RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517924.5

LAPTM4B-202, Transcript of lysosomal protein transmembrane 4 beta, humanhuman

TSL 5

Gene LAPTM4B, Length 618 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4B-202ENST00000517924 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP34.67■■■■□ 3.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 LTN1O94822 1766 aa34.65■■■■□ 3.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 CRB1P82279 1406 aa34.64■■■■□ 3.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 NINLQ9Y2I6 1382 aa34.63■■■■□ 3.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 TMF1P82094 1093 aa34.62■■■■□ 3.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP34.61■■■■□ 3.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 WNK3Q9BYP7 1800 aa34.6■■■■□ 3.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 SLC24A1O60721 1099 aa34.6■■■■□ 3.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 RGPD1P0DJD0 1748 aa34.6■■■■□ 3.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP34.59■■■■□ 3.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa34.58■■■■□ 3.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 OVOS2Q6IE36 1432 aa34.58■■■■□ 3.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP34.58■■■■□ 3.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP34.58■■■■□ 3.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 WDR17Q8IZU2 1322 aa34.57■■■■□ 3.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa34.57■■■■□ 3.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 MYOM1P52179 1685 aa34.55■■■■□ 3.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa34.55■■■■□ 3.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 LRRC37A3O60309 1634 aa34.54■■■■□ 3.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 ABCC6O95255 1503 aa34.54■■■■□ 3.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 PDE3BQ13370 1112 aa34.51■■■■□ 3.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa34.5■■■■□ 3.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 TRIM37O94972 964 aa34.48■■■■□ 3.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 FAM196AQ6ZSG2 479 aa34.48■■■■□ 3.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 BAG6P46379 1132 aa34.46■■■■□ 3.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 PEAK1Q9H792 1746 aa34.45■■■■□ 3.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 CARD10Q9BWT7 1032 aa34.45■■■■□ 3.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 FBLN1P23142 703 aa34.44■■■■□ 3.1
LAPTM4B-202ENST00000517924 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP34.44■■■■□ 3.1
LAPTM4B-202ENST00000517924 CDCA8Q53HL2 280 aa34.44■■■■□ 3.1
LAPTM4B-202ENST00000517924 KIF20BQ96Q89 1820 aa34.44■■■■□ 3.1
LAPTM4B-202ENST00000517924 ERBB3P21860 1342 aa34.42■■■■□ 3.1
LAPTM4B-202ENST00000517924 COG3Q96JB2 828 aa34.42■■■■□ 3.1
LAPTM4B-202ENST00000517924 DISP2A7MBM2 1401 aa34.41■■■■□ 3.1
LAPTM4B-202ENST00000517924 SBF2Q86WG5 1849 aa34.41■■■■□ 3.1
LAPTM4B-202ENST00000517924 FYB1O15117 783 aa34.39■■■■□ 3.1
LAPTM4B-202ENST00000517924 DDB1Q16531 1140 aa34.39■■■■□ 3.1
LAPTM4B-202ENST00000517924 GGNBP2Q9H3C7 697 aa34.39■■■■□ 3.1
LAPTM4B-202ENST00000517924 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP34.37■■■■□ 3.09
LAPTM4B-202ENST00000517924 ANKRD24Q8TF21 1146 aa34.37■■■■□ 3.09
LAPTM4B-202ENST00000517924 CARD14Q9BXL6 1004 aa34.37■■■■□ 3.09
LAPTM4B-202ENST00000517924 NLRP2Q9NX02 1062 aa34.36■■■■□ 3.09
LAPTM4B-202ENST00000517924 CCDC7Q96M83 1385 aa34.36■■■■□ 3.09
LAPTM4B-202ENST00000517924 MAP3K19Q56UN5 1328 aa34.35■■■■□ 3.09
LAPTM4B-202ENST00000517924 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa34.34■■■■□ 3.09
LAPTM4B-202ENST00000517924 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP34.34■■■■□ 3.09
LAPTM4B-202ENST00000517924 IP6K1Q92551 441 aa34.34■■■■□ 3.09
LAPTM4B-202ENST00000517924 RGPD2P0DJD1 1756 aa34.34■■■■□ 3.09
LAPTM4B-202ENST00000517924 APBA3O96018 575 aa34.33■■■■□ 3.09
