RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 NME9Q86XW9 330 aa23.89■■□□□ 1.41
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CCNDBP1-211ENST00000567434 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.88■■□□□ 1.41
CCNDBP1-211ENST00000567434 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
CCNDBP1-211ENST00000567434 TCP11L2Q8N4U5 519 aa23.88■■□□□ 1.41
CCNDBP1-211ENST00000567434 DEFB132Q7Z7B7 95 aa23.87■■□□□ 1.41
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CCNDBP1-211ENST00000567434 OVOS2Q6IE36 1432 aa23.86■■□□□ 1.41
CCNDBP1-211ENST00000567434 USP35Q9P2H5 1018 aa23.85■■□□□ 1.41
CCNDBP1-211ENST00000567434 SOX12O15370 315 aa23.84■■□□□ 1.41
CCNDBP1-211ENST00000567434 WDR17Q8IZU2 1322 aa23.84■■□□□ 1.41
CCNDBP1-211ENST00000567434 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.82■■□□□ 1.4
CCNDBP1-211ENST00000567434 AXIN2Q9Y2T1 843 aa23.82■■□□□ 1.4
CCNDBP1-211ENST00000567434 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa23.8■■□□□ 1.4
CCNDBP1-211ENST00000567434 COG3Q96JB2 828 aa23.8■■□□□ 1.4
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CCNDBP1-211ENST00000567434 MYOM1P52179 1685 aa23.78■■□□□ 1.4
CCNDBP1-211ENST00000567434 RGPD5Q99666 1765 aa23.78■■□□□ 1.4
CCNDBP1-211ENST00000567434 PDE3BQ13370 1112 aa23.77■■□□□ 1.4
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CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM196AQ6ZSG2 479 aa23.76■■□□□ 1.39
CCNDBP1-211ENST00000567434 CARD10Q9BWT7 1032 aa23.76■■□□□ 1.39
CCNDBP1-211ENST00000567434 RGPD1P0DJD0 1748 aa23.76■■□□□ 1.39
CCNDBP1-211ENST00000567434 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC7Q96M83 1385 aa23.75■■□□□ 1.39
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CCNDBP1-211ENST00000567434 FYB1O15117 783 aa23.73■■□□□ 1.39
CCNDBP1-211ENST00000567434 ERBB3P21860 1342 aa23.73■■□□□ 1.39
CCNDBP1-211ENST00000567434 LRP5O75197 1615 aa23.73■■□□□ 1.39
CCNDBP1-211ENST00000567434 KIF20BQ96Q89 1820 aa23.71■■□□□ 1.39
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM182BQ5T319 152 aa23.71■■□□□ 1.39
CCNDBP1-211ENST00000567434 LRRC37A3O60309 1634 aa23.7■■□□□ 1.39
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CCNDBP1-211ENST00000567434 DISP2A7MBM2 1401 aa23.69■■□□□ 1.38
CCNDBP1-211ENST00000567434 DDB1Q16531 1140 aa23.69■■□□□ 1.38
CCNDBP1-211ENST00000567434 NSD3Q9BZ95 1437 aa23.68■■□□□ 1.38
CCNDBP1-211ENST00000567434 RTL1A6NKG5 1358 aa23.68■■□□□ 1.38
CCNDBP1-211ENST00000567434 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.68■■□□□ 1.38
CCNDBP1-211ENST00000567434 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa23.67■■□□□ 1.38
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CCNDBP1-211ENST00000567434 MAP3K19Q56UN5 1328 aa23.67■■□□□ 1.38
CCNDBP1-211ENST00000567434 ANKRD24Q8TF21 1146 aa23.67■■□□□ 1.38
CCNDBP1-211ENST00000567434 CARD14Q9BXL6 1004 aa23.67■■□□□ 1.38
CCNDBP1-211ENST00000567434 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
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CCNDBP1-211ENST00000567434 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 PEAK1Q9H792 1746 aa23.64■■□□□ 1.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 KIF24Q5T7B8 1368 aa23.64■■□□□ 1.37
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CCNDBP1-211ENST00000567434 TNS2Q63HR2 1409 aa23.61■■□□□ 1.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 EXOC5O00471 708 aa23.61■■□□□ 1.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 IL2RBP14784 551 aa23.59■■□□□ 1.37
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CCNDBP1-211ENST00000567434 FBLN1P23142 703 aa23.57■■□□□ 1.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
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CCNDBP1-211ENST00000567434 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
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CCNDBP1-211ENST00000567434 NSD2O96028 1365 aa23.53■■□□□ 1.36
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CCNDBP1-211ENST00000567434 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 PANK3Q9H999 370 aa23.53■■□□□ 1.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
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CCNDBP1-211ENST00000567434 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa23.47■■□□□ 1.35
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CCNDBP1-211ENST00000567434 NBPF4Q96M43 638 aa23.46■■□□□ 1.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 KNSTRNQ9Y448 316 aa23.45■■□□□ 1.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 NHSQ6T4R5 1651 aa23.44■■□□□ 1.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 NUP188Q5SRE5 1749 aa23.43■■□□□ 1.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa23.43■■□□□ 1.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 POLKQ9UBT6 870 aa23.43■■□□□ 1.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 MEGF6O75095 1541 aa23.43■■□□□ 1.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 NCAPD2Q15021 1401 aa23.41■■□□□ 1.34
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