RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487064.1

RPS3AP50-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 50, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP50, Length 803 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP50-201ENST00000487064 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RPS3AP50-201ENST00000487064 CCDC116Q8IYX3 515 aa7.22□□□□□ -1.25
RPS3AP50-201ENST00000487064 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
RPS3AP50-201ENST00000487064 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
RPS3AP50-201ENST00000487064 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RPS3AP50-201ENST00000487064 CCDC125Q86Z20 511 aa7.2□□□□□ -1.26
RPS3AP50-201ENST00000487064 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
RPS3AP50-201ENST00000487064 BMP1P13497 986 aa7.19□□□□□ -1.26
RPS3AP50-201ENST00000487064 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
RPS3AP50-201ENST00000487064 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
RPS3AP50-201ENST00000487064 TRIM46Q7Z4K8 759 aa7.19□□□□□ -1.26
RPS3AP50-201ENST00000487064 ADAM32Q8TC27 787 aa7.19□□□□□ -1.26
RPS3AP50-201ENST00000487064 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
RPS3AP50-201ENST00000487064 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
RPS3AP50-201ENST00000487064 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
RPS3AP50-201ENST00000487064 NR3C2P08235 984 aa7.18□□□□□ -1.26
RPS3AP50-201ENST00000487064 TREML4Q6UXN2 200 aa7.18□□□□□ -1.26
RPS3AP50-201ENST00000487064 ERICH6Q7L0X2 663 aa7.18□□□□□ -1.26
RPS3AP50-201ENST00000487064 SLC16A10Q8TF71 515 aa7.18□□□□□ -1.26
RPS3AP50-201ENST00000487064 ITPKCQ96DU7 683 aa7.18□□□□□ -1.26
RPS3AP50-201ENST00000487064 ZBBXA8MT70 800 aa7.17□□□□□ -1.26
RPS3AP50-201ENST00000487064 ZFP42Q96MM3 310 aa7.17□□□□□ -1.26
RPS3AP50-201ENST00000487064 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.17□□□□□ -1.26
RPS3AP50-201ENST00000487064 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa7.17□□□□□ -1.26
RPS3AP50-201ENST00000487064 WFS1O76024 890 aa7.16□□□□□ -1.26
RPS3AP50-201ENST00000487064 BMP2P12643 396 aa7.16□□□□□ -1.26
RPS3AP50-201ENST00000487064 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RPS3AP50-201ENST00000487064 NPAS3Q8IXF0 933 aa7.16□□□□□ -1.26
RPS3AP50-201ENST00000487064 SEPT12Q8IYM1 358 aa7.16□□□□□ -1.26
RPS3AP50-201ENST00000487064 MEIOBQ8N635 442 aa7.16□□□□□ -1.26
RPS3AP50-201ENST00000487064 EPS8L1Q8TE68 723 aa7.16□□□□□ -1.26
RPS3AP50-201ENST00000487064 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RPS3AP50-201ENST00000487064 TRIM34Q9BYJ4 488 aa7.16□□□□□ -1.26
RPS3AP50-201ENST00000487064 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa7.16□□□□□ -1.26
RPS3AP50-201ENST00000487064 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.15□□□□□ -1.26
RPS3AP50-201ENST00000487064 TERTO14746 1132 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RPS3AP50-201ENST00000487064 MAN1A2O60476 641 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3AP50-201ENST00000487064 RNF20Q5VTR2 975 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3AP50-201ENST00000487064 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RPS3AP50-201ENST00000487064 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RPS3AP50-201ENST00000487064 C6orf118Q5T5N4 469 aa7.13□□□□□ -1.27
RPS3AP50-201ENST00000487064 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RPS3AP50-201ENST00000487064 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa7.13□□□□□ -1.27
RPS3AP50-201ENST00000487064 NR1H3Q13133 447 aa7.12□□□□□ -1.27
RPS3AP50-201ENST00000487064 Q6ZVU0 165 aa7.11□□□□□ -1.27
RPS3AP50-201ENST00000487064 OCSTAMPQ9BR26 566 aa7.11□□□□□ -1.27
RPS3AP50-201ENST00000487064 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
