RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552294.1

CTDSP2-208, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP2, Length 436 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF827Q17R98 1081 aa10.03□□□□□ -0.8
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CTDSP2-208ENST00000552294 CABP1Q9NZU7 370 aa10.02□□□□□ -0.81
CTDSP2-208ENST00000552294 SLIT3O75094 1523 aa10.02□□□□□ -0.81
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CTDSP2-208ENST00000552294 PAPPAQ13219 1627 aa9.98□□□□□ -0.81
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CTDSP2-208ENST00000552294 MTFR1LQ9H019 292 aa9.95□□□□□ -0.82
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CTDSP2-208ENST00000552294 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
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CTDSP2-208ENST00000552294 AKT1S1Q96B36 256 aa9.93□□□□□ -0.82
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CTDSP2-208ENST00000552294 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CTDSP2-208ENST00000552294 BTAF1O14981 1849 aa9.9□□□□□ -0.82
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CTDSP2-208ENST00000552294 MAP3K5Q99683 1374 aa9.89□□□□□ -0.83
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CTDSP2-208ENST00000552294 ABCC6O95255 1503 aa9.88□□□□□ -0.83
CTDSP2-208ENST00000552294 MSL1Q68DK7 614 aa9.88□□□□□ -0.83
CTDSP2-208ENST00000552294 NLRP2Q9NX02 1062 aa9.88□□□□□ -0.83
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CTDSP2-208ENST00000552294 COL24A1Q17RW2 1714 aa9.87□□□□□ -0.83
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CTDSP2-208ENST00000552294 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
CTDSP2-208ENST00000552294 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CTDSP2-208ENST00000552294 ANKRD24Q8TF21 1146 aa9.86□□□□□ -0.83
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CTDSP2-208ENST00000552294 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
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CTDSP2-208ENST00000552294 CHD4Q14839 1912 aa9.85□□□□□ -0.83
CTDSP2-208ENST00000552294 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CTDSP2-208ENST00000552294 ATP10DQ9P241 1426 aa9.84□□□□□ -0.83
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
CTDSP2-208ENST00000552294 USP31Q70CQ4 1352 aa9.84□□□□□ -0.83
CTDSP2-208ENST00000552294 EVC2Q86UK5 1308 aa9.83□□□□□ -0.84
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CTDSP2-208ENST00000552294 USHBP1Q8N6Y0 703 aa9.82□□□□□ -0.84
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