RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533872.5

RPS2-215, Transcript of ribosomal protein S2, human

TSL 5

Gene RPS2, Length 1,114 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS2-215	ENST00000533872	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		33.53	■■■□□ 2.96
RPS2-215	ENST00000533872	FBLN1	P23142	703 aa		33.53	■■■□□ 2.96
RPS2-215	ENST00000533872	RTL1	A6NKG5	1358 aa		33.52	■■■□□ 2.96
RPS2-215	ENST00000533872	VPS72	Q15906	364 aa		33.52	■■■□□ 2.96
RPS2-215	ENST00000533872	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		33.51	■■■□□ 2.95
RPS2-215	ENST00000533872	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		33.5	■■■□□ 2.95
RPS2-215	ENST00000533872	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	33.5	■■■□□ 2.95
RPS2-215	ENST00000533872	MORC1	Q86VD1	984 aa		33.5	■■■□□ 2.95
RPS2-215	ENST00000533872	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	33.5	■■■□□ 2.95
RPS2-215	ENST00000533872	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	33.5	■■■□□ 2.95
RPS2-215	ENST00000533872	PEAK1	Q9H792	1746 aa		33.48	■■■□□ 2.95
RPS2-215	ENST00000533872	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	33.48	■■■□□ 2.95
RPS2-215	ENST00000533872	IP6K1	Q92551	441 aa		33.48	■■■□□ 2.95
RPS2-215	ENST00000533872	GLI3	P10071	1580 aa		33.47	■■■□□ 2.95
RPS2-215	ENST00000533872	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	33.47	■■■□□ 2.95
RPS2-215	ENST00000533872	STRN4	Q9NRL3	753 aa		33.47	■■■□□ 2.95
RPS2-215	ENST00000533872	AMPH	P49418	695 aa		33.46	■■■□□ 2.95
RPS2-215	ENST00000533872	EVA1C	P58658	441 aa		33.46	■■■□□ 2.95
RPS2-215	ENST00000533872	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	33.46	■■■□□ 2.95
RPS2-215	ENST00000533872	RXRB	P28702	533 aa		33.45	■■■□□ 2.95
RPS2-215	ENST00000533872	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	33.45	■■■□□ 2.95
RPS2-215	ENST00000533872	HOXC9	P31274	260 aa		33.44	■■■□□ 2.94
RPS2-215	ENST00000533872	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	33.44	■■■□□ 2.94
RPS2-215	ENST00000533872	FLT4	P35916	1363 aa		33.44	■■■□□ 2.94
RPS2-215	ENST00000533872	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	33.43	■■■□□ 2.94
RPS2-215	ENST00000533872	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		33.42	■■■□□ 2.94
RPS2-215	ENST00000533872	ERBB3	P21860	1342 aa		33.42	■■■□□ 2.94
RPS2-215	ENST00000533872	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		33.42	■■■□□ 2.94
RPS2-215	ENST00000533872	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		33.42	■■■□□ 2.94
RPS2-215	ENST00000533872	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		33.42	■■■□□ 2.94
RPS2-215	ENST00000533872	CRB1	P82279	1406 aa		33.42	■■■□□ 2.94
RPS2-215	ENST00000533872	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	33.42	■■■□□ 2.94
RPS2-215	ENST00000533872	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	33.41	■■■□□ 2.94
RPS2-215	ENST00000533872	POLK	Q9UBT6	870 aa		33.41	■■■□□ 2.94
RPS2-215	ENST00000533872	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	33.41	■■■□□ 2.94
RPS2-215	ENST00000533872	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	33.41	■■■□□ 2.94
RPS2-215	ENST00000533872	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		33.38	■■■□□ 2.93
RPS2-215	ENST00000533872	INSR	P06213	1382 aa		33.37	■■■□□ 2.93
RPS2-215	ENST00000533872	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		33.36	■■■□□ 2.93
RPS2-215	ENST00000533872	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		33.35	■■■□□ 2.93
RPS2-215	ENST00000533872	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	33.34	■■■□□ 2.93
RPS2-215	ENST00000533872	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		33.34	■■■□□ 2.93
RPS2-215	ENST00000533872	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	33.33	■■■□□ 2.93
RPS2-215	ENST00000533872	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		33.33	■■■□□ 2.93
RPS2-215	ENST00000533872	RGS12	O14924	1447 aa		33.32	■■■□□ 2.92
RPS2-215	ENST00000533872	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		33.3	■■■□□ 2.92
RPS2-215	ENST00000533872	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	33.3	■■■□□ 2.92
RPS2-215	ENST00000533872	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		33.3	■■■□□ 2.92
RPS2-215	ENST00000533872	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		33.29	■■■□□ 2.92
RPS2-215	ENST00000533872	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	33.29	■■■□□ 2.92
RPS2-215	ENST00000533872	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		33.29	■■■□□ 2.92
RPS2-215	ENST00000533872	USP35	Q9P2H5	1018 aa		33.29	■■■□□ 2.92
RPS2-215	ENST00000533872	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		33.28	■■■□□ 2.92
RPS2-215	ENST00000533872	ILDR2	Q71H61	639 aa		33.28	■■■□□ 2.92
RPS2-215	ENST00000533872	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	33.28	■■■□□ 2.92
RPS2-215	ENST00000533872	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		33.28	■■■□□ 2.92
RPS2-215	ENST00000533872	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		33.27	■■■□□ 2.92
RPS2-215	ENST00000533872	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	33.26	■■■□□ 2.91
RPS2-215	ENST00000533872	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		33.26	■■■□□ 2.91
RPS2-215	ENST00000533872	MTHFS	P49914	203 aa		33.23	■■■□□ 2.91
RPS2-215	ENST00000533872	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	33.22	■■■□□ 2.91
RPS2-215	ENST00000533872	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		33.2	■■■□□ 2.91
RPS2-215	ENST00000533872	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		33.2	■■■□□ 2.91
RPS2-215	ENST00000533872	DISP2	A7MBM2	1401 aa		33.19	■■■□□ 2.9
RPS2-215	ENST00000533872	PPP2R1A	P30153	589 aa		33.19	■■■□□ 2.9
RPS2-215	ENST00000533872	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	33.18	■■■□□ 2.9
RPS2-215	ENST00000533872	RALBP1	Q15311	655 aa		33.18	■■■□□ 2.9
RPS2-215	ENST00000533872	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		33.17	■■■□□ 2.9
RPS2-215	ENST00000533872	NBPF4	Q96M43	638 aa		33.17	■■■□□ 2.9
RPS2-215	ENST00000533872	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	33.17	■■■□□ 2.9
RPS2-215	ENST00000533872	NCAPD2	Q15021	1401 aa		33.17	■■■□□ 2.9
RPS2-215	ENST00000533872		A0A0G2JS52	829 aa		33.16	■■■□□ 2.9
RPS2-215	ENST00000533872	MYT1	Q01538	1121 aa		33.16	■■■□□ 2.9
RPS2-215	ENST00000533872	LRRC37A3	O60309	1634 aa		33.15	■■■□□ 2.9
RPS2-215	ENST00000533872	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	33.14	■■■□□ 2.9
RPS2-215	ENST00000533872	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		33.12	■■■□□ 2.89
RPS2-215	ENST00000533872	IL2RB	P14784	551 aa		33.1	■■■□□ 2.89
RPS2-215	ENST00000533872	EYA1	Q99502	592 aa		33.1	■■■□□ 2.89
RPS2-215	ENST00000533872	IL13	P35225	146 aa		33.09	■■■□□ 2.89
RPS2-215	ENST00000533872	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		33.09	■■■□□ 2.89
RPS2-215	ENST00000533872	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		33.08	■■■□□ 2.89
RPS2-215	ENST00000533872	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	33.08	■■■□□ 2.89
RPS2-215	ENST00000533872	CFAP53	Q96M91	514 aa		33.07	■■■□□ 2.88
RPS2-215	ENST00000533872	TNS2	Q63HR2	1409 aa		33.06	■■■□□ 2.88
RPS2-215	ENST00000533872	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	33.06	■■■□□ 2.88
RPS2-215	ENST00000533872	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		33.06	■■■□□ 2.88
RPS2-215	ENST00000533872	MEGF6	O75095	1541 aa		33.06	■■■□□ 2.88
RPS2-215	ENST00000533872	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	33.05	■■■□□ 2.88
RPS2-215	ENST00000533872	DDB1	Q16531	1140 aa		33.05	■■■□□ 2.88
RPS2-215	ENST00000533872	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		33.03	■■■□□ 2.88
RPS2-215	ENST00000533872	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		33.02	■■■□□ 2.88
RPS2-215	ENST00000533872	PDE3B	Q13370	1112 aa		33	■■■□□ 2.87
RPS2-215	ENST00000533872	KDR	P35968	1356 aa		32.99	■■■□□ 2.87
RPS2-215	ENST00000533872	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		32.99	■■■□□ 2.87
RPS2-215	ENST00000533872	EXOC5	O00471	708 aa		32.99	■■■□□ 2.87
RPS2-215	ENST00000533872	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		32.98	■■■□□ 2.87
RPS2-215	ENST00000533872	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		32.98	■■■□□ 2.87
RPS2-215	ENST00000533872	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	32.97	■■■□□ 2.87
RPS2-215	ENST00000533872	ANP32C	O43423	234 aa		32.93	■■■□□ 2.86
RPS2-215	ENST00000533872	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		32.93	■■■□□ 2.86

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 130.3 ms