RPS3AP50-201ENST00000487064 ESPNB1AK53 854 aa7.1□□□□□ -1.27
RPS3AP50-201ENST00000487064 FBXO45P0C2W1 286 aa7.1□□□□□ -1.27
RPS3AP50-201ENST00000487064 RAB15P59190 212 aa7.1□□□□□ -1.27
RPS3AP50-201ENST00000487064 IRF7Q92985 503 aa7.1□□□□□ -1.27
RPS3AP50-201ENST00000487064 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
RPS3AP50-201ENST00000487064 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP7.09□□□□□ -1.27
RPS3AP50-201ENST00000487064 MTMR14Q8NCE2 650 aa7.09□□□□□ -1.27
RPS3AP50-201ENST00000487064 TTLL8A6PVC2 850 aa7.08□□□□□ -1.28
RPS3AP50-201ENST00000487064 ERVH48-1M5A8F1 160 aa7.08□□□□□ -1.28
RPS3AP50-201ENST00000487064 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
RPS3AP50-201ENST00000487064 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
RPS3AP50-201ENST00000487064 SPINT1O43278 529 aa7.07□□□□□ -1.28
RPS3AP50-201ENST00000487064 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP7.07□□□□□ -1.28
RPS3AP50-201ENST00000487064 CBLBQ13191 982 aa7.07□□□□□ -1.28
RPS3AP50-201ENST00000487064 SNRKQ9NRH2 765 aa7.07□□□□□ -1.28
RPS3AP50-201ENST00000487064 ADH1AP07327 375 aa7.06□□□□□ -1.28
RPS3AP50-201ENST00000487064 WWC1Q8IX03 1113 aa7.06□□□□□ -1.28
RPS3AP50-201ENST00000487064 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
RPS3AP50-201ENST00000487064 H3BM21 787 aa7.05□□□□□ -1.28
RPS3AP50-201ENST00000487064 WIPF1O43516 503 aa7.05□□□□□ -1.28
RPS3AP50-201ENST00000487064 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RPS3AP50-201ENST00000487064 RELBQ01201 579 aa7.05□□□□□ -1.28
RPS3AP50-201ENST00000487064 WASHC4Q2M389 1173 aa7.04□□□□□ -1.28
RPS3AP50-201ENST00000487064 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
RPS3AP50-201ENST00000487064 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
RPS3AP50-201ENST00000487064 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa7.04□□□□□ -1.28
RPS3AP50-201ENST00000487064 PTGIRP43119 386 aa7.03□□□□□ -1.28
RPS3AP50-201ENST00000487064 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa7.03□□□□□ -1.28
RPS3AP50-201ENST00000487064 CYLDQ9NQC7 956 aa7.03□□□□□ -1.28
RPS3AP50-201ENST00000487064 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa7.03□□□□□ -1.28
RPS3AP50-201ENST00000487064 FAM181BA6NEQ2 426 aa7.02□□□□□ -1.29
RPS3AP50-201ENST00000487064 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa7.02□□□□□ -1.29
RPS3AP50-201ENST00000487064 LILRA1O75019 489 aa7.02□□□□□ -1.29
RPS3AP50-201ENST00000487064 MYCP01106 439 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RPS3AP50-201ENST00000487064 CYP2U1Q7Z449 544 aa7.02□□□□□ -1.29
RPS3AP50-201ENST00000487064 AGBL1Q96MI9 1066 aa7.02□□□□□ -1.29
RPS3AP50-201ENST00000487064 DNMT3LQ9UJW3 386 aa7.02□□□□□ -1.29
RPS3AP50-201ENST00000487064 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa7.02□□□□□ -1.29
RPS3AP50-201ENST00000487064 FIGNL2A6NMB9 653 aa7.01□□□□□ -1.29
RPS3AP50-201ENST00000487064 SOBPA7XYQ1 873 aa7.01□□□□□ -1.29
RPS3AP50-201ENST00000487064 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
RPS3AP50-201ENST00000487064 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa7.01□□□□□ -1.29
RPS3AP50-201ENST00000487064 GPC1P35052 558 aa7□□□□□ -1.29
RPS3AP50-201ENST00000487064 SOX11P35716 441 aa7□□□□□ -1.29
RPS3AP50-201ENST00000487064 ERVK-9P63128 1117 aa7□□□□□ -1.29
RPS3AP50-201ENST00000487064 FLIIQ13045 1269 aa7□□□□□ -1.29
RPS3AP50-201ENST00000487064 SLFNL1Q499Z3 407 aa7□□□□□ -1.29
RPS3AP50-201ENST00000487064 SIRT1Q96EB6 747 aa7□□□□□ -1.29
RPS3AP50-201ENST00000487064 NLRP3Q96P20 1036 aa7□□□□□ -1.29
RPS3AP50-201ENST00000487064 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
RPS3AP50-201ENST00000487064 STK17AQ9UEE5 414 aa7□□□□□ -1.29
RPS3AP50-201ENST00000487064 RAD21O60216 631 aa6.99□□□□□ -1.29
RPS3AP50-201ENST00000487064 PPFIA3O75145 1194 aa6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.6 ms