RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568561.5

NME3-211, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NME3, Length 813 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-211ENST00000568561 AXIN2Q9Y2T1 843 aa22.26■■□□□ 1.15
NME3-211ENST00000568561 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.26■■□□□ 1.15
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NME3-211ENST00000568561 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
NME3-211ENST00000568561 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.23■■□□□ 1.15
NME3-211ENST00000568561 WDR17Q8IZU2 1322 aa22.23■■□□□ 1.15
NME3-211ENST00000568561 DDB1Q16531 1140 aa22.22■■□□□ 1.15
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NME3-211ENST00000568561 ARHGEF25Q86VW2 580 aa22.21■■□□□ 1.15
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NME3-211ENST00000568561 KCNH5Q8NCM2 988 aa22.18■■□□□ 1.14
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NME3-211ENST00000568561 ABCC6O95255 1503 aa22.13■■□□□ 1.13
NME3-211ENST00000568561 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.13■■□□□ 1.13
NME3-211ENST00000568561 NME9Q86XW9 330 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-211ENST00000568561 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.12■■□□□ 1.13
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NME3-211ENST00000568561 TMC1Q8TDI8 760 aa22.1■■□□□ 1.13
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NME3-211ENST00000568561 CCDC7Q96M83 1385 aa22.09■■□□□ 1.13
NME3-211ENST00000568561 NHSQ6T4R5 1651 aa22.08■■□□□ 1.13
NME3-211ENST00000568561 BCL9O00512 1426 aa22.08■■□□□ 1.13
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NME3-211ENST00000568561 EXOC5O00471 708 aa22.06■■□□□ 1.12
NME3-211ENST00000568561 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.06■■□□□ 1.12
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NME3-211ENST00000568561 A0A1W2PP64 1363 aa22.05■■□□□ 1.12
NME3-211ENST00000568561 TONSLQ96HA7 1378 aa22.05■■□□□ 1.12
NME3-211ENST00000568561 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.05■■□□□ 1.12
NME3-211ENST00000568561 MYOM1P52179 1685 aa22.04■■□□□ 1.12
NME3-211ENST00000568561 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.04■■□□□ 1.12
NME3-211ENST00000568561 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
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NME3-211ENST00000568561 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
NME3-211ENST00000568561 LY75O60449 1722 aa21.81■■□□□ 1.08
NME3-211ENST00000568561 KCNQ4P56696 695 aa21.81■■□□□ 1.08
NME3-211ENST00000568561 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
NME3-211ENST00000568561 SYT17Q9BSW7 474 aa21.81■■□□□ 1.08
NME3-211ENST00000568561 USP47Q96K76 1375 aa21.81■■□□□ 1.08
NME3-211ENST00000568561 GGNBP2Q9H3C7 697 aa21.8■■□□□ 1.08
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