RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523334.1

HDAC2-215, Transcript of histone deacetylase 2, human

TSL 2

Gene HDAC2, Length 4,810 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC2-215	ENST00000523334	IL13	P35225	146 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	DCTN1	Q14203	1278 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	DLC1	Q96QB1	1528 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	CFAP44	Q96MT7	982 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	FLT4	P35916	1363 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	HMMR	O75330	724 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	NBR1	Q14596	966 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	MCM10	Q7L590	875 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	TRIM27	P14373	513 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	BACH2	Q9BYV9	841 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	PIK3R4	Q99570	1358 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	IFT172	Q9UG01	1749 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	FAM83G	A6ND36	823 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	MED14	O60244	1454 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	MBIP	Q9NS73	344 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	APBB1	O00213	710 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	NECTIN2	Q92692	538 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	TECPR2	O15040	1411 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	USP6	P35125	1406 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	SLC4A2	P04920	1241 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	CASC1	Q6TDU7	716 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	SKAP1	Q86WV1	359 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	SBNO1	A3KN83	1393 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	RLBP1	P12271	317 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	EYA1	Q99502	592 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	LNPK	Q9C0E8	428 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	VAMP4	O75379	141 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	TNN	Q9UQP3	1299 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	MYOM1	P52179	1685 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334		A0A0G2JS52	829 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	IGHD	P01880	384 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	HOXC9	P31274	260 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	ORAI2	Q96SN7	254 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	HSPA2	P54652	639 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	TSPYL6	Q8N831	410 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	GC	P02774	474 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	IP6K1	Q92551	441 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	GCC1	Q96CN9	775 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	PTCH1	Q13635	1447 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	GNAI3	P08754	354 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	EVA1C	P58658	441 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HDAC2-215	ENST00000523334	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		4.84	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms