RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533249.5

PKP3-210, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 3

Gene PKP3, Length 1,111 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-210ENST00000533249 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa32.55■■■□□ 2.8
PKP3-210ENST00000533249 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa32.55■■■□□ 2.8
PKP3-210ENST00000533249 OVOS2Q6IE36 1432 aa32.55■■■□□ 2.8
PKP3-210ENST00000533249 DDB1Q16531 1140 aa32.55■■■□□ 2.8
PKP3-210ENST00000533249 CARD11Q9BXL7 1154 aa32.54■■■□□ 2.8
PKP3-210ENST00000533249 RGPD5Q99666 1765 aa32.54■■■□□ 2.8
PKP3-210ENST00000533249 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP32.53■■■□□ 2.8
PKP3-210ENST00000533249 PEAK1Q9H792 1746 aa32.53■■■□□ 2.8
PKP3-210ENST00000533249 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa32.52■■■□□ 2.8
PKP3-210ENST00000533249 WNK3Q9BYP7 1800 aa32.51■■■□□ 2.8
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PKP3-210ENST00000533249 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP32.49■■■□□ 2.79
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PKP3-210ENST00000533249 TONSLQ96HA7 1378 aa32.45■■■□□ 2.79
PKP3-210ENST00000533249 TMC1Q8TDI8 760 aa32.45■■■□□ 2.79
PKP3-210ENST00000533249 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP32.45■■■□□ 2.79
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PKP3-210ENST00000533249 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP32.44■■■□□ 2.78
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PKP3-210ENST00000533249 NME9Q86XW9 330 aa32.42■■■□□ 2.78
PKP3-210ENST00000533249 CD163L1Q9NR16 1453 aa32.42■■■□□ 2.78
PKP3-210ENST00000533249 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP32.4■■■□□ 2.78
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PKP3-210ENST00000533249 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa32.39■■■□□ 2.78
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PKP3-210ENST00000533249 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa32.38■■■□□ 2.77
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PKP3-210ENST00000533249 BCL9O00512 1426 aa32.34■■■□□ 2.77
PKP3-210ENST00000533249 LTN1O94822 1766 aa32.33■■■□□ 2.77
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PKP3-210ENST00000533249 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP32.28■■■□□ 2.76
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PKP3-210ENST00000533249 ANKRD24Q8TF21 1146 aa32.26■■■□□ 2.75
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PKP3-210ENST00000533249 TESK2Q96S53 571 aa32.22■■■□□ 2.75
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PKP3-210ENST00000533249 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP31.93■■■□□ 2.7
PKP3-210ENST00000533249 MEGF6O75095 1541 aa31.93■■■□□ 2.7
PKP3-210ENST00000533249 DOT1LQ8TEK3 1739 aa31.92■■■□□ 2.7
PKP3-210ENST00000533249 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP31.91■■■□□ 2.7
PKP3-210ENST00000533249 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP31.91■■■□□ 2.7
PKP3-210ENST00000533249 SHANK3Q9BYB0 1731 aa31.9■■■□□ 2.7
PKP3-210ENST00000533249 NBPF6Q5VWK0 638 aa31.9■■■□□ 2.7
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