RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475172.5

PNCK-227, Transcript of pregnancy up-regulated nonubiquitous CaM kinase, human

TSL 5

Gene PNCK, Length 877 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNCK-227	ENST00000475172	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		34.03	■■■■□ 3.04
PNCK-227	ENST00000475172	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		34.02	■■■■□ 3.04
PNCK-227	ENST00000475172	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	34.01	■■■■□ 3.03
PNCK-227	ENST00000475172	USP54	Q70EL1	1684 aa		33.99	■■■■□ 3.03
PNCK-227	ENST00000475172	MYOM1	P52179	1685 aa		33.98	■■■■□ 3.03
PNCK-227	ENST00000475172	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		33.97	■■■■□ 3.03
PNCK-227	ENST00000475172	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		33.97	■■■■□ 3.03
PNCK-227	ENST00000475172	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		33.97	■■■■□ 3.03
PNCK-227	ENST00000475172	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		33.96	■■■■□ 3.03
PNCK-227	ENST00000475172	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		33.96	■■■■□ 3.03
PNCK-227	ENST00000475172	COL18A1	P39060	1754 aa		33.95	■■■■□ 3.02
PNCK-227	ENST00000475172	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		33.94	■■■■□ 3.02
PNCK-227	ENST00000475172	CRB1	P82279	1406 aa		33.94	■■■■□ 3.02
PNCK-227	ENST00000475172	FBLN1	P23142	703 aa		33.93	■■■■□ 3.02
PNCK-227	ENST00000475172	PANK3	Q9H999	370 aa		33.93	■■■■□ 3.02
PNCK-227	ENST00000475172	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	33.93	■■■■□ 3.02
PNCK-227	ENST00000475172	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		33.93	■■■■□ 3.02
PNCK-227	ENST00000475172	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		33.89	■■■■□ 3.02
PNCK-227	ENST00000475172	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		33.88	■■■■□ 3.01
PNCK-227	ENST00000475172	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		33.87	■■■■□ 3.01
PNCK-227	ENST00000475172	AMPH	P49418	695 aa		33.87	■■■■□ 3.01
PNCK-227	ENST00000475172	IP6K1	Q92551	441 aa		33.87	■■■■□ 3.01
PNCK-227	ENST00000475172	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		33.87	■■■■□ 3.01
PNCK-227	ENST00000475172	ABCC6	O95255	1503 aa		33.85	■■■■□ 3.01
PNCK-227	ENST00000475172	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		33.85	■■■■□ 3.01
PNCK-227	ENST00000475172	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	33.84	■■■■□ 3.01
PNCK-227	ENST00000475172	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		33.84	■■■■□ 3.01
PNCK-227	ENST00000475172	RGPD5	Q99666	1765 aa		33.84	■■■■□ 3.01
PNCK-227	ENST00000475172	LTN1	O94822	1766 aa		33.83	■■■■□ 3.01
PNCK-227	ENST00000475172	ERBB3	P21860	1342 aa		33.82	■■■■□ 3.01
PNCK-227	ENST00000475172	PDE3B	Q13370	1112 aa		33.82	■■■■□ 3
PNCK-227	ENST00000475172	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		33.82	■■■■□ 3
PNCK-227	ENST00000475172	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		33.82	■■■■□ 3
PNCK-227	ENST00000475172	FAM182B	Q5T319	152 aa		33.81	■■■■□ 3
PNCK-227	ENST00000475172	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	33.81	■■■■□ 3
PNCK-227	ENST00000475172	HOXC9	P31274	260 aa		33.8	■■■■□ 3
PNCK-227	ENST00000475172	CCDC125	Q86Z20	511 aa		33.8	■■■■□ 3
PNCK-227	ENST00000475172	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		33.8	■■■■□ 3
PNCK-227	ENST00000475172	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	33.79	■■■■□ 3
PNCK-227	ENST00000475172	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		33.76	■■■□□ 2.99
PNCK-227	ENST00000475172	EP400	Q96L91	3159 aa		33.75	■■■□□ 2.99
PNCK-227	ENST00000475172	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	33.75	■■■□□ 2.99
PNCK-227	ENST00000475172	CCDC7	Q96M83	1385 aa		33.74	■■■□□ 2.99
PNCK-227	ENST00000475172	DDB1	Q16531	1140 aa		33.73	■■■□□ 2.99
PNCK-227	ENST00000475172	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	33.72	■■■□□ 2.99
PNCK-227	ENST00000475172	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		33.72	■■■□□ 2.99
PNCK-227	ENST00000475172	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		33.71	■■■□□ 2.99
PNCK-227	ENST00000475172	RTL1	A6NKG5	1358 aa		33.71	■■■□□ 2.99
PNCK-227	ENST00000475172	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	33.7	■■■□□ 2.99
PNCK-227	ENST00000475172	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	33.7	■■■□□ 2.99
PNCK-227	ENST00000475172	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		33.69	■■■□□ 2.98
PNCK-227	ENST00000475172	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		33.68	■■■□□ 2.98
PNCK-227	ENST00000475172	EXOC5	O00471	708 aa		33.66	■■■□□ 2.98
PNCK-227	ENST00000475172	NSD2	O96028	1365 aa		33.65	■■■□□ 2.98
PNCK-227	ENST00000475172	FLT4	P35916	1363 aa		33.65	■■■□□ 2.98
PNCK-227	ENST00000475172	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		33.65	■■■□□ 2.98
PNCK-227	ENST00000475172	IL2RB	P14784	551 aa		33.64	■■■□□ 2.98
PNCK-227	ENST00000475172	MORC1	Q86VD1	984 aa		33.64	■■■□□ 2.98
PNCK-227	ENST00000475172	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	33.64	■■■□□ 2.98
PNCK-227	ENST00000475172	DISP2	A7MBM2	1401 aa		33.63	■■■□□ 2.97
PNCK-227	ENST00000475172	POLK	Q9UBT6	870 aa		33.63	■■■□□ 2.97
PNCK-227	ENST00000475172	INSR	P06213	1382 aa		33.62	■■■□□ 2.97
PNCK-227	ENST00000475172	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	33.61	■■■□□ 2.97
PNCK-227	ENST00000475172	TRIM37	O94972	964 aa		33.6	■■■□□ 2.97
PNCK-227	ENST00000475172	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	33.6	■■■□□ 2.97
PNCK-227	ENST00000475172	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		33.6	■■■□□ 2.97
PNCK-227	ENST00000475172	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	33.59	■■■□□ 2.97
PNCK-227	ENST00000475172	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		33.58	■■■□□ 2.97
PNCK-227	ENST00000475172	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	33.58	■■■□□ 2.97
PNCK-227	ENST00000475172	NBPF4	Q96M43	638 aa		33.58	■■■□□ 2.97
PNCK-227	ENST00000475172	LRRC37A3	O60309	1634 aa		33.57	■■■□□ 2.96
PNCK-227	ENST00000475172	PEAK1	Q9H792	1746 aa		33.56	■■■□□ 2.96
PNCK-227	ENST00000475172	BAG6	P46379	1132 aa		33.55	■■■□□ 2.96
PNCK-227	ENST00000475172	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		33.54	■■■□□ 2.96
PNCK-227	ENST00000475172	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		33.54	■■■□□ 2.96
PNCK-227	ENST00000475172	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		33.54	■■■□□ 2.96
PNCK-227	ENST00000475172	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		33.53	■■■□□ 2.96
PNCK-227	ENST00000475172	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	33.52	■■■□□ 2.96
PNCK-227	ENST00000475172	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	33.52	■■■□□ 2.96
PNCK-227	ENST00000475172	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	33.52	■■■□□ 2.96
PNCK-227	ENST00000475172	TNS2	Q63HR2	1409 aa		33.5	■■■□□ 2.95
PNCK-227	ENST00000475172	APBA3	O96018	575 aa		33.49	■■■□□ 2.95
PNCK-227	ENST00000475172	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	33.49	■■■□□ 2.95
PNCK-227	ENST00000475172	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	33.48	■■■□□ 2.95
PNCK-227	ENST00000475172	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		33.47	■■■□□ 2.95
PNCK-227	ENST00000475172	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	33.46	■■■□□ 2.95
PNCK-227	ENST00000475172	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		33.46	■■■□□ 2.95
PNCK-227	ENST00000475172	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		33.45	■■■□□ 2.95
PNCK-227	ENST00000475172	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	33.44	■■■□□ 2.94
PNCK-227	ENST00000475172	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	33.44	■■■□□ 2.94
PNCK-227	ENST00000475172	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	33.43	■■■□□ 2.94
PNCK-227	ENST00000475172	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	33.43	■■■□□ 2.94
PNCK-227	ENST00000475172	EYA1	Q99502	592 aa		33.42	■■■□□ 2.94
PNCK-227	ENST00000475172	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	33.41	■■■□□ 2.94
PNCK-227	ENST00000475172	BCL9	O00512	1426 aa		33.41	■■■□□ 2.94
PNCK-227	ENST00000475172	MEGF6	O75095	1541 aa		33.39	■■■□□ 2.94
PNCK-227	ENST00000475172	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		33.39	■■■□□ 2.94
PNCK-227	ENST00000475172	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	33.39	■■■□□ 2.94
PNCK-227	ENST00000475172	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		33.38	■■■□□ 2.93
PNCK-227	ENST00000475172	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		33.37	■■■□□ 2.93

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