RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589550.1

PIK3C3-211, Transcript of phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

TSL 3

Gene PIK3C3, Length 597 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3-211ENST00000589550 ANKMY2Q8IV38 441 aa8.65□□□□□ -1.02
PIK3C3-211ENST00000589550 PLPP7Q8NBV4 271 aa8.65□□□□□ -1.02
PIK3C3-211ENST00000589550 THAP11Q96EK4 314 aa8.65□□□□□ -1.02
PIK3C3-211ENST00000589550 SOWAHDA6NJG2 315 aa8.64□□□□□ -1.03
PIK3C3-211ENST00000589550 CCNYL3P0C7X3 344 aa8.64□□□□□ -1.03
PIK3C3-211ENST00000589550 MSS51Q4VC12 460 aa8.64□□□□□ -1.03
PIK3C3-211ENST00000589550 SCUBE3Q8IX30 993 aa8.64□□□□□ -1.03
PIK3C3-211ENST00000589550 PHTF2Q8N3S3 785 aa8.64□□□□□ -1.03
PIK3C3-211ENST00000589550 CHIC2Q9UKJ5 165 aa8.64□□□□□ -1.03
PIK3C3-211ENST00000589550 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa8.64□□□□□ -1.03
PIK3C3-211ENST00000589550 ATP2B4P23634 1241 aa8.63□□□□□ -1.03
PIK3C3-211ENST00000589550 ATP1A2P50993 1020 aa8.63□□□□□ -1.03
PIK3C3-211ENST00000589550 STAC3Q96MF2 364 aa8.63□□□□□ -1.03
PIK3C3-211ENST00000589550 PPP4CP60510 307 aa8.62□□□□□ -1.03
PIK3C3-211ENST00000589550 KCNH2Q12809 1159 aa8.62□□□□□ -1.03
PIK3C3-211ENST00000589550 IFFO2Q5TF58 517 aa8.62□□□□□ -1.03
PIK3C3-211ENST00000589550 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PIK3C3-211ENST00000589550 C1orf216Q8TAB5 229 aa8.62□□□□□ -1.03
PIK3C3-211ENST00000589550 EVA1BQ9NVM1 165 aa8.62□□□□□ -1.03
PIK3C3-211ENST00000589550 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa8.62□□□□□ -1.03
PIK3C3-211ENST00000589550 IGSF3O75054 1194 aa8.61□□□□□ -1.03
PIK3C3-211ENST00000589550 DXOO77932 396 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PIK3C3-211ENST00000589550 OGFOD1Q8N543 542 aa8.61□□□□□ -1.03
PIK3C3-211ENST00000589550 ANKK1Q8NFD2 765 aa8.61□□□□□ -1.03
PIK3C3-211ENST00000589550 NUDT12Q9BQG2 462 aa8.61□□□□□ -1.03
PIK3C3-211ENST00000589550 SLAIN2Q9P270 581 aa8.61□□□□□ -1.03
PIK3C3-211ENST00000589550 UNCXA6NJT0 531 aa8.6□□□□□ -1.03
PIK3C3-211ENST00000589550 DPYDQ12882 1025 aa8.6□□□□□ -1.03
PIK3C3-211ENST00000589550 LARGE2Q8N3Y3 721 aa8.6□□□□□ -1.03
PIK3C3-211ENST00000589550 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PIK3C3-211ENST00000589550 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PIK3C3-211ENST00000589550 NOD1Q9Y239 953 aa8.6□□□□□ -1.03
PIK3C3-211ENST00000589550 MMP16P51512 607 aa8.59□□□□□ -1.03
PIK3C3-211ENST00000589550 APLP1P51693 650 aa8.59□□□□□ -1.03
PIK3C3-211ENST00000589550 TRAF7Q6Q0C0 670 aa8.59□□□□□ -1.03
PIK3C3-211ENST00000589550 OCSTAMPQ9BR26 566 aa8.59□□□□□ -1.03
PIK3C3-211ENST00000589550 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa8.59□□□□□ -1.03
PIK3C3-211ENST00000589550 SOWAHBA6NEL2 793 aa8.58□□□□□ -1.04
PIK3C3-211ENST00000589550 MARSP56192 900 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PIK3C3-211ENST00000589550 SIX5Q8N196 739 aa8.58□□□□□ -1.04
PIK3C3-211ENST00000589550 ADAM32Q8TC27 787 aa8.58□□□□□ -1.04
PIK3C3-211ENST00000589550 SIRT1Q96EB6 747 aa8.58□□□□□ -1.04
PIK3C3-211ENST00000589550 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PIK3C3-211ENST00000589550 HPS5Q9UPZ3 1129 aa8.58□□□□□ -1.04
PIK3C3-211ENST00000589550 SERPINB4P48594 390 aa8.57□□□□□ -1.04
PIK3C3-211ENST00000589550 CLDN10P78369 228 aa8.57□□□□□ -1.04
PIK3C3-211ENST00000589550 ZBTB33Q86T24 672 aa8.57□□□□□ -1.04
PIK3C3-211ENST00000589550 EGFL7Q9UHF1 273 aa8.57□□□□□ -1.04
PIK3C3-211ENST00000589550 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PIK3C3-211ENST00000589550 GOLGA8CPA6NN73 597 aa8.56□□□□□ -1.04
