RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
UBE2B-208ENST00000511807 CARD11Q9BXL7 1154 aa15.89■□□□□ 0.13
UBE2B-208ENST00000511807 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa15.89■□□□□ 0.13
UBE2B-208ENST00000511807 PARD3Q8TEW0 1356 aa15.88■□□□□ 0.13
UBE2B-208ENST00000511807 AXIN2Q9Y2T1 843 aa15.87■□□□□ 0.13
UBE2B-208ENST00000511807 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa15.86■□□□□ 0.13
UBE2B-208ENST00000511807 DDB1Q16531 1140 aa15.86■□□□□ 0.13
UBE2B-208ENST00000511807 KCNH5Q8NCM2 988 aa15.86■□□□□ 0.13
UBE2B-208ENST00000511807 TTC21AQ8NDW8 1320 aa15.86■□□□□ 0.13
UBE2B-208ENST00000511807 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
UBE2B-208ENST00000511807 PIK3C2AO00443 1686 aa15.86■□□□□ 0.13
UBE2B-208ENST00000511807 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
UBE2B-208ENST00000511807 NBPF14Q5TI25 921 aa15.85■□□□□ 0.13
UBE2B-208ENST00000511807 ARHGEF25Q86VW2 580 aa15.85■□□□□ 0.13
UBE2B-208ENST00000511807 WDR17Q8IZU2 1322 aa15.85■□□□□ 0.13
UBE2B-208ENST00000511807 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
UBE2B-208ENST00000511807 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa15.84■□□□□ 0.13
UBE2B-208ENST00000511807 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa15.84■□□□□ 0.13
UBE2B-208ENST00000511807 OVOS2Q6IE36 1432 aa15.84■□□□□ 0.13
UBE2B-208ENST00000511807 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP15.83■□□□□ 0.12
UBE2B-208ENST00000511807 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP15.83■□□□□ 0.12
UBE2B-208ENST00000511807 TMC1Q8TDI8 760 aa15.82■□□□□ 0.12
UBE2B-208ENST00000511807 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
UBE2B-208ENST00000511807 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
UBE2B-208ENST00000511807 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa15.8■□□□□ 0.12
UBE2B-208ENST00000511807 CARD10Q9BWT7 1032 aa15.8■□□□□ 0.12
UBE2B-208ENST00000511807 LRRC37A3O60309 1634 aa15.79■□□□□ 0.12
UBE2B-208ENST00000511807 USP47Q96K76 1375 aa15.79■□□□□ 0.12
UBE2B-208ENST00000511807 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
UBE2B-208ENST00000511807 NME9Q86XW9 330 aa15.79■□□□□ 0.12
UBE2B-208ENST00000511807 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
UBE2B-208ENST00000511807 COL18A1P39060 1754 aa15.79■□□□□ 0.12
UBE2B-208ENST00000511807 PTF1AQ7RTS3 328 aa15.78■□□□□ 0.12
UBE2B-208ENST00000511807 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
UBE2B-208ENST00000511807 RREB1Q92766 1687 aa15.78■□□□□ 0.12
UBE2B-208ENST00000511807 NFAT5O94916 1531 aa15.78■□□□□ 0.12
UBE2B-208ENST00000511807 AKAP12Q02952 1782 aa15.77■□□□□ 0.12
UBE2B-208ENST00000511807 EXOC5O00471 708 aa15.77■□□□□ 0.12
UBE2B-208ENST00000511807 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
UBE2B-208ENST00000511807 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa15.77■□□□□ 0.12
UBE2B-208ENST00000511807 NUP188Q5SRE5 1749 aa15.77■□□□□ 0.11
UBE2B-208ENST00000511807 CCDC7Q96M83 1385 aa15.76■□□□□ 0.11
UBE2B-208ENST00000511807 PLSCR1O15162 318 aa15.76■□□□□ 0.11
UBE2B-208ENST00000511807 SLC24A1O60721 1099 aa15.76■□□□□ 0.11
UBE2B-208ENST00000511807 PEAK1Q9H792 1746 aa15.76■□□□□ 0.11
UBE2B-208ENST00000511807 USP31Q70CQ4 1352 aa15.75■□□□□ 0.11
UBE2B-208ENST00000511807 NLRP2Q9NX02 1062 aa15.75■□□□□ 0.11
UBE2B-208ENST00000511807 TERF2IPQ9NYB0 399 aa15.75■□□□□ 0.11
UBE2B-208ENST00000511807 CD163L1Q9NR16 1453 aa15.75■□□□□ 0.11
UBE2B-208ENST00000511807 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa15.74■□□□□ 0.11
UBE2B-208ENST00000511807 SPON1Q9HCB6 807 aa15.74■□□□□ 0.11
UBE2B-208ENST00000511807 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
UBE2B-208ENST00000511807 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
UBE2B-208ENST00000511807 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
UBE2B-208ENST00000511807 A0A1W2PP64 1363 aa15.73■□□□□ 0.11
UBE2B-208ENST00000511807 ERBB3P21860 1342 aa15.72■□□□□ 0.11
UBE2B-208ENST00000511807 MON2Q7Z3U7 1717 aa15.72■□□□□ 0.11
UBE2B-208ENST00000511807 BCL9O00512 1426 aa15.72■□□□□ 0.11
UBE2B-208ENST00000511807 KCNQ2O43526 872 aa15.72■□□□□ 0.11
UBE2B-208ENST00000511807 ANKRD24Q8TF21 1146 aa15.72■□□□□ 0.11
UBE2B-208ENST00000511807 ABCC6O95255 1503 aa15.72■□□□□ 0.11
UBE2B-208ENST00000511807 TNS2Q63HR2 1409 aa15.71■□□□□ 0.11
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
UBE2B-208ENST00000511807 PROM2Q8N271 834 aa15.7■□□□□ 0.1
UBE2B-208ENST00000511807 WNK3Q9BYP7 1800 aa15.7■□□□□ 0.1
UBE2B-208ENST00000511807 RGPD5Q99666 1765 aa15.7■□□□□ 0.1
UBE2B-208ENST00000511807 IL2RBP14784 551 aa15.69■□□□□ 0.1
UBE2B-208ENST00000511807 TXNRD1Q16881 649 aa15.69■□□□□ 0.1
UBE2B-208ENST00000511807 ACSBG1Q96GR2 724 aa15.69■□□□□ 0.1
UBE2B-208ENST00000511807 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
UBE2B-208ENST00000511807 TMF1P82094 1093 aa15.68■□□□□ 0.1
UBE2B-208ENST00000511807 TESK2Q96S53 571 aa15.68■□□□□ 0.1
UBE2B-208ENST00000511807 STK32BQ9NY57 414 aa15.68■□□□□ 0.1
UBE2B-208ENST00000511807 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
UBE2B-208ENST00000511807 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
UBE2B-208ENST00000511807 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
UBE2B-208ENST00000511807 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa15.67■□□□□ 0.1
UBE2B-208ENST00000511807 SBF2Q86WG5 1849 aa15.66■□□□□ 0.1
UBE2B-208ENST00000511807 ZBTB7AO95365 584 aa15.66■□□□□ 0.1
UBE2B-208ENST00000511807 CDCA8Q53HL2 280 aa15.66■□□□□ 0.1
UBE2B-208ENST00000511807 COG3Q96JB2 828 aa15.66■□□□□ 0.1
UBE2B-208ENST00000511807 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
UBE2B-208ENST00000511807 USP54Q70EL1 1684 aa15.66■□□□□ 0.1
UBE2B-208ENST00000511807 NINLQ9Y2I6 1382 aa15.65■□□□□ 0.1
UBE2B-208ENST00000511807 IP6K1Q92551 441 aa15.65■□□□□ 0.1
UBE2B-208ENST00000511807 SLC15A2Q16348 729 aa15.64■□□□□ 0.09
UBE2B-208ENST00000511807 DCAF8L1A6NGE4 600 aa15.63■□□□□ 0.09
UBE2B-208ENST00000511807 FBLN1P23142 703 aa15.63■□□□□ 0.09
UBE2B-208ENST00000511807 AMPHP49418 695 aa15.63■□□□□ 0.09
UBE2B-208ENST00000511807 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
UBE2B-208ENST00000511807 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
UBE2B-208ENST00000511807 MAP3K19Q56UN5 1328 aa15.63■□□□□ 0.09
UBE2B-208ENST00000511807 LTN1O94822 1766 aa15.62■□□□□ 0.09
UBE2B-208ENST00000511807 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa15.61■□□□□ 0.09
UBE2B-208ENST00000511807 NHSQ6T4R5 1651 aa15.6■□□□□ 0.09
UBE2B-208ENST00000511807 YY1P25490 414 aa15.6■□□□□ 0.09
UBE2B-208ENST00000511807 HOXC9P31274 260 aa15.6■□□□□ 0.09
UBE2B-208ENST00000511807 PTGER2P43116 358 aa15.59■□□□□ 0.09
UBE2B-208ENST00000511807 CASZ1Q86V15 1759 aa15.59■□□□□ 0.09
UBE2B-208ENST00000511807 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms