RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516162.1

RNU6-1333P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1333, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1333P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CCDC116Q8IYX3 515 aa5.06□□□□□ -1.6
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RNU6-1333P-201ENST00000516162 AGERQ15109 404 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NUTM1Q86Y26 1132 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PRR7Q8TB68 274 aa5.05□□□□□ -1.6
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RNU6-1333P-201ENST00000516162 IRF6O14896 467 aa4.93□□□□□ -1.62
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RNU6-1333P-201ENST00000516162 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
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RNU6-1333P-201ENST00000516162 GATA4P43694 442 aa4.9□□□□□ -1.63
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RNU6-1333P-201ENST00000516162 EDARADDQ8WWZ3 215 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ADH1AP07327 375 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RHOQP17081 205 aa4.89□□□□□ -1.63
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