RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550734.5

CS-221, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-221ENST00000550734 WNK3Q9BYP7 1800 aa16.51■□□□□ 0.23
CS-221ENST00000550734 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa16.5■□□□□ 0.23
CS-221ENST00000550734 NLRP6P59044 892 aa16.5■□□□□ 0.23
CS-221ENST00000550734 DDB1Q16531 1140 aa16.5■□□□□ 0.23
CS-221ENST00000550734 CABP1Q9NZU7 370 aa16.49■□□□□ 0.23
CS-221ENST00000550734 PIK3C2AO00443 1686 aa16.49■□□□□ 0.23
CS-221ENST00000550734 QRICH2Q9H0J4 1663 aa16.49■□□□□ 0.23
CS-221ENST00000550734 WDR17Q8IZU2 1322 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-221ENST00000550734 DCAF8L1A6NGE4 600 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-221ENST00000550734 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-221ENST00000550734 PTF1AQ7RTS3 328 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-221ENST00000550734 PROM2Q8N271 834 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-221ENST00000550734 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
CS-221ENST00000550734 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
CS-221ENST00000550734 AXIN2Q9Y2T1 843 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-221ENST00000550734 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
CS-221ENST00000550734 AKAP12Q02952 1782 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-221ENST00000550734 ZBTB7CA1YPR0 619 aa16.45■□□□□ 0.22
CS-221ENST00000550734 ARHGEF25Q86VW2 580 aa16.45■□□□□ 0.22
CS-221ENST00000550734 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
CS-221ENST00000550734 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
CS-221ENST00000550734 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
CS-221ENST00000550734 RGPD5Q99666 1765 aa16.44■□□□□ 0.22
CS-221ENST00000550734 CARD10Q9BWT7 1032 aa16.44■□□□□ 0.22
CS-221ENST00000550734 PTGER2P43116 358 aa16.43■□□□□ 0.22
CS-221ENST00000550734 KCNH5Q8NCM2 988 aa16.43■□□□□ 0.22
CS-221ENST00000550734 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
CS-221ENST00000550734 EVC2Q86UK5 1308 aa16.42■□□□□ 0.22
CS-221ENST00000550734 TONSLQ96HA7 1378 aa16.41■□□□□ 0.22
CS-221ENST00000550734 MYOM1P52179 1685 aa16.41■□□□□ 0.22
CS-221ENST00000550734 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa16.41■□□□□ 0.22
CS-221ENST00000550734 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-221ENST00000550734 ZBTB7AO95365 584 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-221ENST00000550734 SLC15A2Q16348 729 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-221ENST00000550734 TXNRD1Q16881 649 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-221ENST00000550734 TTC21AQ8NDW8 1320 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-221ENST00000550734 NFAT5O94916 1531 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-221ENST00000550734 ABCC6O95255 1503 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-221ENST00000550734 EXOC5O00471 708 aa16.39■□□□□ 0.21
CS-221ENST00000550734 CCDC7Q96M83 1385 aa16.38■□□□□ 0.21
CS-221ENST00000550734 STK32BQ9NY57 414 aa16.38■□□□□ 0.21
CS-221ENST00000550734 SGIP1Q9BQI5 828 aa16.37■□□□□ 0.21
CS-221ENST00000550734 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
CS-221ENST00000550734 NHSQ6T4R5 1651 aa16.37■□□□□ 0.21
CS-221ENST00000550734 TNS2Q63HR2 1409 aa16.36■□□□□ 0.21
CS-221ENST00000550734 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa16.36■□□□□ 0.21
CS-221ENST00000550734 SYT17Q9BSW7 474 aa16.36■□□□□ 0.21
CS-221ENST00000550734 MTFR1LQ9H019 292 aa16.36■□□□□ 0.21
CS-221ENST00000550734 CARD11Q9BXL7 1154 aa16.35■□□□□ 0.21
CS-221ENST00000550734 USP54Q70EL1 1684 aa16.34■□□□□ 0.21
CS-221ENST00000550734 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
CS-221ENST00000550734 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
CS-221ENST00000550734 CHD4Q14839 1912 aa16.34■□□□□ 0.21
CS-221ENST00000550734 CLSPNQ9HAW4 1339 aa16.34■□□□□ 0.21
CS-221ENST00000550734 PAPPAQ13219 1627 aa16.34■□□□□ 0.21
CS-221ENST00000550734 MON2Q7Z3U7 1717 aa16.33■□□□□ 0.21
CS-221ENST00000550734 SOX12O15370 315 aa16.33■□□□□ 0.2
CS-221ENST00000550734 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa16.33■□□□□ 0.2
CS-221ENST00000550734 USP31Q70CQ4 1352 aa16.33■□□□□ 0.2
CS-221ENST00000550734 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
CS-221ENST00000550734 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
CS-221ENST00000550734 MAP3K5Q99683 1374 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-221ENST00000550734 ERBB3P21860 1342 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-221ENST00000550734 BTAF1O14981 1849 aa16.3■□□□□ 0.2
CS-221ENST00000550734 SLC24A1O60721 1099 aa16.29■□□□□ 0.2
CS-221ENST00000550734 ACSBG1Q96GR2 724 aa16.29■□□□□ 0.2
CS-221ENST00000550734 ARXQ96QS3 562 aa16.29■□□□□ 0.2
CS-221ENST00000550734 LTN1O94822 1766 aa16.28■□□□□ 0.2
CS-221ENST00000550734 IL2RBP14784 551 aa16.28■□□□□ 0.2
CS-221ENST00000550734 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
CS-221ENST00000550734 CD163L1Q9NR16 1453 aa16.28■□□□□ 0.2
CS-221ENST00000550734 COL24A1Q17RW2 1714 aa16.27■□□□□ 0.19
CS-221ENST00000550734 QSER1Q2KHR3 1735 aa16.26■□□□□ 0.19
CS-221ENST00000550734 TESK2Q96S53 571 aa16.26■□□□□ 0.19
CS-221ENST00000550734 LRRC4BQ9NT99 713 aa16.26■□□□□ 0.19
CS-221ENST00000550734 NLRP2Q9NX02 1062 aa16.26■□□□□ 0.19
CS-221ENST00000550734 KAT6BQ8WYB5 2073 aa16.25■□□□□ 0.19
CS-221ENST00000550734 ZNF827Q17R98 1081 aa16.25■□□□□ 0.19
CS-221ENST00000550734 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP16.25■□□□□ 0.19
CS-221ENST00000550734 NME9Q86XW9 330 aa16.24■□□□□ 0.19
CS-221ENST00000550734 ANKRD24Q8TF21 1146 aa16.24■□□□□ 0.19
CS-221ENST00000550734 AKT1S1Q96B36 256 aa16.24■□□□□ 0.19
CS-221ENST00000550734 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa16.23■□□□□ 0.19
CS-221ENST00000550734 SLC16A10Q8TF71 515 aa16.23■□□□□ 0.19
CS-221ENST00000550734 C1QTNF8P60827 252 aa16.22■□□□□ 0.19
CS-221ENST00000550734 SLC27A3Q5K4L6 730 aa16.22■□□□□ 0.19
CS-221ENST00000550734 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
CS-221ENST00000550734 PCGF6Q9BYE7 350 aa16.2■□□□□ 0.18
CS-221ENST00000550734 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
CS-221ENST00000550734 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
CS-221ENST00000550734 IP6K1Q92551 441 aa16.19■□□□□ 0.18
CS-221ENST00000550734 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa16.19■□□□□ 0.18
CS-221ENST00000550734 TERF2IPQ9NYB0 399 aa16.19■□□□□ 0.18
CS-221ENST00000550734 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa16.19■□□□□ 0.18
CS-221ENST00000550734 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa16.19■□□□□ 0.18
CS-221ENST00000550734 GPR162Q16538 588 aa16.18■□□□□ 0.18
CS-221ENST00000550734 LY75O60449 1722 aa16.17■□□□□ 0.18
CS-221ENST00000550734 USP47Q96K76 1375 aa16.17■□□□□ 0.18
CS-221ENST00000550734 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa16.17■□□□□ 0.18
CS-221ENST00000550734 POLD1P28340 1107 aa16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms