RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479263.5

PRKCZ-215, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 2

Gene PRKCZ, Length 1,747 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-215	ENST00000479263	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	28.44	■■■□□ 2.14
PRKCZ-215	ENST00000479263	USP19	O94966	1318 aa		28.44	■■■□□ 2.14
PRKCZ-215	ENST00000479263	HOXC9	P31274	260 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PRKCZ-215	ENST00000479263	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	28.43	■■■□□ 2.14
PRKCZ-215	ENST00000479263	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PRKCZ-215	ENST00000479263	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PRKCZ-215	ENST00000479263	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	28.43	■■■□□ 2.14
PRKCZ-215	ENST00000479263	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		28.42	■■■□□ 2.14
PRKCZ-215	ENST00000479263	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	28.42	■■■□□ 2.14
PRKCZ-215	ENST00000479263	GC	P02774	474 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PRKCZ-215	ENST00000479263	SLFN5	Q08AF3	891 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PRKCZ-215	ENST00000479263	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	28.4	■■■□□ 2.14
PRKCZ-215	ENST00000479263	CCDC27	Q2M243	656 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PRKCZ-215	ENST00000479263	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PRKCZ-215	ENST00000479263	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PRKCZ-215	ENST00000479263	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PRKCZ-215	ENST00000479263	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PRKCZ-215	ENST00000479263	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	28.39	■■■□□ 2.14
PRKCZ-215	ENST00000479263	RTL1	A6NKG5	1358 aa		28.39	■■■□□ 2.14
PRKCZ-215	ENST00000479263	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	28.38	■■■□□ 2.13
PRKCZ-215	ENST00000479263	FKBP8	Q14318	412 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PRKCZ-215	ENST00000479263	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PRKCZ-215	ENST00000479263	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	28.37	■■■□□ 2.13
PRKCZ-215	ENST00000479263	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PRKCZ-215	ENST00000479263	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PRKCZ-215	ENST00000479263	NEFL	P07196	543 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PRKCZ-215	ENST00000479263	IP6K1	Q92551	441 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PRKCZ-215	ENST00000479263	ARHGEF10	O15013	1369 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PRKCZ-215	ENST00000479263	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PRKCZ-215	ENST00000479263		E9PSI1	815 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PRKCZ-215	ENST00000479263	RIPK4	P57078	832 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PRKCZ-215	ENST00000479263	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PRKCZ-215	ENST00000479263	NEFM	P07197	916 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PRKCZ-215	ENST00000479263	EYA1	Q99502	592 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PRKCZ-215	ENST00000479263	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PRKCZ-215	ENST00000479263	WDR63	Q8IWG1	891 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PRKCZ-215	ENST00000479263	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	28.32	■■■□□ 2.12
PRKCZ-215	ENST00000479263	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PRKCZ-215	ENST00000479263	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	28.32	■■■□□ 2.12
PRKCZ-215	ENST00000479263	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PRKCZ-215	ENST00000479263	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	28.31	■■■□□ 2.12
PRKCZ-215	ENST00000479263	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PRKCZ-215	ENST00000479263	NFE2L2	Q16236	605 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PRKCZ-215	ENST00000479263	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PRKCZ-215	ENST00000479263	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		28.29	■■■□□ 2.12
PRKCZ-215	ENST00000479263	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		28.29	■■■□□ 2.12
PRKCZ-215	ENST00000479263	KDR	P35968	1356 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PRKCZ-215	ENST00000479263	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	28.26	■■■□□ 2.12
PRKCZ-215	ENST00000479263	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		28.26	■■■□□ 2.11
PRKCZ-215	ENST00000479263	RGPD5	Q99666	1765 aa		28.26	■■■□□ 2.11
PRKCZ-215	ENST00000479263	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		28.24	■■■□□ 2.11
PRKCZ-215	ENST00000479263	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		28.23	■■■□□ 2.11
PRKCZ-215	ENST00000479263	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		28.21	■■■□□ 2.11
PRKCZ-215	ENST00000479263	COL18A1	P39060	1754 aa		28.2	■■■□□ 2.1
PRKCZ-215	ENST00000479263	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		28.19	■■■□□ 2.1
PRKCZ-215	ENST00000479263	NBPF4	Q96M43	638 aa		28.19	■■■□□ 2.1
PRKCZ-215	ENST00000479263	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	28.18	■■■□□ 2.1
PRKCZ-215	ENST00000479263	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	28.18	■■■□□ 2.1
PRKCZ-215	ENST00000479263	ABCA3	Q99758	1704 aa		28.17	■■■□□ 2.1
PRKCZ-215	ENST00000479263	IL16	Q14005	1332 aa		28.17	■■■□□ 2.1
PRKCZ-215	ENST00000479263	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	28.17	■■■□□ 2.1
PRKCZ-215	ENST00000479263	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		28.17	■■■□□ 2.1
PRKCZ-215	ENST00000479263	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		28.17	■■■□□ 2.1
PRKCZ-215	ENST00000479263	FAM83G	A6ND36	823 aa		28.15	■■■□□ 2.1
PRKCZ-215	ENST00000479263	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	28.15	■■■□□ 2.1
PRKCZ-215	ENST00000479263	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		28.14	■■■□□ 2.1
PRKCZ-215	ENST00000479263	KIAA0232	Q92628	1395 aa		28.14	■■■□□ 2.1
PRKCZ-215	ENST00000479263	CHRNA2	Q15822	529 aa		28.14	■■■□□ 2.1
PRKCZ-215	ENST00000479263	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	28.14	■■■□□ 2.1
PRKCZ-215	ENST00000479263	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		28.13	■■■□□ 2.09
PRKCZ-215	ENST00000479263	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		28.13	■■■□□ 2.09
PRKCZ-215	ENST00000479263	CPD	O75976	1380 aa		28.13	■■■□□ 2.09
PRKCZ-215	ENST00000479263	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	28.13	■■■□□ 2.09
PRKCZ-215	ENST00000479263	DCTN1	Q14203	1278 aa		28.12	■■■□□ 2.09
PRKCZ-215	ENST00000479263	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	28.12	■■■□□ 2.09
PRKCZ-215	ENST00000479263	ERBB3	P21860	1342 aa		28.12	■■■□□ 2.09
PRKCZ-215	ENST00000479263	NCAPD2	Q15021	1401 aa		28.11	■■■□□ 2.09
PRKCZ-215	ENST00000479263	ABCC6	O95255	1503 aa		28.1	■■■□□ 2.09
PRKCZ-215	ENST00000479263	PLIN1	O60240	522 aa		28.09	■■■□□ 2.09
PRKCZ-215	ENST00000479263	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		28.08	■■■□□ 2.09
PRKCZ-215	ENST00000479263	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	28.07	■■■□□ 2.08
PRKCZ-215	ENST00000479263	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	28.07	■■■□□ 2.08
PRKCZ-215	ENST00000479263	MCM10	Q7L590	875 aa		28.06	■■■□□ 2.08
PRKCZ-215	ENST00000479263	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		28.06	■■■□□ 2.08
PRKCZ-215	ENST00000479263	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	28.06	■■■□□ 2.08
PRKCZ-215	ENST00000479263	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	28.05	■■■□□ 2.08
PRKCZ-215	ENST00000479263	BCAR3	O75815	825 aa		28.04	■■■□□ 2.08
PRKCZ-215	ENST00000479263	ZNF853	P0CG23	659 aa		28.04	■■■□□ 2.08
PRKCZ-215	ENST00000479263	IFT57	Q9NWB7	429 aa		28.04	■■■□□ 2.08
PRKCZ-215	ENST00000479263	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		28.04	■■■□□ 2.08
PRKCZ-215	ENST00000479263	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		28.04	■■■□□ 2.08
PRKCZ-215	ENST00000479263	GNAI1	P63096	354 aa		28.02	■■■□□ 2.08
PRKCZ-215	ENST00000479263	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	28.02	■■■□□ 2.08
PRKCZ-215	ENST00000479263	PHLPP1	O60346	1717 aa		28.02	■■■□□ 2.08
PRKCZ-215	ENST00000479263	CFAP44	Q96MT7	982 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PRKCZ-215	ENST00000479263	TOM1	O60784	492 aa		28	■■■□□ 2.07
PRKCZ-215	ENST00000479263	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	28	■■■□□ 2.07
PRKCZ-215	ENST00000479263	PIP4K2B	P78356	416 aa		28	■■■□□ 2.07
PRKCZ-215	ENST00000479263	MBIP	Q9NS73	344 aa		28	■■■□□ 2.07
PRKCZ-215	ENST00000479263	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		28	■■■□□ 2.07

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