RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485349.5

SKIV2L-211, Transcript of Ski2 like RNA helicase, humanhuman

TSL 2

Gene SKIV2L, Length 734 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2L-211ENST00000485349 AXIN2Q9Y2T1 843 aa24.15■■□□□ 1.46
SKIV2L-211ENST00000485349 TTC21AQ8NDW8 1320 aa24.14■■□□□ 1.46
SKIV2L-211ENST00000485349 SOX12O15370 315 aa24.14■■□□□ 1.45
SKIV2L-211ENST00000485349 USP54Q70EL1 1684 aa24.14■■□□□ 1.45
SKIV2L-211ENST00000485349 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa24.13■■□□□ 1.45
SKIV2L-211ENST00000485349 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa24.13■■□□□ 1.45
SKIV2L-211ENST00000485349 OVOS2Q6IE36 1432 aa24.13■■□□□ 1.45
SKIV2L-211ENST00000485349 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa24.13■■□□□ 1.45
SKIV2L-211ENST00000485349 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.13■■□□□ 1.45
SKIV2L-211ENST00000485349 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.13■■□□□ 1.45
SKIV2L-211ENST00000485349 WDR17Q8IZU2 1322 aa24.12■■□□□ 1.45
SKIV2L-211ENST00000485349 ARHGEF25Q86VW2 580 aa24.12■■□□□ 1.45
SKIV2L-211ENST00000485349 KCNH5Q8NCM2 988 aa24.11■■□□□ 1.45
SKIV2L-211ENST00000485349 TONSLQ96HA7 1378 aa24.1■■□□□ 1.45
SKIV2L-211ENST00000485349 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
SKIV2L-211ENST00000485349 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa24.1■■□□□ 1.45
SKIV2L-211ENST00000485349 ABCC6O95255 1503 aa24.1■■□□□ 1.45
SKIV2L-211ENST00000485349 LTN1O94822 1766 aa24.08■■□□□ 1.45
SKIV2L-211ENST00000485349 DDB1Q16531 1140 aa24.07■■□□□ 1.44
SKIV2L-211ENST00000485349 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP24.06■■□□□ 1.44
SKIV2L-211ENST00000485349 USP31Q70CQ4 1352 aa24.04■■□□□ 1.44
SKIV2L-211ENST00000485349 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa24.04■■□□□ 1.44
SKIV2L-211ENST00000485349 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
SKIV2L-211ENST00000485349 NME9Q86XW9 330 aa24.03■■□□□ 1.44
SKIV2L-211ENST00000485349 TMC1Q8TDI8 760 aa24.03■■□□□ 1.44
SKIV2L-211ENST00000485349 CARD10Q9BWT7 1032 aa24.03■■□□□ 1.44
SKIV2L-211ENST00000485349 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
SKIV2L-211ENST00000485349 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.01■■□□□ 1.43
SKIV2L-211ENST00000485349 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
SKIV2L-211ENST00000485349 PTF1AQ7RTS3 328 aa24■■□□□ 1.43
SKIV2L-211ENST00000485349 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
SKIV2L-211ENST00000485349 A0A1W2PP64 1363 aa24■■□□□ 1.43
SKIV2L-211ENST00000485349 NBPF14Q5TI25 921 aa23.99■■□□□ 1.43
SKIV2L-211ENST00000485349 BCL9O00512 1426 aa23.99■■□□□ 1.43
SKIV2L-211ENST00000485349 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
SKIV2L-211ENST00000485349 CCDC7Q96M83 1385 aa23.98■■□□□ 1.43
SKIV2L-211ENST00000485349 TNS2Q63HR2 1409 aa23.98■■□□□ 1.43
SKIV2L-211ENST00000485349 ERBB3P21860 1342 aa23.96■■□□□ 1.43
SKIV2L-211ENST00000485349 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
SKIV2L-211ENST00000485349 PLSCR1O15162 318 aa23.94■■□□□ 1.42
SKIV2L-211ENST00000485349 TERF2IPQ9NYB0 399 aa23.94■■□□□ 1.42
SKIV2L-211ENST00000485349 NHSQ6T4R5 1651 aa23.94■■□□□ 1.42
SKIV2L-211ENST00000485349 TESK2Q96S53 571 aa23.93■■□□□ 1.42
SKIV2L-211ENST00000485349 CASZ1Q86V15 1759 aa23.93■■□□□ 1.42
SKIV2L-211ENST00000485349 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
SKIV2L-211ENST00000485349 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
SKIV2L-211ENST00000485349 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa23.91■■□□□ 1.42
SKIV2L-211ENST00000485349 EXOC5O00471 708 aa23.91■■□□□ 1.42
SKIV2L-211ENST00000485349 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
SKIV2L-211ENST00000485349 NLRP2Q9NX02 1062 aa23.9■■□□□ 1.42
SKIV2L-211ENST00000485349 NINLQ9Y2I6 1382 aa23.9■■□□□ 1.42
SKIV2L-211ENST00000485349 ANKRD24Q8TF21 1146 aa23.89■■□□□ 1.41
SKIV2L-211ENST00000485349 PROM2Q8N271 834 aa23.88■■□□□ 1.41
SKIV2L-211ENST00000485349 BTAF1O14981 1849 aa23.86■■□□□ 1.41
SKIV2L-211ENST00000485349 KCNQ2O43526 872 aa23.85■■□□□ 1.41
SKIV2L-211ENST00000485349 IL2RBP14784 551 aa23.85■■□□□ 1.41
SKIV2L-211ENST00000485349 SPON1Q9HCB6 807 aa23.84■■□□□ 1.41
SKIV2L-211ENST00000485349 RGPD2P0DJD1 1756 aa23.83■■□□□ 1.41
SKIV2L-211ENST00000485349 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
SKIV2L-211ENST00000485349 TXNRD1Q16881 649 aa23.82■■□□□ 1.4
SKIV2L-211ENST00000485349 ACSBG1Q96GR2 724 aa23.82■■□□□ 1.4
SKIV2L-211ENST00000485349 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
SKIV2L-211ENST00000485349 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.81■■□□□ 1.4
SKIV2L-211ENST00000485349 USP47Q96K76 1375 aa23.81■■□□□ 1.4
SKIV2L-211ENST00000485349 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.81■■□□□ 1.4
SKIV2L-211ENST00000485349 IP6K1Q92551 441 aa23.81■■□□□ 1.4
SKIV2L-211ENST00000485349 PAPPAQ13219 1627 aa23.81■■□□□ 1.4
SKIV2L-211ENST00000485349 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
SKIV2L-211ENST00000485349 MAP3K19Q56UN5 1328 aa23.8■■□□□ 1.4
SKIV2L-211ENST00000485349 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
SKIV2L-211ENST00000485349 COG3Q96JB2 828 aa23.79■■□□□ 1.4
SKIV2L-211ENST00000485349 KIF20BQ96Q89 1820 aa23.79■■□□□ 1.4
SKIV2L-211ENST00000485349 MYOM1P52179 1685 aa23.79■■□□□ 1.4
SKIV2L-211ENST00000485349 SHANK3Q9BYB0 1731 aa23.79■■□□□ 1.4
SKIV2L-211ENST00000485349 FBLN1P23142 703 aa23.78■■□□□ 1.4
SKIV2L-211ENST00000485349 SLC24A1O60721 1099 aa23.77■■□□□ 1.4
SKIV2L-211ENST00000485349 STK32BQ9NY57 414 aa23.76■■□□□ 1.39
SKIV2L-211ENST00000485349 UTRNP46939 3433 aa23.76■■□□□ 1.39
SKIV2L-211ENST00000485349 DOT1LQ8TEK3 1739 aa23.76■■□□□ 1.39
SKIV2L-211ENST00000485349 ZBTB7AO95365 584 aa23.75■■□□□ 1.39
SKIV2L-211ENST00000485349 HOXC9P31274 260 aa23.75■■□□□ 1.39
SKIV2L-211ENST00000485349 TMF1P82094 1093 aa23.74■■□□□ 1.39
SKIV2L-211ENST00000485349 SLC15A2Q16348 729 aa23.74■■□□□ 1.39
SKIV2L-211ENST00000485349 AMPHP49418 695 aa23.73■■□□□ 1.39
SKIV2L-211ENST00000485349 RTL1A6NKG5 1358 aa23.72■■□□□ 1.39
SKIV2L-211ENST00000485349 MEGF6O75095 1541 aa23.72■■□□□ 1.39
SKIV2L-211ENST00000485349 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
SKIV2L-211ENST00000485349 FYB1O15117 783 aa23.7■■□□□ 1.38
SKIV2L-211ENST00000485349 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
SKIV2L-211ENST00000485349 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.7■■□□□ 1.38
SKIV2L-211ENST00000485349 PTGER2P43116 358 aa23.69■■□□□ 1.38
SKIV2L-211ENST00000485349 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
SKIV2L-211ENST00000485349 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa23.66■■□□□ 1.38
SKIV2L-211ENST00000485349 LRRC4BQ9NT99 713 aa23.66■■□□□ 1.38
SKIV2L-211ENST00000485349 LY75O60449 1722 aa23.66■■□□□ 1.38
SKIV2L-211ENST00000485349 QSER1Q2KHR3 1735 aa23.66■■□□□ 1.38
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF827Q17R98 1081 aa23.65■■□□□ 1.38
SKIV2L-211ENST00000485349 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
SKIV2L-211ENST00000485349 NSD2O96028 1365 aa23.64■■□□□ 1.37
SKIV2L-211ENST00000485349 CDCA8Q53HL2 280 aa23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms