RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596378.1

SRRM1-222, Transcript of serine and arginine repetitive matrix 1, human

TSL 1 (best)

Gene SRRM1, Length 2,314 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SRRM1-222	ENST00000596378	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		28.94	■■■□□ 2.22
SRRM1-222	ENST00000596378	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		28.94	■■■□□ 2.22
SRRM1-222	ENST00000596378	SEC24B	O95487	1268 aa		28.94	■■■□□ 2.22
SRRM1-222	ENST00000596378	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		28.94	■■■□□ 2.22
SRRM1-222	ENST00000596378	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		28.93	■■■□□ 2.22
SRRM1-222	ENST00000596378	KIF16B	Q96L93	1317 aa		28.92	■■■□□ 2.22
SRRM1-222	ENST00000596378	TSPYL6	Q8N831	410 aa		28.92	■■■□□ 2.22
SRRM1-222	ENST00000596378	FAM83G	A6ND36	823 aa		28.91	■■■□□ 2.22
SRRM1-222	ENST00000596378	EID1	Q9Y6B2	187 aa		28.91	■■■□□ 2.22
SRRM1-222	ENST00000596378	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		28.91	■■■□□ 2.22
SRRM1-222	ENST00000596378	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	28.9	■■■□□ 2.22
SRRM1-222	ENST00000596378	USP19	O94966	1318 aa		28.9	■■■□□ 2.22
SRRM1-222	ENST00000596378	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		28.89	■■■□□ 2.22
SRRM1-222	ENST00000596378	MBIP	Q9NS73	344 aa		28.89	■■■□□ 2.22
SRRM1-222	ENST00000596378	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		28.89	■■■□□ 2.22
SRRM1-222	ENST00000596378	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
SRRM1-222	ENST00000596378	SOX12	O15370	315 aa		28.88	■■■□□ 2.21
SRRM1-222	ENST00000596378	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
SRRM1-222	ENST00000596378	DCTN1	Q14203	1278 aa		28.88	■■■□□ 2.21
SRRM1-222	ENST00000596378	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		28.87	■■■□□ 2.21
SRRM1-222	ENST00000596378	VAMP4	O75379	141 aa		28.87	■■■□□ 2.21
SRRM1-222	ENST00000596378	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
SRRM1-222	ENST00000596378	IFT57	Q9NWB7	429 aa		28.87	■■■□□ 2.21
SRRM1-222	ENST00000596378	USP6	P35125	1406 aa		28.87	■■■□□ 2.21
SRRM1-222	ENST00000596378	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
SRRM1-222	ENST00000596378	GNAI1	P63096	354 aa		28.87	■■■□□ 2.21
SRRM1-222	ENST00000596378	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		28.86	■■■□□ 2.21
SRRM1-222	ENST00000596378	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		28.86	■■■□□ 2.21
SRRM1-222	ENST00000596378	ZNF853	P0CG23	659 aa		28.86	■■■□□ 2.21
SRRM1-222	ENST00000596378	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
SRRM1-222	ENST00000596378	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		28.85	■■■□□ 2.21
SRRM1-222	ENST00000596378	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		28.85	■■■□□ 2.21
SRRM1-222	ENST00000596378	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
SRRM1-222	ENST00000596378	SLIT1	O75093	1534 aa		28.84	■■■□□ 2.21
SRRM1-222	ENST00000596378	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
SRRM1-222	ENST00000596378	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		28.83	■■■□□ 2.21
SRRM1-222	ENST00000596378	PEAK1	Q9H792	1746 aa		28.83	■■■□□ 2.21
SRRM1-222	ENST00000596378	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		28.83	■■■□□ 2.21
SRRM1-222	ENST00000596378	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		28.82	■■■□□ 2.2
SRRM1-222	ENST00000596378	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
SRRM1-222	ENST00000596378	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		28.81	■■■□□ 2.2
SRRM1-222	ENST00000596378	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		28.8	■■■□□ 2.2
SRRM1-222	ENST00000596378	ZNF428	Q96B54	188 aa		28.8	■■■□□ 2.2
SRRM1-222	ENST00000596378	CFAP44	Q96MT7	982 aa		28.8	■■■□□ 2.2
SRRM1-222	ENST00000596378	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
SRRM1-222	ENST00000596378	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		28.8	■■■□□ 2.2
SRRM1-222	ENST00000596378	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
SRRM1-222	ENST00000596378	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
SRRM1-222	ENST00000596378	TBX22	Q9Y458	520 aa		28.78	■■■□□ 2.2
SRRM1-222	ENST00000596378	SSH2	Q76I76	1423 aa		28.77	■■■□□ 2.2
SRRM1-222	ENST00000596378	DIP2A	Q14689	1571 aa		28.75	■■■□□ 2.19
SRRM1-222	ENST00000596378	PTCH1	Q13635	1447 aa		28.75	■■■□□ 2.19
SRRM1-222	ENST00000596378	SMC5	Q8IY18	1101 aa		28.75	■■■□□ 2.19
SRRM1-222	ENST00000596378	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	28.74	■■■□□ 2.19
SRRM1-222	ENST00000596378	USP31	Q70CQ4	1352 aa		28.74	■■■□□ 2.19
SRRM1-222	ENST00000596378	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		28.73	■■■□□ 2.19
SRRM1-222	ENST00000596378	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	28.72	■■■□□ 2.19
SRRM1-222	ENST00000596378	MCM10	Q7L590	875 aa		28.72	■■■□□ 2.19
SRRM1-222	ENST00000596378	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		28.71	■■■□□ 2.19
SRRM1-222	ENST00000596378	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	28.71	■■■□□ 2.19
SRRM1-222	ENST00000596378	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		28.71	■■■□□ 2.19
SRRM1-222	ENST00000596378	KRT24	Q2M2I5	525 aa		28.7	■■■□□ 2.19
SRRM1-222	ENST00000596378	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		28.7	■■■□□ 2.19
SRRM1-222	ENST00000596378	PIK3R4	Q99570	1358 aa		28.68	■■■□□ 2.18
SRRM1-222	ENST00000596378	ABCC4	O15439	1325 aa		28.67	■■■□□ 2.18
SRRM1-222	ENST00000596378	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		28.67	■■■□□ 2.18
SRRM1-222	ENST00000596378	KCNA6	P17658	529 aa		28.67	■■■□□ 2.18
SRRM1-222	ENST00000596378	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	28.67	■■■□□ 2.18
SRRM1-222	ENST00000596378	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	28.67	■■■□□ 2.18
SRRM1-222	ENST00000596378	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		28.67	■■■□□ 2.18
SRRM1-222	ENST00000596378	LNPK	Q9C0E8	428 aa		28.65	■■■□□ 2.18
SRRM1-222	ENST00000596378	PIK3C2A	O00443	1686 aa		28.65	■■■□□ 2.18
SRRM1-222	ENST00000596378	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	28.65	■■■□□ 2.18
SRRM1-222	ENST00000596378	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		28.65	■■■□□ 2.18
SRRM1-222	ENST00000596378	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	28.65	■■■□□ 2.18
SRRM1-222	ENST00000596378	USP35	Q9P2H5	1018 aa		28.65	■■■□□ 2.18
SRRM1-222	ENST00000596378	NUCB1	Q02818	461 aa		28.64	■■■□□ 2.18
SRRM1-222	ENST00000596378	NFKBIB	Q15653	356 aa		28.64	■■■□□ 2.18
SRRM1-222	ENST00000596378	FOXO3	O43524	673 aa		28.63	■■■□□ 2.17
SRRM1-222	ENST00000596378	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		28.63	■■■□□ 2.17
SRRM1-222	ENST00000596378	CHL1	O00533	1208 aa		28.61	■■■□□ 2.17
SRRM1-222	ENST00000596378	FLT4	P35916	1363 aa		28.61	■■■□□ 2.17
SRRM1-222	ENST00000596378	SBNO1	A3KN83	1393 aa		28.6	■■■□□ 2.17
SRRM1-222	ENST00000596378	AMPH	P49418	695 aa		28.6	■■■□□ 2.17
SRRM1-222	ENST00000596378	ARHGEF10	O15013	1369 aa		28.6	■■■□□ 2.17
SRRM1-222	ENST00000596378	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		28.59	■■■□□ 2.17
SRRM1-222	ENST00000596378	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		28.59	■■■□□ 2.17
SRRM1-222	ENST00000596378	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	28.59	■■■□□ 2.17
SRRM1-222	ENST00000596378	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		28.59	■■■□□ 2.17
SRRM1-222	ENST00000596378	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	28.59	■■■□□ 2.17
SRRM1-222	ENST00000596378	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	28.58	■■■□□ 2.17
SRRM1-222	ENST00000596378	NLRP6	P59044	892 aa		28.58	■■■□□ 2.17
SRRM1-222	ENST00000596378	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	28.58	■■■□□ 2.17
SRRM1-222	ENST00000596378	EYA1	Q99502	592 aa		28.57	■■■□□ 2.16
SRRM1-222	ENST00000596378	CRB1	P82279	1406 aa		28.56	■■■□□ 2.16
SRRM1-222	ENST00000596378	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		28.56	■■■□□ 2.16
SRRM1-222	ENST00000596378	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	28.55	■■■□□ 2.16
SRRM1-222	ENST00000596378	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	28.55	■■■□□ 2.16
SRRM1-222	ENST00000596378	BECN1	Q14457	450 aa		28.55	■■■□□ 2.16
SRRM1-222	ENST00000596378	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		28.53	■■■□□ 2.16

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