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PIK3C3-211ENST00000589550 IGSF5Q9NSI5 407 aa8.56□□□□□ -1.04
PIK3C3-211ENST00000589550 DOLKQ9UPQ8 538 aa8.56□□□□□ -1.04
PIK3C3-211ENST00000589550 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa8.55□□□□□ -1.04
PIK3C3-211ENST00000589550 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PIK3C3-211ENST00000589550 SPSB2Q99619 263 aa8.55□□□□□ -1.04
PIK3C3-211ENST00000589550 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PIK3C3-211ENST00000589550 SEC13P55735 322 aa8.54□□□□□ -1.04
PIK3C3-211ENST00000589550 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PIK3C3-211ENST00000589550 BCL2L13Q9BXK5 485 aa8.54□□□□□ -1.04
PIK3C3-211ENST00000589550 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa8.53□□□□□ -1.04
PIK3C3-211ENST00000589550 DKK1O94907 266 aa8.53□□□□□ -1.04
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PIK3C3-211ENST00000589550 RNF20Q5VTR2 975 aa8.53□□□□□ -1.04
PIK3C3-211ENST00000589550 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PIK3C3-211ENST00000589550 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PIK3C3-211ENST00000589550 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa8.52□□□□□ -1.05
PIK3C3-211ENST00000589550 GTF2IP78347 998 aa8.52□□□□□ -1.05
PIK3C3-211ENST00000589550 TAS1R3Q7RTX0 852 aa8.52□□□□□ -1.05
PIK3C3-211ENST00000589550 CCDC125Q86Z20 511 aa8.52□□□□□ -1.05
PIK3C3-211ENST00000589550 UNC93B1Q9H1C4 597 aa8.52□□□□□ -1.05
PIK3C3-211ENST00000589550 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PIK3C3-211ENST00000589550 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PIK3C3-211ENST00000589550 BCAMP50895 628 aa8.51□□□□□ -1.05
PIK3C3-211ENST00000589550 OCLNQ16625 522 aa8.51□□□□□ -1.05
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PIK3C3-211ENST00000589550 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PIK3C3-211ENST00000589550 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PIK3C3-211ENST00000589550 PRMT3O60678 531 aa8.5□□□□□ -1.05
PIK3C3-211ENST00000589550 OXLD1Q5BKU9 147 aa8.5□□□□□ -1.05
PIK3C3-211ENST00000589550 CCDC102BQ68D86 513 aa8.5□□□□□ -1.05
PIK3C3-211ENST00000589550 NPAS4Q8IUM7 802 aa8.5□□□□□ -1.05
PIK3C3-211ENST00000589550 GIPC2Q8TF65 315 aa8.5□□□□□ -1.05
PIK3C3-211ENST00000589550 KIAA1024Q9UPX6 916 aa8.5□□□□□ -1.05
PIK3C3-211ENST00000589550 A0A0G2JS52 829 aa8.49□□□□□ -1.05
PIK3C3-211ENST00000589550 ANKRD33BA6NCL7 494 aa8.49□□□□□ -1.05
PIK3C3-211ENST00000589550 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa8.49□□□□□ -1.05
PIK3C3-211ENST00000589550 WNT2BQ93097 391 aa8.49□□□□□ -1.05
PIK3C3-211ENST00000589550 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PIK3C3-211ENST00000589550 PRDM9Q9NQV7 894 aa8.49□□□□□ -1.05
PIK3C3-211ENST00000589550 ICMTO60725 284 aa8.48□□□□□ -1.05
PIK3C3-211ENST00000589550 ABL1P00519 1130 aa8.48□□□□□ -1.05
PIK3C3-211ENST00000589550 TSGA10IPQ3SY00 556 aa8.48□□□□□ -1.05
PIK3C3-211ENST00000589550 THSD4Q6ZMP0 1018 aa8.48□□□□□ -1.05
PIK3C3-211ENST00000589550 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PIK3C3-211ENST00000589550 TPCN2Q8NHX9 752 aa8.48□□□□□ -1.05
PIK3C3-211ENST00000589550 H3BRB1 525 aa8.47□□□□□ -1.05
PIK3C3-211ENST00000589550 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PIK3C3-211ENST00000589550 ADH1BP00325 375 aa8.47□□□□□ -1.05
PIK3C3-211ENST00000589550 VAMP1P23763 118 aa8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms