RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
C6orf48-208ENST00000395788 PADI6Q6TGC4 694 aa8.67□□□□□ -1.02
C6orf48-208ENST00000395788 CYP4X1Q8N118 509 aa8.67□□□□□ -1.02
C6orf48-208ENST00000395788 NEO1Q92859 1461 aa8.67□□□□□ -1.02
C6orf48-208ENST00000395788 TONSLQ96HA7 1378 aa8.67□□□□□ -1.02
C6orf48-208ENST00000395788 SCAPERQ9BY12 1400 aa8.67□□□□□ -1.02
C6orf48-208ENST00000395788 CFAP74Q9C0B2 1584 aa8.67□□□□□ -1.02
C6orf48-208ENST00000395788 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
C6orf48-208ENST00000395788 TRIM47Q96LD4 638 aa8.66□□□□□ -1.02
C6orf48-208ENST00000395788 KDM5CP41229 1560 aa8.65□□□□□ -1.02
C6orf48-208ENST00000395788 FAM135AQ9P2D6 1515 aa8.65□□□□□ -1.02
C6orf48-208ENST00000395788 TEX14Q8IWB6 1497 aa8.65□□□□□ -1.02
C6orf48-208ENST00000395788 RPIAP49247 311 aa8.65□□□□□ -1.02
C6orf48-208ENST00000395788 CYB5RLQ6IPT4 315 aa8.65□□□□□ -1.02
C6orf48-208ENST00000395788 AFAP1Q8N556 730 aa8.65□□□□□ -1.02
C6orf48-208ENST00000395788 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa8.65□□□□□ -1.02
C6orf48-208ENST00000395788 IQGAP3Q86VI3 1631 aa8.65□□□□□ -1.03
C6orf48-208ENST00000395788 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa8.65□□□□□ -1.03
C6orf48-208ENST00000395788 ATP7AQ04656 1500 aa8.64□□□□□ -1.03
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa8.64□□□□□ -1.03
C6orf48-208ENST00000395788 MLH3Q9UHC1 1453 aa8.64□□□□□ -1.03
C6orf48-208ENST00000395788 POGZQ7Z3K3 1410 aa8.64□□□□□ -1.03
C6orf48-208ENST00000395788 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa8.64□□□□□ -1.03
C6orf48-208ENST00000395788 ATP10AO60312 1499 aa8.64□□□□□ -1.03
C6orf48-208ENST00000395788 DEPDC5O75140 1603 aa8.63□□□□□ -1.03
C6orf48-208ENST00000395788 GRXCR2A6NFK2 248 aa8.63□□□□□ -1.03
C6orf48-208ENST00000395788 OSBPP22059 807 aa8.63□□□□□ -1.03
C6orf48-208ENST00000395788 KMT5BQ4FZB7 885 aa8.63□□□□□ -1.03
C6orf48-208ENST00000395788 SENP2Q9HC62 589 aa8.63□□□□□ -1.03
C6orf48-208ENST00000395788 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
C6orf48-208ENST00000395788 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
C6orf48-208ENST00000395788 VWDEQ8N2E2 1590 aa8.62□□□□□ -1.03
C6orf48-208ENST00000395788 NR1I2O75469 434 aa8.62□□□□□ -1.03
C6orf48-208ENST00000395788 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
C6orf48-208ENST00000395788 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
C6orf48-208ENST00000395788 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa8.61□□□□□ -1.03
C6orf48-208ENST00000395788 L3MBTL2Q969R5 705 aa8.61□□□□□ -1.03
C6orf48-208ENST00000395788 PLA2R1Q13018 1463 aa8.61□□□□□ -1.03
C6orf48-208ENST00000395788 DIP2BQ9P265 1576 aa8.61□□□□□ -1.03
C6orf48-208ENST00000395788 MROH1Q8NDA8 1641 aa8.59□□□□□ -1.03
C6orf48-208ENST00000395788 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
C6orf48-208ENST00000395788 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa8.59□□□□□ -1.03
C6orf48-208ENST00000395788 BCORL1Q5H9F3 1711 aa8.59□□□□□ -1.03
C6orf48-208ENST00000395788 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
C6orf48-208ENST00000395788 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa8.58□□□□□ -1.04
C6orf48-208ENST00000395788 HECW2Q9P2P5 1572 aa8.58□□□□□ -1.04
C6orf48-208ENST00000395788 PTPRTO14522 1441 aa8.58□□□□□ -1.04
C6orf48-208ENST00000395788 CFHP08603 1231 aa8.58□□□□□ -1.04
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C6orf48-208ENST00000395788 SLC16A10Q8TF71 515 aa8.58□□□□□ -1.04
C6orf48-208ENST00000395788 LMTK2Q8IWU2 1503 aa8.58□□□□□ -1.04
C6orf48-208ENST00000395788 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
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C6orf48-208ENST00000395788 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa8.56□□□□□ -1.04
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C6orf48-208ENST00000395788 NBPF8Q3BBV2 869 aa8.56□□□□□ -1.04
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM134Q9H6X4 195 aa8.56□□□□□ -1.04
C6orf48-208ENST00000395788 RICTORQ6R327 1708 aa8.56□□□□□ -1.04
C6orf48-208ENST00000395788 TET3O43151 1660 aa8.56□□□□□ -1.04
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C6orf48-208ENST00000395788 SMPD1P17405 629 aa8.55□□□□□ -1.04
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C6orf48-208ENST00000395788 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa8.54□□□□□ -1.04
C6orf48-208ENST00000395788 ABCA6Q8N139 1617 aa8.54□□□□□ -1.04
C6orf48-208ENST00000395788 NEURL4Q96JN8 1562 aa8.54□□□□□ -1.04
C6orf48-208ENST00000395788 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa8.54□□□□□ -1.04
C6orf48-208ENST00000395788 KANK1Q14678 1352 aa8.54□□□□□ -1.04
C6orf48-208ENST00000395788 SPSB2Q99619 263 aa8.54□□□□□ -1.04
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C6orf48-208ENST00000395788 TRPM2O94759 1503 aa8.54□□□□□ -1.04
C6orf48-208ENST00000395788 CCDC144AA2RUR9 1427 aa8.54□□□□□ -1.04
C6orf48-208ENST00000395788 E9PCH4 1651 aa8.53□□□□□ -1.04
C6orf48-208ENST00000395788 KIF3BO15066 747 aa8.53□□□□□ -1.04
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C6orf48-208ENST00000395788 RAPGEF3O95398 923 aa8.52□□□□□ -1.05
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C6orf48-208ENST00000395788 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
C6orf48-208ENST00000395788 EFCAB6Q5THR3 1501 aa8.52□□□□□ -1.05
C6orf48-208ENST00000395788 REREQ9P2R6 1566 aa8.52□□□□□ -1.05
C6orf48-208ENST00000395788 NPAS3Q8IXF0 933 aa8.51□□□□□ -1.05
C6orf48-208ENST00000395788 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
C6orf48-208ENST00000395788 KIF13AQ9H1H9 1805 aa8.5□□□□□ -1.05
C6orf48-208ENST00000395788 SLC10A3P09131 477 aa8.5□□□□□ -1.05
C6orf48-208ENST00000395788 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
C6orf48-208ENST00000395788 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
C6orf48-208ENST00000395788 PRAG1Q86YV5 1406 aa8.5□□□□□ -1.05
C6orf48-208ENST00000395788 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
C6orf48-208ENST00000395788 YEATS2Q9ULM3 1422 aa8.5□□□□□ -1.05
C6orf48-208ENST00000395788 AGLP35573 1532 aa8.49□□□□□ -1.05
C6orf48-208ENST00000395788 GPRASP1Q5JY77 1395 aa8.49□□□□□ -1.05
C6orf48-208ENST00000395788 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa8.49□□□□□ -1.05
C6orf48-208ENST00000395788 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa8.49□□□□□ -1.05
C6orf48-208ENST00000395788 WNT7AO00755 349 aa8.49□□□□□ -1.05
C6orf48-208ENST00000395788 ABCC3O15438 1527 aa8.49□□□□□ -1.05
C6orf48-208ENST00000395788 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
C6orf48-208ENST00000395788 CLTCL1P53675 1640 aa8.47□□□□□ -1.05
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