RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545663.5

CLSTN3-216, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 533 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-216ENST00000545663 GCP02774 474 aa23.03■■□□□ 1.28
CLSTN3-216ENST00000545663 ACEP12821 1306 aa23.02■■□□□ 1.28
CLSTN3-216ENST00000545663 ADGRB1O14514 1584 aa23.01■■□□□ 1.27
CLSTN3-216ENST00000545663 USP19O94966 1318 aa23.01■■□□□ 1.27
CLSTN3-216ENST00000545663 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23■■□□□ 1.27
CLSTN3-216ENST00000545663 NLGN2Q8NFZ4 835 aa22.99■■□□□ 1.27
CLSTN3-216ENST00000545663 HSPA6P17066 643 aa22.98■■□□□ 1.27
CLSTN3-216ENST00000545663 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa22.98■■□□□ 1.27
CLSTN3-216ENST00000545663 ZNF827Q17R98 1081 aa22.97■■□□□ 1.27
CLSTN3-216ENST00000545663 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
CLSTN3-216ENST00000545663 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.27
CLSTN3-216ENST00000545663 BCL9O00512 1426 aa22.96■■□□□ 1.27
CLSTN3-216ENST00000545663 CDK19Q9BWU1 502 aa22.95■■□□□ 1.26
CLSTN3-216ENST00000545663 ATP10DQ9P241 1426 aa22.94■■□□□ 1.26
CLSTN3-216ENST00000545663 NLRP13Q86W25 1043 aa22.94■■□□□ 1.26
CLSTN3-216ENST00000545663 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.93■■□□□ 1.26
CLSTN3-216ENST00000545663 AXIN2Q9Y2T1 843 aa22.93■■□□□ 1.26
CLSTN3-216ENST00000545663 ITSN1Q15811 1721 aa22.92■■□□□ 1.26
CLSTN3-216ENST00000545663 PLEKHG3A1L390 1219 aa22.9■■□□□ 1.26
CLSTN3-216ENST00000545663 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.9■■□□□ 1.26
CLSTN3-216ENST00000545663 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
CLSTN3-216ENST00000545663 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
CLSTN3-216ENST00000545663 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.89■■□□□ 1.25
CLSTN3-216ENST00000545663 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.89■■□□□ 1.25
CLSTN3-216ENST00000545663 PAPPAQ13219 1627 aa22.88■■□□□ 1.25
CLSTN3-216ENST00000545663 AKAP12Q02952 1782 aa22.88■■□□□ 1.25
CLSTN3-216ENST00000545663 WDR17Q8IZU2 1322 aa22.87■■□□□ 1.25
CLSTN3-216ENST00000545663 EXOC5O00471 708 aa22.87■■□□□ 1.25
CLSTN3-216ENST00000545663 POLD1P28340 1107 aa22.87■■□□□ 1.25
CLSTN3-216ENST00000545663 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
CLSTN3-216ENST00000545663 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.87■■□□□ 1.25
CLSTN3-216ENST00000545663 GRIN3BO60391 1043 aa22.86■■□□□ 1.25
CLSTN3-216ENST00000545663 AKT1S1Q96B36 256 aa22.84■■□□□ 1.25
CLSTN3-216ENST00000545663 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.84■■□□□ 1.25
CLSTN3-216ENST00000545663 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.83■■□□□ 1.24
CLSTN3-216ENST00000545663 CAPN15O75808 1086 aa22.82■■□□□ 1.24
CLSTN3-216ENST00000545663 NLRP6P59044 892 aa22.82■■□□□ 1.24
CLSTN3-216ENST00000545663 SLC16A10Q8TF71 515 aa22.82■■□□□ 1.24
CLSTN3-216ENST00000545663 COL18A1P39060 1754 aa22.81■■□□□ 1.24
CLSTN3-216ENST00000545663 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.81■■□□□ 1.24
CLSTN3-216ENST00000545663 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.81■■□□□ 1.24
CLSTN3-216ENST00000545663 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.79■■□□□ 1.24
CLSTN3-216ENST00000545663 NHSQ6T4R5 1651 aa22.78■■□□□ 1.24
CLSTN3-216ENST00000545663 USP6P35125 1406 aa22.77■■□□□ 1.24
CLSTN3-216ENST00000545663 KCNQ4P56696 695 aa22.77■■□□□ 1.24
CLSTN3-216ENST00000545663 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa22.77■■□□□ 1.24
CLSTN3-216ENST00000545663 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.77■■□□□ 1.24
CLSTN3-216ENST00000545663 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.23
CLSTN3-216ENST00000545663 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
