RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490316.6

MTMR1-211, Transcript of myotubularin related protein 1, human

TSL 3

Gene MTMR1, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MTMR1-211	ENST00000490316	USP54	Q70EL1	1684 aa		41.04	■■■■■ 4.16
MTMR1-211	ENST00000490316	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	41.03	■■■■■ 4.16
MTMR1-211	ENST00000490316		A0A1W2PP64	1363 aa		41.03	■■■■■ 4.16
MTMR1-211	ENST00000490316	NME9	Q86XW9	330 aa		41.03	■■■■■ 4.16
MTMR1-211	ENST00000490316	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	41.03	■■■■■ 4.16
MTMR1-211	ENST00000490316	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		41.02	■■■■■ 4.16
MTMR1-211	ENST00000490316	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	41.01	■■■■■ 4.16
MTMR1-211	ENST00000490316	RGPD5	Q99666	1765 aa		41.01	■■■■■ 4.16
MTMR1-211	ENST00000490316	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	41	■■■■■ 4.15
MTMR1-211	ENST00000490316	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		41	■■■■■ 4.15
MTMR1-211	ENST00000490316	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		40.99	■■■■■ 4.15
MTMR1-211	ENST00000490316	TRIM37	O94972	964 aa		40.99	■■■■■ 4.15
MTMR1-211	ENST00000490316	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		40.99	■■■■■ 4.15
MTMR1-211	ENST00000490316	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		40.98	■■■■■ 4.15
MTMR1-211	ENST00000490316	DISP2	A7MBM2	1401 aa		40.98	■■■■■ 4.15
MTMR1-211	ENST00000490316	USP47	Q96K76	1375 aa		40.97	■■■■■ 4.15
MTMR1-211	ENST00000490316	ABCC6	O95255	1503 aa		40.95	■■■■■ 4.15
MTMR1-211	ENST00000490316	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		40.93	■■■■■ 4.14
MTMR1-211	ENST00000490316	TMF1	P82094	1093 aa		40.9	■■■■■ 4.14
MTMR1-211	ENST00000490316	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		40.9	■■■■■ 4.14
MTMR1-211	ENST00000490316	DDB1	Q16531	1140 aa		40.89	■■■■■ 4.14
MTMR1-211	ENST00000490316	LRRC37A3	O60309	1634 aa		40.89	■■■■■ 4.14
MTMR1-211	ENST00000490316	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		40.88	■■■■■ 4.14
MTMR1-211	ENST00000490316	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	40.88	■■■■■ 4.13
MTMR1-211	ENST00000490316	APBA3	O96018	575 aa		40.88	■■■■■ 4.13
MTMR1-211	ENST00000490316	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	40.87	■■■■■ 4.13
MTMR1-211	ENST00000490316	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	40.87	■■■■■ 4.13
MTMR1-211	ENST00000490316	LTN1	O94822	1766 aa		40.86	■■■■■ 4.13
MTMR1-211	ENST00000490316	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		40.86	■■■■■ 4.13
MTMR1-211	ENST00000490316	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		40.86	■■■■■ 4.13
MTMR1-211	ENST00000490316	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		40.85	■■■■■ 4.13
MTMR1-211	ENST00000490316	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		40.83	■■■■■ 4.13
MTMR1-211	ENST00000490316	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		40.82	■■■■■ 4.13
MTMR1-211	ENST00000490316	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		40.82	■■■■■ 4.12
MTMR1-211	ENST00000490316	PEAK1	Q9H792	1746 aa		40.81	■■■■■ 4.12
MTMR1-211	ENST00000490316	CCDC7	Q96M83	1385 aa		40.81	■■■■■ 4.12
MTMR1-211	ENST00000490316	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		40.79	■■■■■ 4.12
MTMR1-211	ENST00000490316	ERBB3	P21860	1342 aa		40.79	■■■■■ 4.12
MTMR1-211	ENST00000490316	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	40.78	■■■■■ 4.12
MTMR1-211	ENST00000490316	CDCA8	Q53HL2	280 aa		40.77	■■■■■ 4.12
MTMR1-211	ENST00000490316	COG3	Q96JB2	828 aa		40.76	■■■■■ 4.12
MTMR1-211	ENST00000490316	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	40.73	■■■■■ 4.11
MTMR1-211	ENST00000490316	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		40.73	■■■■■ 4.11
MTMR1-211	ENST00000490316	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		40.73	■■■■■ 4.11
MTMR1-211	ENST00000490316	EXOC5	O00471	708 aa		40.72	■■■■■ 4.11
MTMR1-211	ENST00000490316	SBF2	Q86WG5	1849 aa		40.71	■■■■■ 4.11
MTMR1-211	ENST00000490316	RREB1	Q92766	1687 aa		40.69	■■■■■ 4.1
MTMR1-211	ENST00000490316	IP6K1	Q92551	441 aa		40.69	■■■■■ 4.1
MTMR1-211	ENST00000490316	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	40.68	■■■■■ 4.1
MTMR1-211	ENST00000490316	BCL9	O00512	1426 aa		40.67	■■■■■ 4.1
MTMR1-211	ENST00000490316	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	40.65	■■■■■ 4.1
MTMR1-211	ENST00000490316	FYB1	O15117	783 aa		40.64	■■■■■ 4.1
MTMR1-211	ENST00000490316	TNS2	Q63HR2	1409 aa		40.63	■■■■■ 4.09
MTMR1-211	ENST00000490316	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	40.63	■■■■■ 4.09
MTMR1-211	ENST00000490316	LRP5	O75197	1615 aa		40.62	■■■■■ 4.09
MTMR1-211	ENST00000490316	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		40.62	■■■■■ 4.09
MTMR1-211	ENST00000490316	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		40.62	■■■■■ 4.09
MTMR1-211	ENST00000490316	IL2RB	P14784	551 aa		40.61	■■■■■ 4.09
MTMR1-211	ENST00000490316	FBLN1	P23142	703 aa		40.61	■■■■■ 4.09
MTMR1-211	ENST00000490316	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		40.6	■■■■■ 4.09
MTMR1-211	ENST00000490316	PLSCR1	O15162	318 aa		40.59	■■■■■ 4.09
MTMR1-211	ENST00000490316	AMPH	P49418	695 aa		40.58	■■■■■ 4.09
MTMR1-211	ENST00000490316	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		40.58	■■■■■ 4.09
MTMR1-211	ENST00000490316	MYOM1	P52179	1685 aa		40.57	■■■■■ 4.09
MTMR1-211	ENST00000490316	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	40.57	■■■■■ 4.09
MTMR1-211	ENST00000490316	HOXC9	P31274	260 aa		40.57	■■■■■ 4.09
MTMR1-211	ENST00000490316	NBPF14	Q5TI25	921 aa		40.57	■■■■■ 4.09
MTMR1-211	ENST00000490316	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	40.57	■■■■■ 4.09
MTMR1-211	ENST00000490316	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	40.56	■■■■■ 4.08
MTMR1-211	ENST00000490316	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		40.56	■■■■■ 4.08
MTMR1-211	ENST00000490316	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		40.53	■■■■■ 4.08
MTMR1-211	ENST00000490316	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		40.51	■■■■■ 4.08
MTMR1-211	ENST00000490316	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	40.5	■■■■■ 4.07
MTMR1-211	ENST00000490316	RTL1	A6NKG5	1358 aa		40.49	■■■■■ 4.07
MTMR1-211	ENST00000490316	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		40.46	■■■■■ 4.07
MTMR1-211	ENST00000490316	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	40.45	■■■■■ 4.07
MTMR1-211	ENST00000490316	KCNQ2	O43526	872 aa		40.43	■■■■■ 4.06
MTMR1-211	ENST00000490316	NHS	Q6T4R5	1651 aa		40.43	■■■■■ 4.06
MTMR1-211	ENST00000490316	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		40.41	■■■■■ 4.06
MTMR1-211	ENST00000490316	PROM2	Q8N271	834 aa		40.41	■■■■■ 4.06
MTMR1-211	ENST00000490316	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		40.41	■■■■■ 4.06
MTMR1-211	ENST00000490316	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	40.39	■■■■■ 4.06
MTMR1-211	ENST00000490316	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		40.38	■■■■■ 4.05
MTMR1-211	ENST00000490316	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		40.35	■■■■■ 4.05
MTMR1-211	ENST00000490316	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	40.35	■■■■■ 4.05
MTMR1-211	ENST00000490316	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	40.35	■■■■■ 4.05
MTMR1-211	ENST00000490316	TXNRD1	Q16881	649 aa		40.34	■■■■■ 4.05
MTMR1-211	ENST00000490316	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		40.34	■■■■■ 4.05
MTMR1-211	ENST00000490316	NBPF4	Q96M43	638 aa		40.34	■■■■■ 4.05
MTMR1-211	ENST00000490316	INSR	P06213	1382 aa		40.34	■■■■■ 4.05
MTMR1-211	ENST00000490316	FLT4	P35916	1363 aa		40.34	■■■■■ 4.05
MTMR1-211	ENST00000490316	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		40.33	■■■■■ 4.05
MTMR1-211	ENST00000490316	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	40.32	■■■■■ 4.05
MTMR1-211	ENST00000490316	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		40.32	■■■■■ 4.04
MTMR1-211	ENST00000490316	MEGF6	O75095	1541 aa		40.28	■■■■■ 4.04
MTMR1-211	ENST00000490316	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	40.28	■■■■■ 4.04
MTMR1-211	ENST00000490316	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		40.27	■■■■■ 4.04
MTMR1-211	ENST00000490316	BTAF1	O14981	1849 aa		40.27	■■■■■ 4.04
MTMR1-211	ENST00000490316	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		40.26	■■■■■ 4.04
MTMR1-211	ENST00000490316	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		40.23	■■■■■ 4.03

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 138 ms