RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa30.35■■■□□ 2.45
AMIGO1-201ENST00000369862 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
AMIGO1-201ENST00000369862 PTPRUQ92729 1446 aa30.35■■■□□ 2.45
AMIGO1-201ENST00000369862 NRKQ7Z2Y5 1582 aa30.34■■■□□ 2.45
AMIGO1-201ENST00000369862 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC26A8Q96RN1 970 aa30.32■■■□□ 2.45
AMIGO1-201ENST00000369862 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP30.32■■■□□ 2.45
AMIGO1-201ENST00000369862 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa30.31■■■□□ 2.44
AMIGO1-201ENST00000369862 NUTM2FA1L443 756 aa30.3■■■□□ 2.44
AMIGO1-201ENST00000369862 DLG5Q8TDM6 1919 aa30.3■■■□□ 2.44
AMIGO1-201ENST00000369862 ACEP12821 1306 aa30.29■■■□□ 2.44
AMIGO1-201ENST00000369862 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa30.29■■■□□ 2.44
AMIGO1-201ENST00000369862 BRPF3Q9ULD4 1205 aa30.29■■■□□ 2.44
AMIGO1-201ENST00000369862 ALDH1L2Q3SY69 923 aa30.28■■■□□ 2.44
AMIGO1-201ENST00000369862 ITPRIPQ8IWB1 547 aa30.28■■■□□ 2.44
AMIGO1-201ENST00000369862 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
AMIGO1-201ENST00000369862 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
AMIGO1-201ENST00000369862 KIF16BQ96L93 1317 aa30.28■■■□□ 2.44
AMIGO1-201ENST00000369862 PLEKHG3A1L390 1219 aa30.27■■■□□ 2.44
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AMIGO1-201ENST00000369862 SLIT1O75093 1534 aa30.27■■■□□ 2.44
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM57Q8N5G2 664 aa30.27■■■□□ 2.44
AMIGO1-201ENST00000369862 ARHGAP23Q9P227 1491 aa30.26■■■□□ 2.43
AMIGO1-201ENST00000369862 EID1Q9Y6B2 187 aa30.26■■■□□ 2.43
AMIGO1-201ENST00000369862 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa30.25■■■□□ 2.43
AMIGO1-201ENST00000369862 OVOS2Q6IE36 1432 aa30.25■■■□□ 2.43
AMIGO1-201ENST00000369862 USP6P35125 1406 aa30.24■■■□□ 2.43
AMIGO1-201ENST00000369862 PLPPR3Q6T4P5 718 aa30.24■■■□□ 2.43
AMIGO1-201ENST00000369862 TBC1D32Q96NH3 1257 aa30.24■■■□□ 2.43
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF853P0CG23 659 aa30.23■■■□□ 2.43
AMIGO1-201ENST00000369862 IFT57Q9NWB7 429 aa30.23■■■□□ 2.43
AMIGO1-201ENST00000369862 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
AMIGO1-201ENST00000369862 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
AMIGO1-201ENST00000369862 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa30.22■■■□□ 2.43
AMIGO1-201ENST00000369862 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa30.22■■■□□ 2.43
AMIGO1-201ENST00000369862 VAMP4O75379 141 aa30.22■■■□□ 2.43
AMIGO1-201ENST00000369862 GNAI1P63096 354 aa30.22■■■□□ 2.43
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF428Q96B54 188 aa30.22■■■□□ 2.43
AMIGO1-201ENST00000369862 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
AMIGO1-201ENST00000369862 TSPYL6Q8N831 410 aa30.21■■■□□ 2.43
AMIGO1-201ENST00000369862 MBIPQ9NS73 344 aa30.21■■■□□ 2.43
AMIGO1-201ENST00000369862 NALCNQ8IZF0 1738 aa30.21■■■□□ 2.43
AMIGO1-201ENST00000369862 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.42
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AMIGO1-201ENST00000369862 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa30.19■■■□□ 2.42
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AMIGO1-201ENST00000369862 FAM83GA6ND36 823 aa30.18■■■□□ 2.42
AMIGO1-201ENST00000369862 AEBP1Q8IUX7 1158 aa30.18■■■□□ 2.42
AMIGO1-201ENST00000369862 TBX22Q9Y458 520 aa30.18■■■□□ 2.42
AMIGO1-201ENST00000369862 SSH2Q76I76 1423 aa30.18■■■□□ 2.42
AMIGO1-201ENST00000369862 ANTXR1Q9H6X2 564 aa30.16■■■□□ 2.42
AMIGO1-201ENST00000369862 PTCH1Q13635 1447 aa30.16■■■□□ 2.42
AMIGO1-201ENST00000369862 LMOD3Q0VAK6 560 aa30.16■■■□□ 2.42
AMIGO1-201ENST00000369862 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
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AMIGO1-201ENST00000369862 USP31Q70CQ4 1352 aa30.14■■■□□ 2.42
AMIGO1-201ENST00000369862 DCTN1Q14203 1278 aa30.14■■■□□ 2.42
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AMIGO1-201ENST00000369862 SMC5Q8IY18 1101 aa30.11■■■□□ 2.41
AMIGO1-201ENST00000369862 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
AMIGO1-201ENST00000369862 C8orf58Q8NAV2 365 aa30.11■■■□□ 2.41
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AMIGO1-201ENST00000369862 RGPD1P0DJD0 1748 aa30.11■■■□□ 2.41
AMIGO1-201ENST00000369862 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
AMIGO1-201ENST00000369862 ARHGAP45Q92619 1136 aa30.09■■■□□ 2.41
AMIGO1-201ENST00000369862 PIK3R4Q99570 1358 aa30.09■■■□□ 2.41
AMIGO1-201ENST00000369862 SOX12O15370 315 aa30.08■■■□□ 2.41
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AMIGO1-201ENST00000369862 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
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AMIGO1-201ENST00000369862 FMN2Q9NZ56 1722 aa30.03■■■□□ 2.4
AMIGO1-201ENST00000369862 ABCC4O15439 1325 aa30.02■■■□□ 2.4
AMIGO1-201ENST00000369862 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
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AMIGO1-201ENST00000369862 C22orf23Q9BZE7 217 aa30■■■□□ 2.39
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AMIGO1-201ENST00000369862 NUCB1Q02818 461 aa29.98■■■□□ 2.39
AMIGO1-201ENST00000369862 C1orf115Q9H7X2 142 aa29.97■■■□□ 2.39
AMIGO1-201ENST00000369862 ARHGEF10O15013 1369 aa29.97■■■□□ 2.39
AMIGO1-201ENST00000369862 CHL1O00533 1208 aa29.96■■■□□ 2.39
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AMIGO1-201ENST00000369862 KRT24Q2M2I5 525 aa29.96■■■□□ 2.39
AMIGO1-201ENST00000369862 FLT4P35916 1363 aa29.96■■■□□ 2.39
AMIGO1-201ENST00000369862 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.38
AMIGO1-201ENST00000369862 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
AMIGO1-201ENST00000369862 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM43AQ8N2R8 423 aa29.94■■■□□ 2.38
AMIGO1-201ENST00000369862 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
AMIGO1-201ENST00000369862 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
AMIGO1-201ENST00000369862 ANKARQ7Z5J8 1434 aa29.93■■■□□ 2.38
AMIGO1-201ENST00000369862 CRB1P82279 1406 aa29.92■■■□□ 2.38
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