RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554698.5

SDR39U1-208, Transcript of short chain dehydrogenase/reductase family 39U member 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene SDR39U1, Length 1,364 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SDR39U1-208	ENST00000554698	MORC1	Q86VD1	984 aa		29.26	■■■□□ 2.28
SDR39U1-208	ENST00000554698	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	29.26	■■■□□ 2.28
SDR39U1-208	ENST00000554698	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	29.26	■■■□□ 2.27
SDR39U1-208	ENST00000554698	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	29.25	■■■□□ 2.27
SDR39U1-208	ENST00000554698	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	29.25	■■■□□ 2.27
SDR39U1-208	ENST00000554698	VPS72	Q15906	364 aa		29.24	■■■□□ 2.27
SDR39U1-208	ENST00000554698	LTN1	O94822	1766 aa		29.23	■■■□□ 2.27
SDR39U1-208	ENST00000554698	IP6K1	Q92551	441 aa		29.23	■■■□□ 2.27
SDR39U1-208	ENST00000554698	RTL1	A6NKG5	1358 aa		29.23	■■■□□ 2.27
SDR39U1-208	ENST00000554698	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	29.22	■■■□□ 2.27
SDR39U1-208	ENST00000554698	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		29.22	■■■□□ 2.27
SDR39U1-208	ENST00000554698	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	29.2	■■■□□ 2.27
SDR39U1-208	ENST00000554698	HOXC9	P31274	260 aa		29.2	■■■□□ 2.26
SDR39U1-208	ENST00000554698	AMPH	P49418	695 aa		29.2	■■■□□ 2.26
SDR39U1-208	ENST00000554698	EVA1C	P58658	441 aa		29.2	■■■□□ 2.26
SDR39U1-208	ENST00000554698	STRN4	Q9NRL3	753 aa		29.2	■■■□□ 2.26
SDR39U1-208	ENST00000554698	POLK	Q9UBT6	870 aa		29.2	■■■□□ 2.26
SDR39U1-208	ENST00000554698	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		29.19	■■■□□ 2.26
SDR39U1-208	ENST00000554698	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	29.18	■■■□□ 2.26
SDR39U1-208	ENST00000554698	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	29.17	■■■□□ 2.26
SDR39U1-208	ENST00000554698	FLT4	P35916	1363 aa		29.17	■■■□□ 2.26
SDR39U1-208	ENST00000554698	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	29.16	■■■□□ 2.26
SDR39U1-208	ENST00000554698	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	29.16	■■■□□ 2.26
SDR39U1-208	ENST00000554698	ERBB3	P21860	1342 aa		29.16	■■■□□ 2.26
SDR39U1-208	ENST00000554698	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		29.16	■■■□□ 2.26
SDR39U1-208	ENST00000554698	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		29.16	■■■□□ 2.26
SDR39U1-208	ENST00000554698	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		29.16	■■■□□ 2.26
SDR39U1-208	ENST00000554698	PEAK1	Q9H792	1746 aa		29.16	■■■□□ 2.26
SDR39U1-208	ENST00000554698	RXRB	P28702	533 aa		29.15	■■■□□ 2.26
SDR39U1-208	ENST00000554698	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	29.13	■■■□□ 2.25
SDR39U1-208	ENST00000554698	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	29.13	■■■□□ 2.25
SDR39U1-208	ENST00000554698	GLI3	P10071	1580 aa		29.13	■■■□□ 2.25
SDR39U1-208	ENST00000554698	INSR	P06213	1382 aa		29.13	■■■□□ 2.25
SDR39U1-208	ENST00000554698	CRB1	P82279	1406 aa		29.13	■■■□□ 2.25
SDR39U1-208	ENST00000554698	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		29.13	■■■□□ 2.25
SDR39U1-208	ENST00000554698	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		29.12	■■■□□ 2.25
SDR39U1-208	ENST00000554698	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		29.12	■■■□□ 2.25
SDR39U1-208	ENST00000554698	RGPD5	Q99666	1765 aa		29.11	■■■□□ 2.25
SDR39U1-208	ENST00000554698	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	29.11	■■■□□ 2.25
SDR39U1-208	ENST00000554698	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		29.1	■■■□□ 2.25
SDR39U1-208	ENST00000554698	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		29.09	■■■□□ 2.25
SDR39U1-208	ENST00000554698	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	29.09	■■■□□ 2.25
SDR39U1-208	ENST00000554698	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	29.08	■■■□□ 2.25
SDR39U1-208	ENST00000554698	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		29.07	■■■□□ 2.24
SDR39U1-208	ENST00000554698	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		29.07	■■■□□ 2.24
SDR39U1-208	ENST00000554698	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24
SDR39U1-208	ENST00000554698	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24
SDR39U1-208	ENST00000554698	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SDR39U1-208	ENST00000554698	USP35	Q9P2H5	1018 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SDR39U1-208	ENST00000554698	MTHFS	P49914	203 aa		29.04	■■■□□ 2.24
SDR39U1-208	ENST00000554698	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	29.04	■■■□□ 2.24
SDR39U1-208	ENST00000554698	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		29.03	■■■□□ 2.24
SDR39U1-208	ENST00000554698	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		29.03	■■■□□ 2.24
SDR39U1-208	ENST00000554698	RGS12	O14924	1447 aa		29.03	■■■□□ 2.24
SDR39U1-208	ENST00000554698	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	29.02	■■■□□ 2.24
SDR39U1-208	ENST00000554698	PPP2R1A	P30153	589 aa		29.01	■■■□□ 2.24
SDR39U1-208	ENST00000554698	ILDR2	Q71H61	639 aa		29.01	■■■□□ 2.23
SDR39U1-208	ENST00000554698	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	29	■■■□□ 2.23
SDR39U1-208	ENST00000554698	RALBP1	Q15311	655 aa		29	■■■□□ 2.23
SDR39U1-208	ENST00000554698	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	28.99	■■■□□ 2.23
SDR39U1-208	ENST00000554698	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		28.98	■■■□□ 2.23
SDR39U1-208	ENST00000554698	NBPF4	Q96M43	638 aa		28.98	■■■□□ 2.23
SDR39U1-208	ENST00000554698	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		28.97	■■■□□ 2.23
SDR39U1-208	ENST00000554698	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		28.97	■■■□□ 2.23
SDR39U1-208	ENST00000554698	DISP2	A7MBM2	1401 aa		28.95	■■■□□ 2.22
SDR39U1-208	ENST00000554698	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	28.93	■■■□□ 2.22
SDR39U1-208	ENST00000554698	NCAPD2	Q15021	1401 aa		28.93	■■■□□ 2.22
SDR39U1-208	ENST00000554698	EYA1	Q99502	592 aa		28.92	■■■□□ 2.22
SDR39U1-208	ENST00000554698	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	28.92	■■■□□ 2.22
SDR39U1-208	ENST00000554698	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	28.92	■■■□□ 2.22
SDR39U1-208	ENST00000554698	IL13	P35225	146 aa		28.91	■■■□□ 2.22
SDR39U1-208	ENST00000554698		A0A0G2JS52	829 aa		28.9	■■■□□ 2.22
SDR39U1-208	ENST00000554698	MYT1	Q01538	1121 aa		28.9	■■■□□ 2.22
SDR39U1-208	ENST00000554698	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		28.89	■■■□□ 2.22
SDR39U1-208	ENST00000554698	IL2RB	P14784	551 aa		28.88	■■■□□ 2.21
SDR39U1-208	ENST00000554698	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		28.88	■■■□□ 2.21
SDR39U1-208	ENST00000554698	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		28.88	■■■□□ 2.21
SDR39U1-208	ENST00000554698	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
SDR39U1-208	ENST00000554698	CFAP53	Q96M91	514 aa		28.88	■■■□□ 2.21
SDR39U1-208	ENST00000554698	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
SDR39U1-208	ENST00000554698	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		28.87	■■■□□ 2.21
SDR39U1-208	ENST00000554698	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
SDR39U1-208	ENST00000554698	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		28.83	■■■□□ 2.21
SDR39U1-208	ENST00000554698	MEGF6	O75095	1541 aa		28.83	■■■□□ 2.21
SDR39U1-208	ENST00000554698	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		28.83	■■■□□ 2.21
SDR39U1-208	ENST00000554698	LRRC37A3	O60309	1634 aa		28.83	■■■□□ 2.21
SDR39U1-208	ENST00000554698	DDB1	Q16531	1140 aa		28.82	■■■□□ 2.2
SDR39U1-208	ENST00000554698	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		28.81	■■■□□ 2.2
SDR39U1-208	ENST00000554698	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		28.81	■■■□□ 2.2
SDR39U1-208	ENST00000554698	TNS2	Q63HR2	1409 aa		28.81	■■■□□ 2.2
SDR39U1-208	ENST00000554698	KDR	P35968	1356 aa		28.8	■■■□□ 2.2
SDR39U1-208	ENST00000554698	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		28.8	■■■□□ 2.2
SDR39U1-208	ENST00000554698	EXOC5	O00471	708 aa		28.79	■■■□□ 2.2
SDR39U1-208	ENST00000554698	ANP32C	O43423	234 aa		28.78	■■■□□ 2.2
SDR39U1-208	ENST00000554698	PDE3B	Q13370	1112 aa		28.78	■■■□□ 2.2
SDR39U1-208	ENST00000554698	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	28.77	■■■□□ 2.2
SDR39U1-208	ENST00000554698	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		28.77	■■■□□ 2.2
SDR39U1-208	ENST00000554698	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		28.76	■■■□□ 2.2
SDR39U1-208	ENST00000554698	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		28.76	■■■□□ 2.19
SDR39U1-208	ENST00000554698	NUDC	Q9Y266	331 aa		28.75	■■■□□ 2.19

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