RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469376.5

OPN3-204, Transcript of opsin 3, human

TSL 1 (best)

Gene OPN3, Length 1,961 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
OPN3-204	ENST00000469376	CABP1	Q9NZU7	370 aa		32.9	■■■□□ 2.86
OPN3-204	ENST00000469376	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		32.89	■■■□□ 2.86
OPN3-204	ENST00000469376	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		32.89	■■■□□ 2.85
OPN3-204	ENST00000469376	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		32.89	■■■□□ 2.85
OPN3-204	ENST00000469376	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		32.88	■■■□□ 2.85
OPN3-204	ENST00000469376	ATP7B	P35670	1465 aa		32.87	■■■□□ 2.85
OPN3-204	ENST00000469376	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		32.87	■■■□□ 2.85
OPN3-204	ENST00000469376	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		32.87	■■■□□ 2.85
OPN3-204	ENST00000469376	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	32.87	■■■□□ 2.85
OPN3-204	ENST00000469376	NUTM2F	A1L443	756 aa		32.86	■■■□□ 2.85
OPN3-204	ENST00000469376	TRIM27	P14373	513 aa		32.86	■■■□□ 2.85
OPN3-204	ENST00000469376	RIPK4	P57078	832 aa		32.86	■■■□□ 2.85
OPN3-204	ENST00000469376	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		32.86	■■■□□ 2.85
OPN3-204	ENST00000469376	C14orf37	Q86TY3	774 aa		32.86	■■■□□ 2.85
OPN3-204	ENST00000469376	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		32.86	■■■□□ 2.85
OPN3-204	ENST00000469376	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		32.85	■■■□□ 2.85
OPN3-204	ENST00000469376	FCHSD2	O94868	740 aa		32.84	■■■□□ 2.85
OPN3-204	ENST00000469376	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		32.84	■■■□□ 2.85
OPN3-204	ENST00000469376	KIF16B	Q96L93	1317 aa		32.83	■■■□□ 2.85
OPN3-204	ENST00000469376	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	32.81	■■■□□ 2.84
OPN3-204	ENST00000469376	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		32.81	■■■□□ 2.84
OPN3-204	ENST00000469376	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	32.81	■■■□□ 2.84
OPN3-204	ENST00000469376	TMEM94	Q12767	1356 aa		32.8	■■■□□ 2.84
OPN3-204	ENST00000469376	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		32.8	■■■□□ 2.84
OPN3-204	ENST00000469376	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	32.79	■■■□□ 2.84
OPN3-204	ENST00000469376	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		32.78	■■■□□ 2.84
OPN3-204	ENST00000469376	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	32.78	■■■□□ 2.84
OPN3-204	ENST00000469376	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		32.78	■■■□□ 2.84
OPN3-204	ENST00000469376	ZNF428	Q96B54	188 aa		32.78	■■■□□ 2.84
OPN3-204	ENST00000469376	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		32.77	■■■□□ 2.84
OPN3-204	ENST00000469376	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		32.77	■■■□□ 2.84
OPN3-204	ENST00000469376	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		32.76	■■■□□ 2.83
OPN3-204	ENST00000469376	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		32.75	■■■□□ 2.83
OPN3-204	ENST00000469376	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		32.74	■■■□□ 2.83
OPN3-204	ENST00000469376	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	32.74	■■■□□ 2.83
OPN3-204	ENST00000469376	SMC5	Q8IY18	1101 aa		32.74	■■■□□ 2.83
OPN3-204	ENST00000469376	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		32.74	■■■□□ 2.83
OPN3-204	ENST00000469376	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	32.73	■■■□□ 2.83
OPN3-204	ENST00000469376	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		32.72	■■■□□ 2.83
OPN3-204	ENST00000469376	POLK	Q9UBT6	870 aa		32.72	■■■□□ 2.83
OPN3-204	ENST00000469376	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		32.71	■■■□□ 2.83
OPN3-204	ENST00000469376	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	32.7	■■■□□ 2.82
OPN3-204	ENST00000469376	ITSN1	Q15811	1721 aa		32.7	■■■□□ 2.82
OPN3-204	ENST00000469376	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	32.69	■■■□□ 2.82
OPN3-204	ENST00000469376	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	32.69	■■■□□ 2.82
OPN3-204	ENST00000469376	PRKAR2B	P31323	418 aa		32.69	■■■□□ 2.82
OPN3-204	ENST00000469376	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	32.69	■■■□□ 2.82
OPN3-204	ENST00000469376	ACE	P12821	1306 aa		32.68	■■■□□ 2.82
OPN3-204	ENST00000469376	NFE2L2	Q16236	605 aa		32.67	■■■□□ 2.82
OPN3-204	ENST00000469376	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	32.66	■■■□□ 2.82
OPN3-204	ENST00000469376	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	32.66	■■■□□ 2.82
OPN3-204	ENST00000469376	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		32.65	■■■□□ 2.82
OPN3-204	ENST00000469376	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	32.65	■■■□□ 2.82
OPN3-204	ENST00000469376	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	32.64	■■■□□ 2.82
OPN3-204	ENST00000469376	DCC	P43146	1447 aa		32.64	■■■□□ 2.82
OPN3-204	ENST00000469376	ATF3	P18847	181 aa		32.64	■■■□□ 2.82
OPN3-204	ENST00000469376	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		32.64	■■■□□ 2.82
OPN3-204	ENST00000469376	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		32.63	■■■□□ 2.81
OPN3-204	ENST00000469376	AKAP12	Q02952	1782 aa		32.63	■■■□□ 2.81
OPN3-204	ENST00000469376	MSH6	P52701	1360 aa		32.62	■■■□□ 2.81
OPN3-204	ENST00000469376	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	32.62	■■■□□ 2.81
OPN3-204	ENST00000469376	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	32.62	■■■□□ 2.81
OPN3-204	ENST00000469376	IL27	Q8NEV9	243 aa		32.61	■■■□□ 2.81
OPN3-204	ENST00000469376	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		32.61	■■■□□ 2.81
OPN3-204	ENST00000469376	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		32.6	■■■□□ 2.81
OPN3-204	ENST00000469376	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		32.59	■■■□□ 2.81
OPN3-204	ENST00000469376	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		32.59	■■■□□ 2.81
OPN3-204	ENST00000469376	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	32.59	■■■□□ 2.81
OPN3-204	ENST00000469376	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		32.59	■■■□□ 2.81
OPN3-204	ENST00000469376	NUCB1	Q02818	461 aa		32.59	■■■□□ 2.81
OPN3-204	ENST00000469376	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		32.59	■■■□□ 2.81
OPN3-204	ENST00000469376	IFT57	Q9NWB7	429 aa		32.59	■■■□□ 2.81
OPN3-204	ENST00000469376	GNAI1	P63096	354 aa		32.58	■■■□□ 2.81
OPN3-204	ENST00000469376	IL13	P35225	146 aa		32.57	■■■□□ 2.8
OPN3-204	ENST00000469376	USP6	P35125	1406 aa		32.57	■■■□□ 2.8
OPN3-204	ENST00000469376	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		32.56	■■■□□ 2.8
OPN3-204	ENST00000469376	VAMP4	O75379	141 aa		32.54	■■■□□ 2.8
OPN3-204	ENST00000469376	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		32.54	■■■□□ 2.8
OPN3-204	ENST00000469376	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	32.54	■■■□□ 2.8
OPN3-204	ENST00000469376	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		32.54	■■■□□ 2.8
OPN3-204	ENST00000469376	MST1R	Q04912	1400 aa		32.54	■■■□□ 2.8
OPN3-204	ENST00000469376	ORAI2	Q96SN7	254 aa		32.54	■■■□□ 2.8
OPN3-204	ENST00000469376	ZNF853	P0CG23	659 aa		32.53	■■■□□ 2.8
OPN3-204	ENST00000469376	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	32.53	■■■□□ 2.8
OPN3-204	ENST00000469376	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		32.52	■■■□□ 2.8
OPN3-204	ENST00000469376	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		32.52	■■■□□ 2.8
OPN3-204	ENST00000469376	HMOX1	P09601	288 aa		32.52	■■■□□ 2.8
OPN3-204	ENST00000469376	FBLN1	P23142	703 aa		32.51	■■■□□ 2.8
OPN3-204	ENST00000469376	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		32.5	■■■□□ 2.79
OPN3-204	ENST00000469376	NME9	Q86XW9	330 aa		32.5	■■■□□ 2.79
OPN3-204	ENST00000469376	SSH2	Q76I76	1423 aa		32.5	■■■□□ 2.79
OPN3-204	ENST00000469376	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		32.5	■■■□□ 2.79
OPN3-204	ENST00000469376	GCC1	Q96CN9	775 aa		32.49	■■■□□ 2.79
OPN3-204	ENST00000469376	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	32.49	■■■□□ 2.79
OPN3-204	ENST00000469376	COG3	Q96JB2	828 aa		32.49	■■■□□ 2.79
OPN3-204	ENST00000469376	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		32.47	■■■□□ 2.79
OPN3-204	ENST00000469376	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		32.47	■■■□□ 2.79
OPN3-204	ENST00000469376	ABCC4	O15439	1325 aa		32.46	■■■□□ 2.79
OPN3-204	ENST00000469376	MBIP	Q9NS73	344 aa		32.45	■■■□□ 2.79
OPN3-204	ENST00000469376	CFAP44	Q96MT7	982 aa		32.45	■■■□□ 2.78

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms