RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533653.5

GMDS-AS1-211, humanhuman

TSL 2

Gene GMDS-AS1, Length 568 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-211ENST00000533653 BTG4Q9NY30 223 aa22.66■■□□□ 1.22
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.65■■□□□ 1.22
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.65■■□□□ 1.22
GMDS-AS1-211ENST00000533653 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NSD2O96028 1365 aa22.64■■□□□ 1.22
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ILDR2Q71H61 639 aa22.64■■□□□ 1.21
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ARHGEF25Q86VW2 580 aa22.64■■□□□ 1.21
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FYB1O15117 783 aa22.63■■□□□ 1.21
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RGPD5Q99666 1765 aa22.63■■□□□ 1.21
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZRANB1Q9UGI0 708 aa22.62■■□□□ 1.21
GMDS-AS1-211ENST00000533653 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.61■■□□□ 1.21
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CHRNA2Q15822 529 aa22.61■■□□□ 1.21
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PANK3Q9H999 370 aa22.61■■□□□ 1.21
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RGS12O14924 1447 aa22.6■■□□□ 1.21
GMDS-AS1-211ENST00000533653 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RTL1A6NKG5 1358 aa22.59■■□□□ 1.21
GMDS-AS1-211ENST00000533653 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.58■■□□□ 1.21
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.58■■□□□ 1.21
GMDS-AS1-211ENST00000533653 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa22.58■■□□□ 1.2
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.57■■□□□ 1.2
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa22.57■■□□□ 1.2
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.57■■□□□ 1.2
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SOX12O15370 315 aa22.56■■□□□ 1.2
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CRB1P82279 1406 aa22.56■■□□□ 1.2
GMDS-AS1-211ENST00000533653 EVA1CP58658 441 aa22.53■■□□□ 1.2
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.53■■□□□ 1.2
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.53■■□□□ 1.2
GMDS-AS1-211ENST00000533653 WDR17Q8IZU2 1322 aa22.53■■□□□ 1.2
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.52■■□□□ 1.2
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.51■■□□□ 1.19
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
GMDS-AS1-211ENST00000533653 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
GMDS-AS1-211ENST00000533653 STRN4Q9NRL3 753 aa22.51■■□□□ 1.19
GMDS-AS1-211ENST00000533653 BRWD3Q6RI45 1802 aa22.51■■□□□ 1.19
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.51■■□□□ 1.19
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PEAK1Q9H792 1746 aa22.51■■□□□ 1.19
GMDS-AS1-211ENST00000533653 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ERBB3P21860 1342 aa22.5■■□□□ 1.19
GMDS-AS1-211ENST00000533653 IP6K1Q92551 441 aa22.49■■□□□ 1.19
GMDS-AS1-211ENST00000533653 AXIN2Q9Y2T1 843 aa22.49■■□□□ 1.19
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FLT4P35916 1363 aa22.49■■□□□ 1.19
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
GMDS-AS1-211ENST00000533653 BARGINQ6ZT62 677 aa22.48■■□□□ 1.19
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
GMDS-AS1-211ENST00000533653 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SOCS7O14512 581 aa22.46■■□□□ 1.19
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.46■■□□□ 1.19
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HOXC9P31274 260 aa22.45■■□□□ 1.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 AMPHP49418 695 aa22.45■■□□□ 1.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LRRC37A3O60309 1634 aa22.44■■□□□ 1.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 INSRP06213 1382 aa22.44■■□□□ 1.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa22.44■■□□□ 1.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.43■■□□□ 1.18
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GMDS-AS1-211ENST00000533653 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.43■■□□□ 1.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SEPT12Q8IYM1 358 aa22.42■■□□□ 1.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.42■■□□□ 1.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 EP400Q96L91 3159 aa22.41■■□□□ 1.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DISP2A7MBM2 1401 aa22.4■■□□□ 1.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.4■■□□□ 1.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MORC1Q86VD1 984 aa22.4■■□□□ 1.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FBLN1P23142 703 aa22.38■■□□□ 1.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 USP35Q9P2H5 1018 aa22.38■■□□□ 1.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 A0A0G2JS52 829 aa22.37■■□□□ 1.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MYT1Q01538 1121 aa22.37■■□□□ 1.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 POLKQ9UBT6 870 aa22.37■■□□□ 1.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.37■■□□□ 1.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.35■■□□□ 1.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NCAPD2Q15021 1401 aa22.34■■□□□ 1.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TNS2Q63HR2 1409 aa22.34■■□□□ 1.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.34■■□□□ 1.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.33■■□□□ 1.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RGPD1P0DJD0 1748 aa22.31■■□□□ 1.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.3■■□□□ 1.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 IL2RBP14784 551 aa22.29■■□□□ 1.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DDB1Q16531 1140 aa22.28■■□□□ 1.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.28■■□□□ 1.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 BCL9O00512 1426 aa22.27■■□□□ 1.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PDE3BQ13370 1112 aa22.27■■□□□ 1.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.27■■□□□ 1.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.27■■□□□ 1.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SBF2Q86WG5 1849 aa22.25■■□□□ 1.15
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CCDC125Q86Z20 511 aa22.25■■□□□ 1.15
GMDS-AS1-211ENST00000533653 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.15
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MEGF6O75095 1541 aa22.25■■□□□ 1.15
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.24■■□□□ 1.15
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NBPF4Q96M43 638 aa22.24■■□□□ 1.15
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