RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449757.5

DDX39B-211, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-211ENST00000449757 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
DDX39B-211ENST00000449757 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa14.82□□□□□ -0.04
DDX39B-211ENST00000449757 EVC2Q86UK5 1308 aa14.82□□□□□ -0.04
DDX39B-211ENST00000449757 CASZ1Q86V15 1759 aa14.82□□□□□ -0.04
DDX39B-211ENST00000449757 DCAF8L1A6NGE4 600 aa14.81□□□□□ -0.04
DDX39B-211ENST00000449757 YY1P25490 414 aa14.81□□□□□ -0.04
DDX39B-211ENST00000449757 KAT6BQ8WYB5 2073 aa14.81□□□□□ -0.04
DDX39B-211ENST00000449757 KCNQ2O43526 872 aa14.8□□□□□ -0.04
DDX39B-211ENST00000449757 WDR17Q8IZU2 1322 aa14.8□□□□□ -0.04
DDX39B-211ENST00000449757 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
DDX39B-211ENST00000449757 MYOM1P52179 1685 aa14.79□□□□□ -0.04
DDX39B-211ENST00000449757 MON2Q7Z3U7 1717 aa14.79□□□□□ -0.04
DDX39B-211ENST00000449757 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
DDX39B-211ENST00000449757 LTN1O94822 1766 aa14.78□□□□□ -0.04
DDX39B-211ENST00000449757 NINLQ9Y2I6 1382 aa14.78□□□□□ -0.04
DDX39B-211ENST00000449757 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
DDX39B-211ENST00000449757 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa14.77□□□□□ -0.04
DDX39B-211ENST00000449757 L3MBTL2Q969R5 705 aa14.77□□□□□ -0.05
DDX39B-211ENST00000449757 AXIN2Q9Y2T1 843 aa14.77□□□□□ -0.05
DDX39B-211ENST00000449757 NFAT5O94916 1531 aa14.76□□□□□ -0.05
DDX39B-211ENST00000449757 PTF1AQ7RTS3 328 aa14.76□□□□□ -0.05
DDX39B-211ENST00000449757 KCNH5Q8NCM2 988 aa14.76□□□□□ -0.05
DDX39B-211ENST00000449757 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
DDX39B-211ENST00000449757 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
DDX39B-211ENST00000449757 NHSQ6T4R5 1651 aa14.75□□□□□ -0.05
DDX39B-211ENST00000449757 PLSCR1O15162 318 aa14.75□□□□□ -0.05
DDX39B-211ENST00000449757 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
DDX39B-211ENST00000449757 TTC21AQ8NDW8 1320 aa14.74□□□□□ -0.05
DDX39B-211ENST00000449757 ZBTB7AO95365 584 aa14.74□□□□□ -0.05
DDX39B-211ENST00000449757 NEUROD1Q13562 356 aa14.74□□□□□ -0.05
DDX39B-211ENST00000449757 ARHGEF25Q86VW2 580 aa14.74□□□□□ -0.05
DDX39B-211ENST00000449757 ABCC6O95255 1503 aa14.74□□□□□ -0.05
DDX39B-211ENST00000449757 TNS2Q63HR2 1409 aa14.74□□□□□ -0.05
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
DDX39B-211ENST00000449757 CARD10Q9BWT7 1032 aa14.73□□□□□ -0.05
DDX39B-211ENST00000449757 STK32BQ9NY57 414 aa14.73□□□□□ -0.05
DDX39B-211ENST00000449757 CCDC7Q96M83 1385 aa14.73□□□□□ -0.05
DDX39B-211ENST00000449757 USP54Q70EL1 1684 aa14.72□□□□□ -0.05
DDX39B-211ENST00000449757 BTAF1O14981 1849 aa14.72□□□□□ -0.05
DDX39B-211ENST00000449757 EXOC5O00471 708 aa14.72□□□□□ -0.05
DDX39B-211ENST00000449757 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
DDX39B-211ENST00000449757 SIN3AQ96ST3 1273 aa14.72□□□□□ -0.05
DDX39B-211ENST00000449757 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
DDX39B-211ENST00000449757 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
DDX39B-211ENST00000449757 BCL9O00512 1426 aa14.71□□□□□ -0.05
DDX39B-211ENST00000449757 TXNRD1Q16881 649 aa14.7□□□□□ -0.06
DDX39B-211ENST00000449757 ACSBG1Q96GR2 724 aa14.7□□□□□ -0.06
DDX39B-211ENST00000449757 NLRP2Q9NX02 1062 aa14.69□□□□□ -0.06
DDX39B-211ENST00000449757 PROM2Q8N271 834 aa14.68□□□□□ -0.06
DDX39B-211ENST00000449757 TMC1Q8TDI8 760 aa14.68□□□□□ -0.06
DDX39B-211ENST00000449757 CHD4Q14839 1912 aa14.68□□□□□ -0.06
DDX39B-211ENST00000449757 SLC15A2Q16348 729 aa14.67□□□□□ -0.06
DDX39B-211ENST00000449757 NME9Q86XW9 330 aa14.67□□□□□ -0.06
DDX39B-211ENST00000449757 ERBB3P21860 1342 aa14.66□□□□□ -0.06
DDX39B-211ENST00000449757 PAPPAQ13219 1627 aa14.66□□□□□ -0.06
DDX39B-211ENST00000449757 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
DDX39B-211ENST00000449757 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
DDX39B-211ENST00000449757 UTRNP46939 3433 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX39B-211ENST00000449757 IL2RBP14784 551 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX39B-211ENST00000449757 PTGER2P43116 358 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX39B-211ENST00000449757 ANKRD24Q8TF21 1146 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX39B-211ENST00000449757 CARD11Q9BXL7 1154 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX39B-211ENST00000449757 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
DDX39B-211ENST00000449757 DOT1LQ8TEK3 1739 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX39B-211ENST00000449757 CD163L1Q9NR16 1453 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX39B-211ENST00000449757 USP31Q70CQ4 1352 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX39B-211ENST00000449757 MTFR1LQ9H019 292 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX39B-211ENST00000449757 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX39B-211ENST00000449757 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
DDX39B-211ENST00000449757 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa14.62□□□□□ -0.07
DDX39B-211ENST00000449757 RGPD2P0DJD1 1756 aa14.62□□□□□ -0.07
DDX39B-211ENST00000449757 KLHL34Q8N239 644 aa14.61□□□□□ -0.07
DDX39B-211ENST00000449757 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
DDX39B-211ENST00000449757 QSER1Q2KHR3 1735 aa14.61□□□□□ -0.07
DDX39B-211ENST00000449757 A0A1W2PP64 1363 aa14.6□□□□□ -0.07
DDX39B-211ENST00000449757 SYT17Q9BSW7 474 aa14.6□□□□□ -0.07
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF827Q17R98 1081 aa14.59□□□□□ -0.07
DDX39B-211ENST00000449757 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa14.59□□□□□ -0.07
DDX39B-211ENST00000449757 TERF2IPQ9NYB0 399 aa14.59□□□□□ -0.07
DDX39B-211ENST00000449757 TONSLQ96HA7 1378 aa14.59□□□□□ -0.07
DDX39B-211ENST00000449757 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
DDX39B-211ENST00000449757 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
DDX39B-211ENST00000449757 ARXQ96QS3 562 aa14.58□□□□□ -0.08
DDX39B-211ENST00000449757 SHANK3Q9BYB0 1731 aa14.58□□□□□ -0.08
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
DDX39B-211ENST00000449757 SGIP1Q9BQI5 828 aa14.56□□□□□ -0.08
DDX39B-211ENST00000449757 LY75O60449 1722 aa14.55□□□□□ -0.08
DDX39B-211ENST00000449757 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
DDX39B-211ENST00000449757 POLD1P28340 1107 aa14.54□□□□□ -0.08
DDX39B-211ENST00000449757 GPR162Q16538 588 aa14.54□□□□□ -0.08
DDX39B-211ENST00000449757 IP6K1Q92551 441 aa14.54□□□□□ -0.08
DDX39B-211ENST00000449757 COG3Q96JB2 828 aa14.54□□□□□ -0.08
DDX39B-211ENST00000449757 LRRC4BQ9NT99 713 aa14.54□□□□□ -0.08
DDX39B-211ENST00000449757 KIF20BQ96Q89 1820 aa14.53□□□□□ -0.08
DDX39B-211ENST00000449757 AMPHP49418 695 aa14.53□□□□□ -0.08
DDX39B-211ENST00000449757 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa14.53□□□□□ -0.08
DDX39B-211ENST00000449757 MAP3K5Q99683 1374 aa14.52□□□□□ -0.08
DDX39B-211ENST00000449757 KCNQ4P56696 695 aa14.52□□□□□ -0.09
DDX39B-211ENST00000449757 SLC27A3Q5K4L6 730 aa14.52□□□□□ -0.09
DDX39B-211ENST00000449757 COL24A1Q17RW2 1714 aa14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms