RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481641.1

CLK1-211, Transcript of CDC like kinase 1, humanhuman

TSL 4

Gene CLK1, Length 690 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1-211ENST00000481641 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.25■■□□□ 1.79
CLK1-211ENST00000481641 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
CLK1-211ENST00000481641 NFAT5O94916 1531 aa26.24■■□□□ 1.79
CLK1-211ENST00000481641 DISP2A7MBM2 1401 aa26.24■■□□□ 1.79
CLK1-211ENST00000481641 APBA3O96018 575 aa26.24■■□□□ 1.79
CLK1-211ENST00000481641 WDR17Q8IZU2 1322 aa26.23■■□□□ 1.79
CLK1-211ENST00000481641 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
CLK1-211ENST00000481641 TESK2Q96S53 571 aa26.23■■□□□ 1.79
CLK1-211ENST00000481641 CAMKK2Q96RR4 588 aa26.22■■□□□ 1.79
CLK1-211ENST00000481641 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.21■■□□□ 1.79
CLK1-211ENST00000481641 USP31Q70CQ4 1352 aa26.2■■□□□ 1.79
CLK1-211ENST00000481641 A0A1W2PP64 1363 aa26.2■■□□□ 1.78
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CLK1-211ENST00000481641 LRRC37A3O60309 1634 aa26.17■■□□□ 1.78
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CLK1-211ENST00000481641 DDB1Q16531 1140 aa26.17■■□□□ 1.78
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CLK1-211ENST00000481641 USP54Q70EL1 1684 aa26.15■■□□□ 1.78
CLK1-211ENST00000481641 CARD10Q9BWT7 1032 aa26.15■■□□□ 1.78
CLK1-211ENST00000481641 PEAK1Q9H792 1746 aa26.14■■□□□ 1.77
CLK1-211ENST00000481641 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa26.13■■□□□ 1.77
CLK1-211ENST00000481641 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa26.13■■□□□ 1.77
CLK1-211ENST00000481641 OVOS2Q6IE36 1432 aa26.13■■□□□ 1.77
CLK1-211ENST00000481641 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
CLK1-211ENST00000481641 LTN1O94822 1766 aa26.12■■□□□ 1.77
CLK1-211ENST00000481641 PTF1AQ7RTS3 328 aa26.1■■□□□ 1.77
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CLK1-211ENST00000481641 ABCC6O95255 1503 aa26.09■■□□□ 1.77
CLK1-211ENST00000481641 USP47Q96K76 1375 aa26.09■■□□□ 1.77
CLK1-211ENST00000481641 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
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CLK1-211ENST00000481641 RREB1Q92766 1687 aa26.09■■□□□ 1.77
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CLK1-211ENST00000481641 LRP5O75197 1615 aa26.07■■□□□ 1.76
CLK1-211ENST00000481641 NLRP2Q9NX02 1062 aa26.07■■□□□ 1.76
CLK1-211ENST00000481641 ERBB3P21860 1342 aa26.07■■□□□ 1.76
CLK1-211ENST00000481641 CCDC7Q96M83 1385 aa26.07■■□□□ 1.76
CLK1-211ENST00000481641 NINLQ9Y2I6 1382 aa26.07■■□□□ 1.76
CLK1-211ENST00000481641 NUP188Q5SRE5 1749 aa26.06■■□□□ 1.76
CLK1-211ENST00000481641 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
CLK1-211ENST00000481641 EXOC5O00471 708 aa26.05■■□□□ 1.76
CLK1-211ENST00000481641 ANKRD24Q8TF21 1146 aa26.05■■□□□ 1.76
CLK1-211ENST00000481641 SLC24A1O60721 1099 aa26.04■■□□□ 1.76
CLK1-211ENST00000481641 FBLN1P23142 703 aa26.04■■□□□ 1.76
CLK1-211ENST00000481641 TMF1P82094 1093 aa26.04■■□□□ 1.76
CLK1-211ENST00000481641 COG3Q96JB2 828 aa26.02■■□□□ 1.76
CLK1-211ENST00000481641 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
CLK1-211ENST00000481641 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa26.01■■□□□ 1.75
CLK1-211ENST00000481641 NBPF14Q5TI25 921 aa26■■□□□ 1.75
CLK1-211ENST00000481641 IP6K1Q92551 441 aa26■■□□□ 1.75
CLK1-211ENST00000481641 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
CLK1-211ENST00000481641 BCL9O00512 1426 aa25.98■■□□□ 1.75
CLK1-211ENST00000481641 TNS2Q63HR2 1409 aa25.98■■□□□ 1.75
CLK1-211ENST00000481641 PLSCR1O15162 318 aa25.98■■□□□ 1.75
CLK1-211ENST00000481641 MAP3K19Q56UN5 1328 aa25.97■■□□□ 1.75
CLK1-211ENST00000481641 IL2RBP14784 551 aa25.97■■□□□ 1.75
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CLK1-211ENST00000481641 ACSBG1Q96GR2 724 aa25.94■■□□□ 1.74
CLK1-211ENST00000481641 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.94■■□□□ 1.74
CLK1-211ENST00000481641 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
CLK1-211ENST00000481641 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa25.93■■□□□ 1.74
CLK1-211ENST00000481641 HOXC9P31274 260 aa25.93■■□□□ 1.74
CLK1-211ENST00000481641 AMPHP49418 695 aa25.93■■□□□ 1.74
CLK1-211ENST00000481641 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
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CLK1-211ENST00000481641 CDCA8Q53HL2 280 aa25.9■■□□□ 1.74
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CLK1-211ENST00000481641 CARD14Q9BXL6 1004 aa25.88■■□□□ 1.73
CLK1-211ENST00000481641 TXNRD1Q16881 649 aa25.87■■□□□ 1.73
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CLK1-211ENST00000481641 NHSQ6T4R5 1651 aa25.86■■□□□ 1.73
CLK1-211ENST00000481641 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
CLK1-211ENST00000481641 KIF20BQ96Q89 1820 aa25.85■■□□□ 1.73
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CLK1-211ENST00000481641 USHBP1Q8N6Y0 703 aa25.82■■□□□ 1.72
CLK1-211ENST00000481641 RTL1A6NKG5 1358 aa25.82■■□□□ 1.72
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CLK1-211ENST00000481641 NBPF4Q96M43 638 aa25.81■■□□□ 1.72
CLK1-211ENST00000481641 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.81■■□□□ 1.72
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CLK1-211ENST00000481641 SPON1Q9HCB6 807 aa25.8■■□□□ 1.72
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CLK1-211ENST00000481641 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa25.79■■□□□ 1.72
CLK1-211ENST00000481641 MEGF6O75095 1541 aa25.78■■□□□ 1.72
CLK1-211ENST00000481641 STK32BQ9NY57 414 aa25.78■■□□□ 1.72
CLK1-211ENST00000481641 CASZ1Q86V15 1759 aa25.77■■□□□ 1.72
CLK1-211ENST00000481641 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
CLK1-211ENST00000481641 SLC15A2Q16348 729 aa25.75■■□□□ 1.71
CLK1-211ENST00000481641 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
CLK1-211ENST00000481641 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa25.75■■□□□ 1.71
CLK1-211ENST00000481641 SHANK3Q9BYB0 1731 aa25.74■■□□□ 1.71
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