CLSTN3-216ENST00000545663 SLIT3O75094 1523 aa22.76■■□□□ 1.23
CLSTN3-216ENST00000545663 ADCY9O60503 1353 aa22.76■■□□□ 1.23
CLSTN3-216ENST00000545663 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.75■■□□□ 1.23
CLSTN3-216ENST00000545663 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
CLSTN3-216ENST00000545663 SOX12O15370 315 aa22.74■■□□□ 1.23
CLSTN3-216ENST00000545663 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.74■■□□□ 1.23
CLSTN3-216ENST00000545663 TNS2Q63HR2 1409 aa22.74■■□□□ 1.23
CLSTN3-216ENST00000545663 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.74■■□□□ 1.23
CLSTN3-216ENST00000545663 ARHGEF25Q86VW2 580 aa22.73■■□□□ 1.23
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CLSTN3-216ENST00000545663 BTAF1O14981 1849 aa22.72■■□□□ 1.23
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CLSTN3-216ENST00000545663 RGPD5Q99666 1765 aa22.71■■□□□ 1.23
CLSTN3-216ENST00000545663 CABP2Q9NPB3 220 aa22.71■■□□□ 1.23
CLSTN3-216ENST00000545663 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CLSTN3-216ENST00000545663 APLP1P51693 650 aa22.69■■□□□ 1.22
CLSTN3-216ENST00000545663 PCNTO95613 3336 aa22.68■■□□□ 1.22
CLSTN3-216ENST00000545663 MSL1Q68DK7 614 aa22.68■■□□□ 1.22
CLSTN3-216ENST00000545663 CABP1Q9NZU7 370 aa22.68■■□□□ 1.22
CLSTN3-216ENST00000545663 CCDC7Q96M83 1385 aa22.66■■□□□ 1.22
CLSTN3-216ENST00000545663 MSH5O43196 834 aa22.66■■□□□ 1.22
CLSTN3-216ENST00000545663 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.66■■□□□ 1.22
CLSTN3-216ENST00000545663 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.66■■□□□ 1.22
CLSTN3-216ENST00000545663 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.66■■□□□ 1.22
CLSTN3-216ENST00000545663 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.65■■□□□ 1.22
CLSTN3-216ENST00000545663 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.64■■□□□ 1.22
CLSTN3-216ENST00000545663 ABCC6O95255 1503 aa22.64■■□□□ 1.21
CLSTN3-216ENST00000545663 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
CLSTN3-216ENST00000545663 PIK3C2AO00443 1686 aa22.64■■□□□ 1.21
CLSTN3-216ENST00000545663 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.63■■□□□ 1.21
CLSTN3-216ENST00000545663 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.61■■□□□ 1.21
CLSTN3-216ENST00000545663 IL2RBP14784 551 aa22.6■■□□□ 1.21
CLSTN3-216ENST00000545663 PRELPP51888 382 aa22.6■■□□□ 1.21
CLSTN3-216ENST00000545663 HTRA3P83110 453 aa22.6■■□□□ 1.21
CLSTN3-216ENST00000545663 TNS4Q8IZW8 715 aa22.6■■□□□ 1.21
CLSTN3-216ENST00000545663 KCNH5Q8NCM2 988 aa22.59■■□□□ 1.21
CLSTN3-216ENST00000545663 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.59■■□□□ 1.21
CLSTN3-216ENST00000545663 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
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CLSTN3-216ENST00000545663 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
CLSTN3-216ENST00000545663 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.55■■□□□ 1.2
CLSTN3-216ENST00000545663 TOMM70O94826 608 aa22.54■■□□□ 1.2
CLSTN3-216ENST00000545663 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.54■■□□□ 1.2
CLSTN3-216ENST00000545663 NFAT5O94916 1531 aa22.53■■□□□ 1.2
CLSTN3-216ENST00000545663 STAC3Q96MF2 364 aa22.52■■□□□ 1.2
CLSTN3-216ENST00000545663 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
CLSTN3-216ENST00000545663 ERBB3P21860 1342 aa22.52■■□□□ 1.2
CLSTN3-216ENST00000545663 KLRG1Q96E93 195 aa22.51■■□□□ 1.19
CLSTN3-216ENST00000545663 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.51■■□□□ 1.19
CLSTN3-216ENST00000545663 JMYQ8N9B5 988 aa22.5■■□□□ 1.19
CLSTN3-216ENST00000545663 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
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