RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
HOXB3-210ENST00000489475 RTL1A6NKG5 1358 aa35.27■■■■□ 3.24
HOXB3-210ENST00000489475 GCP02774 474 aa35.27■■■■□ 3.24
HOXB3-210ENST00000489475 HOXC9P31274 260 aa35.27■■■■□ 3.24
HOXB3-210ENST00000489475 PRKAR2BP31323 418 aa35.26■■■■□ 3.24
HOXB3-210ENST00000489475 TNS3Q68CZ2 1445 aa35.26■■■■□ 3.23
HOXB3-210ENST00000489475 WWC1Q8IX03 1113 aa35.23■■■■□ 3.23
HOXB3-210ENST00000489475 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa35.23■■■■□ 3.23
HOXB3-210ENST00000489475 PLEKHG5O94827 1062 aa35.22■■■■□ 3.23
HOXB3-210ENST00000489475 CCDC27Q2M243 656 aa35.22■■■■□ 3.23
HOXB3-210ENST00000489475 LTN1O94822 1766 aa35.22■■■■□ 3.23
HOXB3-210ENST00000489475 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
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HOXB3-210ENST00000489475 ARHGEF10O15013 1369 aa35.2■■■■□ 3.23
HOXB3-210ENST00000489475 IP6K1Q92551 441 aa35.2■■■■□ 3.23
HOXB3-210ENST00000489475 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP35.2■■■■□ 3.23
HOXB3-210ENST00000489475 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP35.18■■■■□ 3.22
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HOXB3-210ENST00000489475 SULT6B1Q6IMI4 303 aa35.17■■■■□ 3.22
HOXB3-210ENST00000489475 ARHGEF25Q86VW2 580 aa35.17■■■■□ 3.22
HOXB3-210ENST00000489475 ZBTB7CA1YPR0 619 aa35.16■■■■□ 3.22
HOXB3-210ENST00000489475 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP35.16■■■■□ 3.22
HOXB3-210ENST00000489475 NEFLP07196 543 aa35.16■■■■□ 3.22
HOXB3-210ENST00000489475 SLFN5Q08AF3 891 aa35.16■■■■□ 3.22
HOXB3-210ENST00000489475 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP35.16■■■■□ 3.22
HOXB3-210ENST00000489475 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP35.15■■■■□ 3.22
HOXB3-210ENST00000489475 E9PSI1 815 aa35.14■■■■□ 3.22
HOXB3-210ENST00000489475 WDR63Q8IWG1 891 aa35.13■■■■□ 3.21
HOXB3-210ENST00000489475 AEBP1Q8IUX7 1158 aa35.13■■■■□ 3.21
HOXB3-210ENST00000489475 PHACTR3Q96KR7 559 aa35.13■■■■□ 3.21
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HOXB3-210ENST00000489475 DUSP27Q5VZP5 1158 aa35.11■■■■□ 3.21
HOXB3-210ENST00000489475 EYA1Q99502 592 aa35.11■■■■□ 3.21
HOXB3-210ENST00000489475 IGSF1Q8N6C5 1336 aa35.11■■■■□ 3.21
HOXB3-210ENST00000489475 NFE2L2Q16236 605 aa35.1■■■■□ 3.21
HOXB3-210ENST00000489475 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP35.1■■■■□ 3.21
HOXB3-210ENST00000489475 NHSL1Q5SYE7 1610 aa35.09■■■■□ 3.21
HOXB3-210ENST00000489475 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP35.09■■■■□ 3.21
HOXB3-210ENST00000489475 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP35.07■■■■□ 3.2
HOXB3-210ENST00000489475 TRIM35Q9UPQ4 493 aa35.07■■■■□ 3.2
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HOXB3-210ENST00000489475 KDRP35968 1356 aa35.06■■■■□ 3.2
HOXB3-210ENST00000489475 CABLES1Q8TDN4 633 aa35.06■■■■□ 3.2
HOXB3-210ENST00000489475 RCAN3Q9UKA8 241 aa35.04■■■■□ 3.2
HOXB3-210ENST00000489475 FKBP8Q14318 412 aa35.02■■■■□ 3.2
HOXB3-210ENST00000489475 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa35.01■■■■□ 3.2
HOXB3-210ENST00000489475 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa35.01■■■■□ 3.19
HOXB3-210ENST00000489475 LMOD3Q0VAK6 560 aa34.99■■■■□ 3.19
HOXB3-210ENST00000489475 MYH16Q9H6N6 1097 aa34.98■■■■□ 3.19
HOXB3-210ENST00000489475 IL16Q14005 1332 aa34.96■■■■□ 3.19
HOXB3-210ENST00000489475 ANKRD24Q8TF21 1146 aa34.96■■■■□ 3.19
HOXB3-210ENST00000489475 AXIN2Q9Y2T1 843 aa34.96■■■■□ 3.19
HOXB3-210ENST00000489475 CPDO75976 1380 aa34.96■■■■□ 3.19
HOXB3-210ENST00000489475 RNF123Q5XPI4 1314 aa34.95■■■■□ 3.19
HOXB3-210ENST00000489475 NBPF6Q5VWK0 638 aa34.94■■■■□ 3.18
HOXB3-210ENST00000489475 NBPF4Q96M43 638 aa34.94■■■■□ 3.18
HOXB3-210ENST00000489475 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP34.93■■■■□ 3.18
HOXB3-210ENST00000489475 TOM1O60784 492 aa34.92■■■■□ 3.18
HOXB3-210ENST00000489475 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP34.92■■■■□ 3.18
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HOXB3-210ENST00000489475 ABCC6O95255 1503 aa34.92■■■■□ 3.18
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HOXB3-210ENST00000489475 USHBP1Q8N6Y0 703 aa34.91■■■■□ 3.18
HOXB3-210ENST00000489475 DLG5Q8TDM6 1919 aa34.9■■■■□ 3.18
HOXB3-210ENST00000489475 ERBB3P21860 1342 aa34.88■■■■□ 3.17
HOXB3-210ENST00000489475 CHRNA2Q15822 529 aa34.88■■■■□ 3.17
HOXB3-210ENST00000489475 GAS2L2Q8NHY3 880 aa34.88■■■■□ 3.17
HOXB3-210ENST00000489475 COL18A1P39060 1754 aa34.87■■■■□ 3.17
HOXB3-210ENST00000489475 RGPD5Q99666 1765 aa34.87■■■■□ 3.17
HOXB3-210ENST00000489475 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP34.87■■■■□ 3.17
HOXB3-210ENST00000489475 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP34.86■■■■□ 3.17
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HOXB3-210ENST00000489475 RGPD2P0DJD1 1756 aa34.85■■■■□ 3.17
HOXB3-210ENST00000489475 ABCA3Q99758 1704 aa34.83■■■■□ 3.17
HOXB3-210ENST00000489475 RRP1P56182 461 aaKnown RBP34.83■■■■□ 3.17
HOXB3-210ENST00000489475 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP34.83■■■■□ 3.17
HOXB3-210ENST00000489475 FANCIQ9NVI1 1328 aa34.83■■■■□ 3.17
HOXB3-210ENST00000489475 NCAPD2Q15021 1401 aa34.83■■■■□ 3.17
HOXB3-210ENST00000489475 FAM83GA6ND36 823 aa34.82■■■■□ 3.16
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HOXB3-210ENST00000489475 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa34.8■■■■□ 3.16
HOXB3-210ENST00000489475 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa34.79■■■■□ 3.16
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HOXB3-210ENST00000489475 DCTN1Q14203 1278 aa34.78■■■■□ 3.16
HOXB3-210ENST00000489475 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP34.78■■■■□ 3.16
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HOXB3-210ENST00000489475 UBAP1LF5GYI3 381 aa34.78■■■■□ 3.16
HOXB3-210ENST00000489475 NLRP2Q9NX02 1062 aa34.78■■■■□ 3.16
HOXB3-210ENST00000489475 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP34.78■■■■□ 3.16
HOXB3-210ENST00000489475 ERICH6BQ5W0A0 696 aa34.77■■■■□ 3.16
HOXB3-210ENST00000489475 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP34.75■■■■□ 3.15
HOXB3-210ENST00000489475 PHLPP1O60346 1717 aa34.75■■■■□ 3.15
HOXB3-210ENST00000489475 MCM10Q7L590 875 aa34.74■■■■□ 3.15
HOXB3-210ENST00000489475 LMO7Q8WWI1 1683 aa34.74■■■■□ 3.15
HOXB3-210ENST00000489475 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP34.74■■■■□ 3.15
HOXB3-210ENST00000489475 GNAT3A8MTJ3 354 aa34.74■■■■□ 3.15
HOXB3-210ENST00000489475 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP34.74■■■■□ 3.15
HOXB3-210ENST00000489475 CFAP44Q96MT7 982 aa34.74■■■■□ 3.15
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