RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569573.1

E2F4-213, Transcript of E2F transcription factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene E2F4, Length 849 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4-213ENST00000569573 TTC21AQ8NDW8 1320 aa36.53■■■■□ 3.44
E2F4-213ENST00000569573 AXIN2Q9Y2T1 843 aa36.52■■■■□ 3.44
E2F4-213ENST00000569573 LRRC37A3O60309 1634 aa36.51■■■■□ 3.43
E2F4-213ENST00000569573 ARHGEF25Q86VW2 580 aa36.5■■■■□ 3.43
E2F4-213ENST00000569573 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP36.5■■■■□ 3.43
E2F4-213ENST00000569573 COL18A1P39060 1754 aa36.49■■■■□ 3.43
E2F4-213ENST00000569573 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP36.49■■■■□ 3.43
E2F4-213ENST00000569573 AKAP12Q02952 1782 aa36.48■■■■□ 3.43
E2F4-213ENST00000569573 PEAK1Q9H792 1746 aa36.45■■■■□ 3.43
E2F4-213ENST00000569573 PLSCR1O15162 318 aa36.42■■■■□ 3.42
E2F4-213ENST00000569573 CARD10Q9BWT7 1032 aa36.42■■■■□ 3.42
E2F4-213ENST00000569573 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP36.42■■■■□ 3.42
E2F4-213ENST00000569573 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP36.42■■■■□ 3.42
E2F4-213ENST00000569573 WNK3Q9BYP7 1800 aa36.41■■■■□ 3.42
E2F4-213ENST00000569573 SPON1Q9HCB6 807 aa36.41■■■■□ 3.42
E2F4-213ENST00000569573 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP36.4■■■■□ 3.42
E2F4-213ENST00000569573 SBF2Q86WG5 1849 aa36.39■■■■□ 3.42
E2F4-213ENST00000569573 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP36.39■■■■□ 3.42
E2F4-213ENST00000569573 CARD11Q9BXL7 1154 aa36.39■■■■□ 3.42
E2F4-213ENST00000569573 RGPD5Q99666 1765 aa36.38■■■■□ 3.41
E2F4-213ENST00000569573 EXOC5O00471 708 aa36.37■■■■□ 3.41
E2F4-213ENST00000569573 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP36.37■■■■□ 3.41
E2F4-213ENST00000569573 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa36.37■■■■□ 3.41
E2F4-213ENST00000569573 NFAT5O94916 1531 aa36.36■■■■□ 3.41
E2F4-213ENST00000569573 KCNQ2O43526 872 aa36.36■■■■□ 3.41
E2F4-213ENST00000569573 TMC1Q8TDI8 760 aa36.35■■■■□ 3.41
E2F4-213ENST00000569573 CCDC7Q96M83 1385 aa36.35■■■■□ 3.41
E2F4-213ENST00000569573 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa36.35■■■■□ 3.41
E2F4-213ENST00000569573 PTF1AQ7RTS3 328 aa36.33■■■■□ 3.41
E2F4-213ENST00000569573 MON2Q7Z3U7 1717 aa36.33■■■■□ 3.41
E2F4-213ENST00000569573 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP36.32■■■■□ 3.4
E2F4-213ENST00000569573 BCL9O00512 1426 aa36.32■■■■□ 3.4
E2F4-213ENST00000569573 ABCC6O95255 1503 aa36.31■■■■□ 3.4
E2F4-213ENST00000569573 NME9Q86XW9 330 aa36.29■■■■□ 3.4
E2F4-213ENST00000569573 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
E2F4-213ENST00000569573 USP31Q70CQ4 1352 aa36.27■■■■□ 3.4
E2F4-213ENST00000569573 DCAF8L1A6NGE4 600 aa36.27■■■■□ 3.4
E2F4-213ENST00000569573 NLRP2Q9NX02 1062 aa36.27■■■■□ 3.4
E2F4-213ENST00000569573 TONSLQ96HA7 1378 aa36.27■■■■□ 3.4
E2F4-213ENST00000569573 TNS2Q63HR2 1409 aa36.25■■■■□ 3.39
E2F4-213ENST00000569573 TERF2IPQ9NYB0 399 aa36.23■■■■□ 3.39
E2F4-213ENST00000569573 ERBB3P21860 1342 aa36.23■■■■□ 3.39
E2F4-213ENST00000569573 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa36.22■■■■□ 3.39
E2F4-213ENST00000569573 CD163L1Q9NR16 1453 aa36.22■■■■□ 3.39
E2F4-213ENST00000569573 TXNRD1Q16881 649 aa36.21■■■■□ 3.39
E2F4-213ENST00000569573 PROM2Q8N271 834 aa36.21■■■■□ 3.39
E2F4-213ENST00000569573 STK32BQ9NY57 414 aa36.21■■■■□ 3.39
E2F4-213ENST00000569573 NINLQ9Y2I6 1382 aa36.2■■■■□ 3.39
E2F4-213ENST00000569573 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
