RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491036.2

LAMA5-210, Transcript of laminin subunit alpha 5, humanhuman

TSL 2

Gene LAMA5, Length 728 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5-210ENST00000491036 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
LAMA5-210ENST00000491036 WDR17Q8IZU2 1322 aa22.82■■□□□ 1.24
LAMA5-210ENST00000491036 CAMKK2Q96RR4 588 aa22.81■■□□□ 1.24
LAMA5-210ENST00000491036 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.81■■□□□ 1.24
LAMA5-210ENST00000491036 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
LAMA5-210ENST00000491036 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.8■■□□□ 1.24
LAMA5-210ENST00000491036 DDB1Q16531 1140 aa22.79■■□□□ 1.24
LAMA5-210ENST00000491036 LRRC37A3O60309 1634 aa22.79■■□□□ 1.24
LAMA5-210ENST00000491036 NFAT5O94916 1531 aa22.78■■□□□ 1.24
LAMA5-210ENST00000491036 NME9Q86XW9 330 aa22.78■■□□□ 1.24
LAMA5-210ENST00000491036 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.78■■□□□ 1.24
LAMA5-210ENST00000491036 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
LAMA5-210ENST00000491036 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.77■■□□□ 1.24
LAMA5-210ENST00000491036 LRP5O75197 1615 aa22.77■■□□□ 1.24
LAMA5-210ENST00000491036 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa22.76■■□□□ 1.23
LAMA5-210ENST00000491036 USP31Q70CQ4 1352 aa22.76■■□□□ 1.23
LAMA5-210ENST00000491036 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.76■■□□□ 1.23
LAMA5-210ENST00000491036 SBF2Q86WG5 1849 aa22.75■■□□□ 1.23
LAMA5-210ENST00000491036 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.75■■□□□ 1.23
LAMA5-210ENST00000491036 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.75■■□□□ 1.23
LAMA5-210ENST00000491036 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.75■■□□□ 1.23
LAMA5-210ENST00000491036 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.75■■□□□ 1.23
LAMA5-210ENST00000491036 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.75■■□□□ 1.23
LAMA5-210ENST00000491036 LTN1O94822 1766 aa22.75■■□□□ 1.23
LAMA5-210ENST00000491036 USP54Q70EL1 1684 aa22.74■■□□□ 1.23
LAMA5-210ENST00000491036 RREB1Q92766 1687 aa22.74■■□□□ 1.23
LAMA5-210ENST00000491036 PEAK1Q9H792 1746 aa22.74■■□□□ 1.23
LAMA5-210ENST00000491036 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
LAMA5-210ENST00000491036 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
LAMA5-210ENST00000491036 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
LAMA5-210ENST00000491036 A0A1W2PP64 1363 aa22.73■■□□□ 1.23
LAMA5-210ENST00000491036 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.72■■□□□ 1.23
LAMA5-210ENST00000491036 NBPF14Q5TI25 921 aa22.71■■□□□ 1.23
LAMA5-210ENST00000491036 TESK2Q96S53 571 aa22.71■■□□□ 1.23
LAMA5-210ENST00000491036 ABCC6O95255 1503 aa22.71■■□□□ 1.23
LAMA5-210ENST00000491036 CCDC7Q96M83 1385 aa22.69■■□□□ 1.22
LAMA5-210ENST00000491036 EXOC5O00471 708 aa22.69■■□□□ 1.22
LAMA5-210ENST00000491036 SLC24A1O60721 1099 aa22.69■■□□□ 1.22
LAMA5-210ENST00000491036 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
LAMA5-210ENST00000491036 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.67■■□□□ 1.22
LAMA5-210ENST00000491036 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.66■■□□□ 1.22
LAMA5-210ENST00000491036 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
LAMA5-210ENST00000491036 ERBB3P21860 1342 aa22.65■■□□□ 1.22
LAMA5-210ENST00000491036 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.64■■□□□ 1.21
LAMA5-210ENST00000491036 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.64■■□□□ 1.21
LAMA5-210ENST00000491036 PLSCR1O15162 318 aa22.63■■□□□ 1.21
LAMA5-210ENST00000491036 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
LAMA5-210ENST00000491036 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.63■■□□□ 1.21
LAMA5-210ENST00000491036 TMF1P82094 1093 aa22.62■■□□□ 1.21
LAMA5-210ENST00000491036 COG3Q96JB2 828 aa22.62■■□□□ 1.21
LAMA5-210ENST00000491036 USP47Q96K76 1375 aa22.62■■□□□ 1.21
LAMA5-210ENST00000491036 BCL9O00512 1426 aa22.6■■□□□ 1.21
LAMA5-210ENST00000491036 TNS2Q63HR2 1409 aa22.6■■□□□ 1.21
LAMA5-210ENST00000491036 IL2RBP14784 551 aa22.6■■□□□ 1.21
LAMA5-210ENST00000491036 IP6K1Q92551 441 aa22.59■■□□□ 1.21
LAMA5-210ENST00000491036 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
LAMA5-210ENST00000491036 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.58■■□□□ 1.21
LAMA5-210ENST00000491036 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.58■■□□□ 1.21
LAMA5-210ENST00000491036 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.56■■□□□ 1.2
LAMA5-210ENST00000491036 FBLN1P23142 703 aa22.56■■□□□ 1.2
LAMA5-210ENST00000491036 AMPHP49418 695 aa22.55■■□□□ 1.2
LAMA5-210ENST00000491036 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.55■■□□□ 1.2
LAMA5-210ENST00000491036 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
LAMA5-210ENST00000491036 KCNQ2O43526 872 aa22.54■■□□□ 1.2
LAMA5-210ENST00000491036 PROM2Q8N271 834 aa22.54■■□□□ 1.2
LAMA5-210ENST00000491036 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.54■■□□□ 1.2
LAMA5-210ENST00000491036 NHSQ6T4R5 1651 aa22.53■■□□□ 1.2
LAMA5-210ENST00000491036 CDCA8Q53HL2 280 aa22.53■■□□□ 1.2
LAMA5-210ENST00000491036 HOXC9P31274 260 aa22.52■■□□□ 1.2
LAMA5-210ENST00000491036 TXNRD1Q16881 649 aa22.52■■□□□ 1.2
LAMA5-210ENST00000491036 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.52■■□□□ 1.2
LAMA5-210ENST00000491036 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
LAMA5-210ENST00000491036 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.52■■□□□ 1.2
LAMA5-210ENST00000491036 FYB1O15117 783 aa22.51■■□□□ 1.19
LAMA5-210ENST00000491036 SPON1Q9HCB6 807 aa22.51■■□□□ 1.19
LAMA5-210ENST00000491036 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
LAMA5-210ENST00000491036 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.5■■□□□ 1.19
LAMA5-210ENST00000491036 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.5■■□□□ 1.19
LAMA5-210ENST00000491036 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
LAMA5-210ENST00000491036 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
LAMA5-210ENST00000491036 BTAF1O14981 1849 aa22.47■■□□□ 1.19
LAMA5-210ENST00000491036 STK32BQ9NY57 414 aa22.47■■□□□ 1.19
LAMA5-210ENST00000491036 CASZ1Q86V15 1759 aa22.46■■□□□ 1.19
LAMA5-210ENST00000491036 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.46■■□□□ 1.19
LAMA5-210ENST00000491036 RTL1A6NKG5 1358 aa22.44■■□□□ 1.18
LAMA5-210ENST00000491036 MYOM1P52179 1685 aa22.44■■□□□ 1.18
LAMA5-210ENST00000491036 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
LAMA5-210ENST00000491036 SLC15A2Q16348 729 aa22.43■■□□□ 1.18
LAMA5-210ENST00000491036 ZBTB7AO95365 584 aa22.41■■□□□ 1.18
LAMA5-210ENST00000491036 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
LAMA5-210ENST00000491036 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.4■■□□□ 1.18
LAMA5-210ENST00000491036 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.4■■□□□ 1.18
LAMA5-210ENST00000491036 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
LAMA5-210ENST00000491036 NBPF4Q96M43 638 aa22.4■■□□□ 1.18
LAMA5-210ENST00000491036 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.4■■□□□ 1.18
LAMA5-210ENST00000491036 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.4■■□□□ 1.18
LAMA5-210ENST00000491036 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
LAMA5-210ENST00000491036 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.4■■□□□ 1.18
LAMA5-210ENST00000491036 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
LAMA5-210ENST00000491036 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.39■■□□□ 1.17
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