RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548746.5

CS-213, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-213ENST00000548746 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP8.2□□□□□ -1.1
CS-213ENST00000548746 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-213ENST00000548746 BTG4Q9NY30 223 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-213ENST00000548746 ZRANB1Q9UGI0 708 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-213ENST00000548746 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-213ENST00000548746 NSD2O96028 1365 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-213ENST00000548746 CCDC7Q96M83 1385 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-213ENST00000548746 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-213ENST00000548746 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-213ENST00000548746 WASHC2AQ641Q2 1341 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-213ENST00000548746 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-213ENST00000548746 BRWD3Q6RI45 1802 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-213ENST00000548746 RTL1A6NKG5 1358 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-213ENST00000548746 KIF24Q5T7B8 1368 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-213ENST00000548746 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-213ENST00000548746 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
CS-213ENST00000548746 CHRNA2Q15822 529 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-213ENST00000548746 COG3Q96JB2 828 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-213ENST00000548746 CGNL1Q0VF96 1302 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-213ENST00000548746 CRB1P82279 1406 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-213ENST00000548746 PEAK1Q9H792 1746 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-213ENST00000548746 SOCS7O14512 581 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-213ENST00000548746 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-213ENST00000548746 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-213ENST00000548746 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
CS-213ENST00000548746 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
CS-213ENST00000548746 PLEKHG5O94827 1062 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-213ENST00000548746 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
CS-213ENST00000548746 ERBB3P21860 1342 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-213ENST00000548746 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
CS-213ENST00000548746 MAP3K19Q56UN5 1328 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-213ENST00000548746 BARGINQ6ZT62 677 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-213ENST00000548746 WDR17Q8IZU2 1322 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-213ENST00000548746 GGNBP2Q9H3C7 697 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-213ENST00000548746 PANK3Q9H999 370 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-213ENST00000548746 AXIN2Q9Y2T1 843 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-213ENST00000548746 LRRC37A3O60309 1634 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-213ENST00000548746 DISP2A7MBM2 1401 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-213ENST00000548746 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-213ENST00000548746 IP6K1Q92551 441 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-213ENST00000548746 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-213ENST00000548746 NCAPD2Q15021 1401 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-213ENST00000548746 FLT4P35916 1363 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-213ENST00000548746 DCAF8L1A6NGE4 600 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-213ENST00000548746 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
CS-213ENST00000548746 INSRP06213 1382 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-213ENST00000548746 EP400Q96L91 3159 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-213ENST00000548746 RGPD2P0DJD1 1756 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-213ENST00000548746 HOXC9P31274 260 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-213ENST00000548746 TCP11L2Q8N4U5 519 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-213ENST00000548746 POLR3GLQ9BT43 218 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-213ENST00000548746 CARD10Q9BWT7 1032 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-213ENST00000548746 STRN4Q9NRL3 753 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-213ENST00000548746 SOX12O15370 315 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-213ENST00000548746 EVA1CP58658 441 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-213ENST00000548746 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
CS-213ENST00000548746 SEPT12Q8IYM1 358 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-213ENST00000548746 KNSTRNQ9Y448 316 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-213ENST00000548746 BCL9O00512 1426 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-213ENST00000548746 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
CS-213ENST00000548746 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
CS-213ENST00000548746 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
CS-213ENST00000548746 RGPD1P0DJD0 1748 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-213ENST00000548746 SHANK3Q9BYB0 1731 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-213ENST00000548746 TNS2Q63HR2 1409 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-213ENST00000548746 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-213ENST00000548746 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
CS-213ENST00000548746 FBLN1P23142 703 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-213ENST00000548746 AMPHP49418 695 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-213ENST00000548746 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-213ENST00000548746 ANKRD24Q8TF21 1146 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-213ENST00000548746 POLKQ9UBT6 870 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-213ENST00000548746 SBF2Q86WG5 1849 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-213ENST00000548746 PKD1L3Q7Z443 1732 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-213ENST00000548746 ZBTB7CA1YPR0 619 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-213ENST00000548746 KRT27Q7Z3Y8 459 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-213ENST00000548746 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-213ENST00000548746 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
CS-213ENST00000548746 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-213ENST00000548746 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-213ENST00000548746 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-213ENST00000548746 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP8.08□□□□□ -1.123e-10■■■□□ 17.8
CS-213ENST00000548746 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-213ENST00000548746 MEGF6O75095 1541 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-213ENST00000548746 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
CS-213ENST00000548746 MORC1Q86VD1 984 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-213ENST00000548746 CCDC125Q86Z20 511 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-213ENST00000548746 USP35Q9P2H5 1018 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-213ENST00000548746 IL2RBP14784 551 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-213ENST00000548746 NBPF6Q5VWK0 638 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-213ENST00000548746 NBPF4Q96M43 638 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-213ENST00000548746 NLRP2Q9NX02 1062 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-213ENST00000548746 KDRP35968 1356 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-213ENST00000548746 PARD3Q8TEW0 1356 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-213ENST00000548746 IGSF1Q8N6C5 1336 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-213ENST00000548746 NHSQ6T4R5 1651 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-213ENST00000548746 DDB1Q16531 1140 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-213ENST00000548746 FAM196AQ6ZSG2 479 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-213ENST00000548746 A0A0G2JS52 829 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-213ENST00000548746 MYT1Q01538 1121 aa8.04□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 458.8 ms