RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 ALDH1L2Q3SY69 923 aa26.62■■□□□ 1.85
OPN3-201ENST00000366554 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.62■■□□□ 1.85
OPN3-201ENST00000366554 TSPY26PQ9H489 355 aa26.61■■□□□ 1.85
OPN3-201ENST00000366554 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.61■■□□□ 1.85
OPN3-201ENST00000366554 SIRT2Q8IXJ6 389 aa26.61■■□□□ 1.85
OPN3-201ENST00000366554 USP32Q8NFA0 1604 aa26.6■■□□□ 1.85
OPN3-201ENST00000366554 CFAP44Q96MT7 982 aa26.6■■□□□ 1.85
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OPN3-201ENST00000366554 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa26.56■■□□□ 1.84
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OPN3-201ENST00000366554 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
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OPN3-201ENST00000366554 TAF3Q5VWG9 929 aa26.5■■□□□ 1.83
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OPN3-201ENST00000366554 ZNF428Q96B54 188 aa26.49■■□□□ 1.83
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OPN3-201ENST00000366554 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
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OPN3-201ENST00000366554 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
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OPN3-201ENST00000366554 PTCH1Q13635 1447 aa26.46■■□□□ 1.83
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OPN3-201ENST00000366554 PHF14O94880 888 aa26.46■■□□□ 1.83
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OPN3-201ENST00000366554 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
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OPN3-201ENST00000366554 NRXN1Q9ULB1 1477 aa26.43■■□□□ 1.82
OPN3-201ENST00000366554 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
OPN3-201ENST00000366554 TMX3Q96JJ7 454 aa26.42■■□□□ 1.82
OPN3-201ENST00000366554 DCTPP1Q9H773 170 aa26.42■■□□□ 1.82
OPN3-201ENST00000366554 ABCC4O15439 1325 aa26.42■■□□□ 1.82
OPN3-201ENST00000366554 IGSF3O75054 1194 aa26.41■■□□□ 1.82
OPN3-201ENST00000366554 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
OPN3-201ENST00000366554 FBLN2P98095 1184 aa26.41■■□□□ 1.82
OPN3-201ENST00000366554 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa26.41■■□□□ 1.82
OPN3-201ENST00000366554 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
OPN3-201ENST00000366554 KIAA1524Q8TCG1 905 aa26.4■■□□□ 1.82
OPN3-201ENST00000366554 SDSP20132 328 aa26.4■■□□□ 1.82
OPN3-201ENST00000366554 TET3O43151 1660 aa26.39■■□□□ 1.82
OPN3-201ENST00000366554 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
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OPN3-201ENST00000366554 REC8O95072 547 aa26.38■■□□□ 1.81
OPN3-201ENST00000366554 CUL4AQ13619 759 aa26.38■■□□□ 1.81
OPN3-201ENST00000366554 TRAK1Q9UPV9 953 aa26.38■■□□□ 1.81
OPN3-201ENST00000366554 VAMP4O75379 141 aa26.38■■□□□ 1.81
OPN3-201ENST00000366554 CASC1Q6TDU7 716 aa26.38■■□□□ 1.81
OPN3-201ENST00000366554 OGFRQ9NZT2 677 aa26.38■■□□□ 1.81
OPN3-201ENST00000366554 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa26.38■■□□□ 1.81
OPN3-201ENST00000366554 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
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OPN3-201ENST00000366554 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
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OPN3-201ENST00000366554 NEK4P51957 841 aa26.34■■□□□ 1.81
OPN3-201ENST00000366554 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.34■■□□□ 1.81
OPN3-201ENST00000366554 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
OPN3-201ENST00000366554 USP48Q86UV5 1035 aa26.34■■□□□ 1.81
OPN3-201ENST00000366554 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
OPN3-201ENST00000366554 KCNF1Q9H3M0 494 aa26.33■■□□□ 1.81
OPN3-201ENST00000366554 GDPD2Q9HCC8 539 aa26.33■■□□□ 1.81
OPN3-201ENST00000366554 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.8
OPN3-201ENST00000366554 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.8
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