LAPTM4B-202ENST00000517924 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP34.33■■■■□ 3.09
LAPTM4B-202ENST00000517924 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP34.32■■■■□ 3.08
LAPTM4B-202ENST00000517924 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP34.32■■■■□ 3.08
LAPTM4B-202ENST00000517924 NSD3Q9BZ95 1437 aa34.31■■■■□ 3.08
LAPTM4B-202ENST00000517924 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP34.31■■■■□ 3.08
LAPTM4B-202ENST00000517924 CAMKK2Q96RR4 588 aa34.31■■■■□ 3.08
LAPTM4B-202ENST00000517924 POLR3GLQ9BT43 218 aa34.31■■■■□ 3.08
LAPTM4B-202ENST00000517924 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP34.29■■■■□ 3.08
LAPTM4B-202ENST00000517924 HOXC9P31274 260 aa34.29■■■■□ 3.08
LAPTM4B-202ENST00000517924 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP34.29■■■■□ 3.08
LAPTM4B-202ENST00000517924 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa34.28■■■■□ 3.08
LAPTM4B-202ENST00000517924 RREB1Q92766 1687 aa34.28■■■■□ 3.08
LAPTM4B-202ENST00000517924 PTF1AQ7RTS3 328 aa34.27■■■■□ 3.08
LAPTM4B-202ENST00000517924 AMPHP49418 695 aa34.26■■■■□ 3.08
LAPTM4B-202ENST00000517924 TNS2Q63HR2 1409 aa34.26■■■■□ 3.07
LAPTM4B-202ENST00000517924 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP34.25■■■■□ 3.07
LAPTM4B-202ENST00000517924 EXOC5O00471 708 aa34.24■■■■□ 3.07
LAPTM4B-202ENST00000517924 NUP188Q5SRE5 1749 aa34.24■■■■□ 3.07
LAPTM4B-202ENST00000517924 IL2RBP14784 551 aa34.22■■■■□ 3.07
LAPTM4B-202ENST00000517924 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP34.2■■■■□ 3.07
LAPTM4B-202ENST00000517924 RTL1A6NKG5 1358 aa34.19■■■■□ 3.06
LAPTM4B-202ENST00000517924 BCL9O00512 1426 aa34.19■■■■□ 3.06
LAPTM4B-202ENST00000517924 PARD3Q8TEW0 1356 aa34.17■■■■□ 3.06
LAPTM4B-202ENST00000517924 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP34.15■■■■□ 3.06
LAPTM4B-202ENST00000517924 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP34.15■■■■□ 3.06
LAPTM4B-202ENST00000517924 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa34.15■■■■□ 3.06
LAPTM4B-202ENST00000517924 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP34.14■■■■□ 3.06
LAPTM4B-202ENST00000517924 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP34.14■■■■□ 3.06
LAPTM4B-202ENST00000517924 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa34.13■■■■□ 3.05
LAPTM4B-202ENST00000517924 KAT6BQ8WYB5 2073 aa34.12■■■■□ 3.05
LAPTM4B-202ENST00000517924 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa34.12■■■■□ 3.05
LAPTM4B-202ENST00000517924 SHANK3Q9BYB0 1731 aa34.11■■■■□ 3.05
LAPTM4B-202ENST00000517924 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa34.11■■■■□ 3.05
LAPTM4B-202ENST00000517924 NHSQ6T4R5 1651 aa34.11■■■■□ 3.05
LAPTM4B-202ENST00000517924 CGNL1Q0VF96 1302 aa34.1■■■■□ 3.05
LAPTM4B-202ENST00000517924 KCNQ2O43526 872 aa34.1■■■■□ 3.05
LAPTM4B-202ENST00000517924 NBPF6Q5VWK0 638 aa34.1■■■■□ 3.05
LAPTM4B-202ENST00000517924 NBPF4Q96M43 638 aa34.1■■■■□ 3.05
LAPTM4B-202ENST00000517924 USHBP1Q8N6Y0 703 aa34.09■■■■□ 3.05
LAPTM4B-202ENST00000517924 MEGF6O75095 1541 aa34.09■■■■□ 3.05
LAPTM4B-202ENST00000517924 ACSBG1Q96GR2 724 aa34.08■■■■□ 3.05
LAPTM4B-202ENST00000517924 PANK3Q9H999 370 aa34.08■■■■□ 3.05
LAPTM4B-202ENST00000517924 FLT4P35916 1363 aa34.08■■■■□ 3.05
LAPTM4B-202ENST00000517924 INSRP06213 1382 aa34.07■■■■□ 3.04
LAPTM4B-202ENST00000517924 PLSCR1O15162 318 aa34.06■■■■□ 3.04
LAPTM4B-202ENST00000517924 LRP5O75197 1615 aa34.05■■■■□ 3.04
LAPTM4B-202ENST00000517924 BTAF1O14981 1849 aa34.04■■■■□ 3.04
LAPTM4B-202ENST00000517924 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
LAPTM4B-202ENST00000517924 KIF24Q5T7B8 1368 aa34.03■■■■□ 3.04
LAPTM4B-202ENST00000517924 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP34.03■■■■□ 3.04
LAPTM4B-202ENST00000517924 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP34.02■■■■□ 3.04
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