RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 ADAM32Q8TC27 787 aa10.83□□□□□ -0.68
PDE4D-217ENST00000509355 SOCS7O14512 581 aa10.82□□□□□ -0.68
PDE4D-217ENST00000509355 ZBTB33Q86T24 672 aa10.81□□□□□ -0.68
PDE4D-217ENST00000509355 BANK1Q8NDB2 785 aa10.81□□□□□ -0.68
PDE4D-217ENST00000509355 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
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PDE4D-217ENST00000509355 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
PDE4D-217ENST00000509355 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa10.8□□□□□ -0.68
PDE4D-217ENST00000509355 GPR37L1O60883 481 aa10.79□□□□□ -0.68
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PDE4D-217ENST00000509355 SLC16A10Q8TF71 515 aa10.74□□□□□ -0.69
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PDE4D-217ENST00000509355 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
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PDE4D-217ENST00000509355 NBPF20Q3BBV1 942 aa10.71□□□□□ -0.69
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PDE4D-217ENST00000509355 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa10.71□□□□□ -0.69
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PDE4D-217ENST00000509355 C6orf118Q5T5N4 469 aa10.7□□□□□ -0.7
PDE4D-217ENST00000509355 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
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PDE4D-217ENST00000509355 UPP2O95045 317 aa10.69□□□□□ -0.7
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PDE4D-217ENST00000509355 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
PDE4D-217ENST00000509355 SOBPA7XYQ1 873 aa10.68□□□□□ -0.7
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PDE4D-217ENST00000509355 BMP2P12643 396 aa10.68□□□□□ -0.7
PDE4D-217ENST00000509355 ERVH48-1M5A8F1 160 aa10.67□□□□□ -0.7
PDE4D-217ENST00000509355 SEPT12Q8IYM1 358 aa10.67□□□□□ -0.7
PDE4D-217ENST00000509355 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa10.67□□□□□ -0.7
PDE4D-217ENST00000509355 H3BM21 787 aa10.66□□□□□ -0.7
PDE4D-217ENST00000509355 SPINT1O43278 529 aa10.66□□□□□ -0.7
PDE4D-217ENST00000509355 NR1H3Q13133 447 aa10.66□□□□□ -0.7
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PDE4D-217ENST00000509355 NISCHQ9Y2I1 1504 aa10.59□□□□□ -0.71
PDE4D-217ENST00000509355 APBB1O00213 710 aa10.59□□□□□ -0.71
PDE4D-217ENST00000509355 ADH1AP07327 375 aa10.59□□□□□ -0.71
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PDE4D-217ENST00000509355 CCDC125Q86Z20 511 aa10.59□□□□□ -0.71
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PDE4D-217ENST00000509355 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP10.57□□□□□ -0.72
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PDE4D-217ENST00000509355 LORP23490 312 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
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PDE4D-217ENST00000509355 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
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PDE4D-217ENST00000509355 ERVK-9P63128 1117 aa10.55□□□□□ -0.72
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PDE4D-217ENST00000509355 ZNF592Q92610 1267 aa10.54□□□□□ -0.72
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
PDE4D-217ENST00000509355 CYLDQ9NQC7 956 aa10.54□□□□□ -0.72
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
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PDE4D-217ENST00000509355 RNF217Q8TC41 542 aa10.53□□□□□ -0.72
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PDE4D-217ENST00000509355 CEP126Q9P2H0 1117 aa10.52□□□□□ -0.73
PDE4D-217ENST00000509355 SLC35F4A4IF30 521 aa10.51□□□□□ -0.73
PDE4D-217ENST00000509355 PHTF2Q8N3S3 785 aa10.51□□□□□ -0.73
PDE4D-217ENST00000509355 TRAK2O60296 914 aa10.5□□□□□ -0.73
PDE4D-217ENST00000509355 SCTRP47872 440 aa10.5□□□□□ -0.73
PDE4D-217ENST00000509355 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa10.5□□□□□ -0.73
PDE4D-217ENST00000509355 FAM181BA6NEQ2 426 aa10.49□□□□□ -0.73
PDE4D-217ENST00000509355 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa10.49□□□□□ -0.73
PDE4D-217ENST00000509355 TRIM52Q96A61 297 aa10.49□□□□□ -0.73
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