RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410678.1

RNU6-402P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 402, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-402P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-402P-201ENST00000410678 CCNYL3P0C7X3 344 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-402P-201ENST00000410678 GMCL1Q96IK5 515 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-402P-201ENST00000410678 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
RNU6-402P-201ENST00000410678 GNB5O14775 395 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-402P-201ENST00000410678 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-402P-201ENST00000410678 DYRK3O43781 588 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-402P-201ENST00000410678 FCHSD2O94868 740 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-402P-201ENST00000410678 GRM5P41594 1212 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-402P-201ENST00000410678 PRSS36Q5K4E3 855 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-402P-201ENST00000410678 SUV39H2Q9H5I1 410 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-402P-201ENST00000410678 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-402P-201ENST00000410678 MS4A1P11836 297 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-402P-201ENST00000410678 LINC00114Q6XXX2 140 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-402P-201ENST00000410678 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-402P-201ENST00000410678 NUTM2FA1L443 756 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-402P-201ENST00000410678 SHISA8B8ZZ34 492 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-402P-201ENST00000410678 MX2P20592 715 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-402P-201ENST00000410678 USP46P62068 366 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-402P-201ENST00000410678 TRIM22Q8IYM9 498 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-402P-201ENST00000410678 TRERF1Q96PN7 1200 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-402P-201ENST00000410678 EVA1BQ9NVM1 165 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-402P-201ENST00000410678 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-402P-201ENST00000410678 KDM4AO75164 1064 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-402P-201ENST00000410678 MAP2K3P46734 347 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-402P-201ENST00000410678 KCNH2Q12809 1159 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-402P-201ENST00000410678 PTPRNQ16849 979 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-402P-201ENST00000410678 RETREG3Q86VR2 466 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-402P-201ENST00000410678 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-402P-201ENST00000410678 GPR25O00155 361 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-402P-201ENST00000410678 TPSG1Q9NRR2 321 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-402P-201ENST00000410678 ELNP15502 786 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 AMPD1P23109 780 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 JAG1P78504 1218 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 Q6ZVU0 165 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 RNF114Q9Y508 228 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 FSHRP23945 695 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 CCDC116Q8IYX3 515 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 RNF217Q8TC41 542 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 EDARADDQ8WWZ3 215 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 H7C1W4 665 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 IRAK1P51617 712 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 WDR70Q9NW82 654 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 HOXA2O43364 376 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 HIC1Q14526 733 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 HLA-CQ95604 372 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 H2AFB1P0C5Y9 115 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 H2AFB2P0C5Z0 115 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 CD46P15529 392 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 CBLBQ13191 982 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 AGERQ15109 404 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 DBN1Q16643 649 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 LCE4AQ5TA78 99 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 NLRP7Q8WX94 980 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 FOXJ1Q92949 421 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 DGKGP49619 791 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 RIC3Q7Z5B4 369 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 KLRG1Q96E93 195 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-402P-201ENST00000410678 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-402P-201ENST00000410678 RELBQ01201 579 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-402P-201ENST00000410678 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-402P-201ENST00000410678 C6orf229H3BNL8 230 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-402P-201ENST00000410678 APBA3O96018 575 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-402P-201ENST00000410678 GUCA2AQ02747 115 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-402P-201ENST00000410678 C4orf48Q5BLP8 95 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-402P-201ENST00000410678 BTBD6Q96KE9 485 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-402P-201ENST00000410678 AGBL1Q96MI9 1066 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-402P-201ENST00000410678 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-402P-201ENST00000410678 CFHR5Q9BXR6 569 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-402P-201ENST00000410678 SPDYE3A6NKU9 549 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-402P-201ENST00000410678 CTHP32929 405 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-402P-201ENST00000410678 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
RNU6-402P-201ENST00000410678 DESI1Q6ICB0 168 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-402P-201ENST00000410678 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
RNU6-402P-201ENST00000410678 RNF112Q9ULX5 631 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-402P-201ENST00000410678 PHF24Q9UPV7 400 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-402P-201ENST00000410678 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-402P-201ENST00000410678 PHOX2BQ99453 314 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-402P-201ENST00000410678 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms