST00000630499	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	31.68	■■■□□ 2.66
SRRM2-231	ENST00000630499	TNS2	Q63HR2	1409 aa		31.67	■■■□□ 2.66
SRRM2-231	ENST00000630499	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	31.67	■■■□□ 2.66
SRRM2-231	ENST00000630499	PROM2	Q8N271	834 aa		31.67	■■■□□ 2.66
SRRM2-231	ENST00000630499	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	31.66	■■■□□ 2.66
SRRM2-231	ENST00000630499	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		31.66	■■■□□ 2.66
SRRM2-231	ENST00000630499	ERBB3	P21860	1342 aa		31.65	■■■□□ 2.66
SRRM2-231	ENST00000630499		A0A1W2PP64	1363 aa		31.65	■■■□□ 2.66
SRRM2-231	ENST00000630499	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		31.64	■■■□□ 2.66
SRRM2-231	ENST00000630499	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	31.64	■■■□□ 2.66
SRRM2-231	ENST00000630499	TONSL	Q96HA7	1378 aa		31.64	■■■□□ 2.66
SRRM2-231	ENST00000630499	NHS	Q6T4R5	1651 aa		31.64	■■■□□ 2.65
SRRM2-231	ENST00000630499	TESK2	Q96S53	571 aa		31.62	■■■□□ 2.65
SRRM2-231	ENST00000630499	EXOC5	O00471	708 aa		31.59	■■■□□ 2.65
SRRM2-231	ENST00000630499	TMC1	Q8TDI8	760 aa		31.59	■■■□□ 2.65
SRRM2-231	ENST00000630499	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	31.58	■■■□□ 2.65
SRRM2-231	ENST00000630499	KCNQ2	O43526	872 aa		31.56	■■■□□ 2.64
SRRM2-231	ENST00000630499	SPON1	Q9HCB6	807 aa		31.55	■■■□□ 2.64
SRRM2-231	ENST00000630499	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		31.55	■■■□□ 2.64
SRRM2-231	ENST00000630499	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	31.54	■■■□□ 2.64
SRRM2-231	ENST00000630499	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		31.53	■■■□□ 2.64
SRRM2-231	ENST00000630499	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		31.52	■■■□□ 2.64
SRRM2-231	ENST00000630499	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	31.52	■■■□□ 2.64
SRRM2-231	ENST00000630499	PAPPA	Q13219	1627 aa		31.52	■■■□□ 2.64
SRRM2-231	ENST00000630499	TXNRD1	Q16881	649 aa		31.51	■■■□□ 2.63
SRRM2-231	ENST00000630499	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		31.51	■■■□□ 2.63
SRRM2-231	ENST00000630499	BTAF1	O14981	1849 aa		31.51	■■■□□ 2.63
SRRM2-231	ENST00000630499	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		31.5	■■■□□ 2.63
SRRM2-231	ENST00000630499	IL2RB	P14784	551 aa		31.49	■■■□□ 2.63
SRRM2-231	ENST00000630499	IP6K1	Q92551	441 aa		31.47	■■■□□ 2.63
SRRM2-231	ENST00000630499	MYOM1	P52179	1685 aa		31.45	■■■□□ 2.63
SRRM2-231	ENST00000630499	UTRN	P46939	3433 aa		31.45	■■■□□ 2.62
SRRM2-231	ENST00000630499	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		31.43	■■■□□ 2.62
SRRM2-231	ENST00000630499	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		31.43	■■■□□ 2.62
SRRM2-231	ENST00000630499	PTGER2	P43116	358 aa		31.42	■■■□□ 2.62
SRRM2-231	ENST00000630499	SLC15A2	Q16348	729 aa		31.42	■■■□□ 2.62
SRRM2-231	ENST00000630499	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		31.41	■■■□□ 2.62
SRRM2-231	ENST00000630499	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		31.41	■■■□□ 2.62
SRRM2-231	ENST00000630499	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		31.4	■■■□□ 2.62
SRRM2-231	ENST00000630499	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	31.39	■■■□□ 2.62
SRRM2-231	ENST00000630499	SLC24A1	O60721	1099 aa		31.37	■■■□□ 2.61
SRRM2-231	ENST00000630499	STK32B	Q9NY57	414 aa		31.37	■■■□□ 2.61
SRRM2-231	ENST00000630499	ZBTB7A	O95365	584 aa		31.36	■■■□□ 2.61
SRRM2-231	ENST00000630499	FBLN1	P23142	703 aa		31.36	■■■□□ 2.61
SRRM2-231	ENST00000630499	HOXC9	P31274	260 aa		31.36	■■■□□ 2.61
SRRM2-231	ENST00000630499	COG3	Q96JB2	828 aa		31.35	■■■□□ 2.61
SRRM2-231	ENST00000630499	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		31.34	■■■□□ 2.61
SRRM2-231	ENST00000630499	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		31.34	■■■□□ 2.61
SRRM2-231	ENST00000630499	USP47	Q96K76	1375 aa		31.33	■■■□□ 2.61
SRRM2-231	ENST00000630499	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		31.33	■■■□□ 2.61
SRRM2-231	ENST00000630499	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		31.32	■■■□□ 2.61
SRRM2-231	ENST00000630499	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		31.32	■■■□□ 2.6
SRRM2-231	ENST00000630499	RTL1	A6NKG5	1358 aa		31.31	■■■□□ 2.6
SRRM2-231	ENST00000630499	MEGF6	O75095	1541 aa		31.31	■■■□□ 2.6
SRRM2-231	ENST00000630499	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	31.3	■■■□□ 2.6
SRRM2-231	ENST00000630499	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		31.3	■■■□□ 2.6
SRRM2-231	ENST00000630499	LY75	O60449	1722 aa		31.29	■■■□□ 2.6
SRRM2-231	ENST00000630499	FYB1	O15117	783 aa		31.29	■■■□□ 2.6
SRRM2-231	ENST00000630499	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	31.29	■■■□□ 2.6
SRRM2-231	ENST00000630499	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		31.29	■■■□□ 2.6
SRRM2-231	ENST00000630499	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	31.28	■■■□□ 2.6
SRRM2-231	ENST00000630499	ZNF827	Q17R98	1081 aa		31.28	■■■□□ 2.6
SRRM2-231	ENST00000630499	MTFR1L	Q9H019	292 aa		31.28	■■■□□ 2.6
SRRM2-231	ENST00000630499	NSD2	O96028	1365 aa		31.28	■■■□□ 2.6
SRRM2-231	ENST00000630499	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		31.27	■■■□□ 2.6
SRRM2-231	ENST00000630499	TMF1	P82094	1093 aa		31.25	■■■□□ 2.59
SRRM2-231	ENST00000630499	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	31.25	■■■□□ 2.59
SRRM2-231	ENST00000630499	YY1	P25490	414 aa		31.24	■■■□□ 2.59
SRRM2-231	ENST00000630499	AMPH	P49418	695 aa		31.24	■■■□□ 2.59

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