E2F4-213ENST00000569573 USP54Q70EL1 1684 aa36.19■■■■□ 3.38
E2F4-213ENST00000569573 IL2RBP14784 551 aa36.18■■■■□ 3.38
E2F4-213ENST00000569573 LTN1O94822 1766 aa36.17■■■■□ 3.38
E2F4-213ENST00000569573 ANKRD24Q8TF21 1146 aa36.17■■■■□ 3.38
E2F4-213ENST00000569573 YY1P25490 414 aa36.16■■■■□ 3.38
E2F4-213ENST00000569573 ACSBG1Q96GR2 724 aa36.15■■■■□ 3.38
E2F4-213ENST00000569573 A0A1W2PP64 1363 aa36.15■■■■□ 3.38
E2F4-213ENST00000569573 ZBTB7AO95365 584 aa36.14■■■■□ 3.38
E2F4-213ENST00000569573 CASZ1Q86V15 1759 aa36.14■■■■□ 3.38
E2F4-213ENST00000569573 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP36.12■■■■□ 3.37
E2F4-213ENST00000569573 SLC15A2Q16348 729 aa36.11■■■■□ 3.37
E2F4-213ENST00000569573 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
E2F4-213ENST00000569573 NHSQ6T4R5 1651 aa36.1■■■■□ 3.37
E2F4-213ENST00000569573 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
E2F4-213ENST00000569573 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP36.04■■■■□ 3.36
E2F4-213ENST00000569573 IP6K1Q92551 441 aa36.03■■■■□ 3.36
E2F4-213ENST00000569573 COG3Q96JB2 828 aa36.03■■■■□ 3.36
E2F4-213ENST00000569573 SLC24A1O60721 1099 aa36.02■■■■□ 3.36
E2F4-213ENST00000569573 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa36.01■■■■□ 3.36
E2F4-213ENST00000569573 PTGER2P43116 358 aa36■■■■□ 3.35
E2F4-213ENST00000569573 MTFR1LQ9H019 292 aa36■■■■□ 3.35
E2F4-213ENST00000569573 KAT6BQ8WYB5 2073 aa35.99■■■■□ 3.35
E2F4-213ENST00000569573 MYOM1P52179 1685 aa35.98■■■■□ 3.35
E2F4-213ENST00000569573 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP35.98■■■■□ 3.35
E2F4-213ENST00000569573 TESK2Q96S53 571 aa35.97■■■■□ 3.35
E2F4-213ENST00000569573 AMPHP49418 695 aa35.96■■■■□ 3.35
E2F4-213ENST00000569573 BTAF1O14981 1849 aa35.96■■■■□ 3.35
E2F4-213ENST00000569573 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.35
E2F4-213ENST00000569573 MAP3K19Q56UN5 1328 aa35.92■■■■□ 3.34
E2F4-213ENST00000569573 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
E2F4-213ENST00000569573 HOXC9P31274 260 aa35.91■■■■□ 3.34
E2F4-213ENST00000569573 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
E2F4-213ENST00000569573 SYT17Q9BSW7 474 aa35.88■■■■□ 3.33
E2F4-213ENST00000569573 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa35.88■■■■□ 3.33
E2F4-213ENST00000569573 PAPPAQ13219 1627 aa35.87■■■■□ 3.33
E2F4-213ENST00000569573 FBLN1P23142 703 aa35.86■■■■□ 3.33
E2F4-213ENST00000569573 ZNF827Q17R98 1081 aa35.86■■■■□ 3.33
E2F4-213ENST00000569573 LRRC4BQ9NT99 713 aa35.86■■■■□ 3.33
E2F4-213ENST00000569573 TMF1P82094 1093 aa35.85■■■■□ 3.33
E2F4-213ENST00000569573 SLC27A3Q5K4L6 730 aa35.85■■■■□ 3.33
E2F4-213ENST00000569573 ARXQ96QS3 562 aa35.84■■■■□ 3.33
E2F4-213ENST00000569573 SGIP1Q9BQI5 828 aa35.83■■■■□ 3.33
E2F4-213ENST00000569573 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP35.82■■■■□ 3.32
E2F4-213ENST00000569573 RTL1A6NKG5 1358 aa35.81■■■■□ 3.32
E2F4-213ENST00000569573 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP35.81■■■■□ 3.32
E2F4-213ENST00000569573 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP35.79■■■■□ 3.32
E2F4-213ENST00000569573 GGNBP2Q9H3C7 697 aa35.79■■■■□ 3.32
E2F4-213ENST00000569573 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP35.78■■■■□ 3.32
E2F4-213ENST00000569573 USP47Q96K76 1375 aa35.77■■■■□ 3.32
E2F4-213ENST00000569573 AKT1S1Q96B36 256 aa35.77■■■■□ 3.32
E2F4-213ENST00000569573 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa35.76■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms