RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
CS-220ENST00000550700 ARHGEF25Q86VW2 580 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-220ENST00000550700 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
CS-220ENST00000550700 MAP3K19Q56UN5 1328 aa12.46□□□□□ -0.41
CS-220ENST00000550700 FBXO41Q8TF61 875 aa12.46□□□□□ -0.41
CS-220ENST00000550700 IP6K1Q92551 441 aa12.46□□□□□ -0.41
CS-220ENST00000550700 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
CS-220ENST00000550700 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
CS-220ENST00000550700 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
CS-220ENST00000550700 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
CS-220ENST00000550700 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP12.44□□□□□ -0.42
CS-220ENST00000550700 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
CS-220ENST00000550700 SOX12O15370 315 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-220ENST00000550700 HOXC9P31274 260 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-220ENST00000550700 HSPA1LP34931 641 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-220ENST00000550700 PRDM11Q9NQV5 511 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-220ENST00000550700 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-220ENST00000550700 CABLES1Q8TDN4 633 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-220ENST00000550700 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
CS-220ENST00000550700 KIAA0232Q92628 1395 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-220ENST00000550700 COL18A1P39060 1754 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-220ENST00000550700 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
CS-220ENST00000550700 PEAK1Q9H792 1746 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-220ENST00000550700 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
CS-220ENST00000550700 NWD2Q9ULI1 1742 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-220ENST00000550700 NEFMP07197 916 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-220ENST00000550700 FCHSD2O94868 740 aa12.39□□□□□ -0.43
CS-220ENST00000550700 IL13P35225 146 aa12.39□□□□□ -0.43
CS-220ENST00000550700 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa12.39□□□□□ -0.43
CS-220ENST00000550700 NGEFQ8N5V2 710 aa12.39□□□□□ -0.43
CS-220ENST00000550700 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa12.39□□□□□ -0.43
CS-220ENST00000550700 LMO7Q8WWI1 1683 aa12.38□□□□□ -0.43
CS-220ENST00000550700 RGPD5Q99666 1765 aa12.38□□□□□ -0.43
CS-220ENST00000550700 ZBTB7CA1YPR0 619 aa12.38□□□□□ -0.43
CS-220ENST00000550700 FBLN1P23142 703 aa12.38□□□□□ -0.43
CS-220ENST00000550700 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
CS-220ENST00000550700 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
CS-220ENST00000550700 PLEKHG5O94827 1062 aa12.37□□□□□ -0.43
CS-220ENST00000550700 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP12.37□□□□□ -0.43
CS-220ENST00000550700 EVA1CP58658 441 aa12.37□□□□□ -0.43
CS-220ENST00000550700 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP12.37□□□□□ -0.43
CS-220ENST00000550700 RGPD1P0DJD0 1748 aa12.37□□□□□ -0.43
CS-220ENST00000550700 ERBB3P21860 1342 aa12.37□□□□□ -0.43
CS-220ENST00000550700 FAM83GA6ND36 823 aa12.36□□□□□ -0.43
CS-220ENST00000550700 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
CS-220ENST00000550700 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
CS-220ENST00000550700 CCDC184Q52MB2 194 aa12.36□□□□□ -0.43
CS-220ENST00000550700 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
CS-220ENST00000550700 FAM9BQ8IZU0 186 aa12.36□□□□□ -0.43
CS-220ENST00000550700 ANKRD24Q8TF21 1146 aa12.36□□□□□ -0.43
CS-220ENST00000550700 PLCH1Q4KWH8 1693 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-220ENST00000550700 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-220ENST00000550700 ADAMTS8Q9UP79 889 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-220ENST00000550700 WDR17Q8IZU2 1322 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-220ENST00000550700 IGSF1Q8N6C5 1336 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-220ENST00000550700 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
CS-220ENST00000550700 KDRP35968 1356 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-220ENST00000550700 ADAMTS2O95450 1211 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-220ENST00000550700 CHRNA2Q15822 529 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-220ENST00000550700 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
CS-220ENST00000550700 RUNDC1Q96C34 613 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-220ENST00000550700 AXIN2Q9Y2T1 843 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-220ENST00000550700 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-220ENST00000550700 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-220ENST00000550700 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
CS-220ENST00000550700 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
CS-220ENST00000550700 NGLY1Q96IV0 654 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-220ENST00000550700 BTG4Q9NY30 223 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-220ENST00000550700 SLIT2O94813 1529 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-220ENST00000550700 CRB1P82279 1406 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-220ENST00000550700 NCAPD2Q15021 1401 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-220ENST00000550700 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-220ENST00000550700 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
CS-220ENST00000550700 EYA1Q99502 592 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-220ENST00000550700 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
CS-220ENST00000550700 CARD10Q9BWT7 1032 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-220ENST00000550700 NLRP2Q9NX02 1062 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-220ENST00000550700 SULT6B1Q6IMI4 303 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-220ENST00000550700 UNC5CLQ8IV45 518 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-220ENST00000550700 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
CS-220ENST00000550700 NRAPQ86VF7 1730 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-220ENST00000550700 RGPD2P0DJD1 1756 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-220ENST00000550700 AMOTQ4VCS5 1084 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-220ENST00000550700 NBPF6Q5VWK0 638 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-220ENST00000550700 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-220ENST00000550700 NBPF4Q96M43 638 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-220ENST00000550700 C8orf37Q96NL8 207 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-220ENST00000550700 RSPH6AQ9H0K4 717 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-220ENST00000550700 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP12.3□□□□□ -0.443e-6■□□□□ 8.1
CS-220ENST00000550700 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
CS-220ENST00000550700 STRN4Q9NRL3 753 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-220ENST00000550700 LRP6O75581 1613 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-220ENST00000550700 TATP17735 454 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
CS-220ENST00000550700 PRKAR2BP31323 418 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-220ENST00000550700 LMOD3Q0VAK6 560 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-220ENST00000550700 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
CS-220ENST00000550700 GAS2L2Q8NHY3 880 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-220ENST00000550700 PLEKHF1Q96S99 279 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-220ENST00000550700 USP21Q9UK80 565 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-220ENST00000550700 HMOX1P09601 288 aa12.27□□□□□ -0.45
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