RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592099.5

PTPRS-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRS, Length 4,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-210ENST00000592099 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-210ENST00000592099 NUP160Q12769 1436 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-210ENST00000592099 HIP1O00291 1037 aa14.58□□□□□ -0.07
PTPRS-210ENST00000592099 CCT4P50991 539 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-210ENST00000592099 ZNF428Q96B54 188 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-210ENST00000592099 SAMD9Q5K651 1589 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-210ENST00000592099 RAD21O60216 631 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-210ENST00000592099 SASS6Q6UVJ0 657 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-210ENST00000592099 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-210ENST00000592099 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-210ENST00000592099 ASXL2Q76L83 1435 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRS-210ENST00000592099 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRS-210ENST00000592099 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRS-210ENST00000592099 FBLN1P23142 703 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRS-210ENST00000592099 RABEP1Q15276 862 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRS-210ENST00000592099 CHD1LQ86WJ1 897 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRS-210ENST00000592099 RSPH6AQ9H0K4 717 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRS-210ENST00000592099 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRS-210ENST00000592099 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRS-210ENST00000592099 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRS-210ENST00000592099 WASLO00401 505 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRS-210ENST00000592099 NEK4P51957 841 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRS-210ENST00000592099 SHANK2Q9UPX8 1470 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRS-210ENST00000592099 PDCP20941 246 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRS-210ENST00000592099 MCM10Q7L590 875 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRS-210ENST00000592099 MIS18AQ9NYP9 233 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRS-210ENST00000592099 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRS-210ENST00000592099 ANKLE2Q86XL3 938 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRS-210ENST00000592099 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRS-210ENST00000592099 TEX14Q8IWB6 1497 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRS-210ENST00000592099 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRS-210ENST00000592099 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRS-210ENST00000592099 XBP1P17861 261 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-210ENST00000592099 CCDC70Q6NSX1 233 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-210ENST00000592099 KIF6Q6ZMV9 814 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-210ENST00000592099 MBD3O95983 291 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-210ENST00000592099 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-210ENST00000592099 POGZQ7Z3K3 1410 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-210ENST00000592099 A2MP01023 1474 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-210ENST00000592099 SART3Q15020 963 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-210ENST00000592099 FBXW7Q969H0 707 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-210ENST00000592099 TRIM27P14373 513 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-210ENST00000592099 PDE4CQ08493 712 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-210ENST00000592099 CCDC27Q2M243 656 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-210ENST00000592099 CARD14Q9BXL6 1004 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-210ENST00000592099 ABCC11Q96J66 1382 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 BRMS1Q9HCU9 246 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 FYB1O15117 783 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 MRE11P49959 708 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 SPG7Q9UQ90 795 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 SDF4Q9BRK5 362 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 LRRCC1Q9C099 1032 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 ADGRL2O95490 1459 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 WDR7Q9Y4E6 1490 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 IGHDP01880 384 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 FOSBP53539 338 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 ZNF592Q92610 1267 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 GPS2Q13227 327 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 HOMER1Q86YM7 354 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 STRN4Q9NRL3 753 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 PBRM1Q86U86 1689 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 CABP4P57796 275 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 TRAK2O60296 914 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 IFT57Q9NWB7 429 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 NSD2O96028 1365 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 ALDH1L2Q3SY69 923 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 CCDC158Q5M9N0 1113 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 FAM177BA6PVY3 158 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 PRDM11Q9NQV5 511 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 CNNM1Q9NRU3 951 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 NASPP49321 788 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 FAM43AQ8N2R8 423 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 FAM83GA6ND36 823 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 OLFM4Q6UX06 510 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRS-210ENST00000592099 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP14.46□□□□□ -0.11e-6■■■■□ 21
PTPRS-210ENST00000592099 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa14.46□□□□□ -0.1
PTPRS-210ENST00000592099 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa14.46□□□□□ -0.1
PTPRS-210ENST00000592099 GNAT3A8MTJ3 354 aa14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms