RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362865.1

RNU6-227P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 227, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-227P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-227P-201ENST00000362865 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
RNU6-227P-201ENST00000362865 MPNDQ8N594 471 aa5.4□□□□□ -1.54
RNU6-227P-201ENST00000362865 CDK15Q96Q40 435 aa5.4□□□□□ -1.54
RNU6-227P-201ENST00000362865 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 ALDH1A1P00352 501 aa5.39□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 SMPD1P17405 629 aa5.39□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 GRM5P41594 1212 aa5.39□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 ARID5BQ14865 1188 aa5.39□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 WASHC4Q2M389 1173 aa5.39□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC10A4Q96EP9 437 aa5.39□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa5.39□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM181BA6NEQ2 426 aa5.38□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 POM121CA8CG34 1229 aa5.38□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 DGAT1O75907 488 aa5.38□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa5.38□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 ST8SIA5O15466 376 aa5.37□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 ADH1CP00326 375 aa5.37□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 C14orf37Q86TY3 774 aa5.37□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 WWC1Q8IX03 1113 aa5.37□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 KCTD17Q8N5Z5 321 aa5.37□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZMYND15Q9H091 742 aa5.37□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM187AA6NFU0 413 aa5.36□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 TRAK2O60296 914 aa5.36□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 NR3C2P08235 984 aa5.36□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 FSHRP23945 695 aa5.36□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP5.36□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa5.36□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 HPS1Q92902 700 aa5.36□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 WASF2Q9Y6W5 498 aa5.36□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 ESPNB1AK53 854 aa5.35□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 NR5A1Q13285 461 aa5.35□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 NNTQ13423 1086 aa5.35□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 LCE3BQ5TA77 95 aa5.35□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 ALG2Q9H553 416 aa5.35□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 SOX11P35716 441 aa5.34□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 NBPF20Q3BBV1 942 aa5.34□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.34□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.34□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 CEP126Q9P2H0 1117 aa5.34□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa5.34□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.33□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 AVPP01185 164 aa5.33□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 RAB15P59190 212 aa5.33□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 SEMA3FQ13275 785 aa5.33□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 AAASQ9NRG9 546 aa5.33□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 ERVH48-1M5A8F1 160 aa5.32□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa5.32□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCDC116Q8IYX3 515 aa5.32□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 PHTF2Q8N3S3 785 aa5.32□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF592Q92610 1267 aa5.32□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 PIK3CDO00329 1044 aa5.31□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 TIMP2P16035 220 aa5.31□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 WDR4P57081 412 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 SEPT12Q8IYM1 358 aa5.31□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 GLMNQ92990 594 aa5.31□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 ITPKCQ96DU7 683 aa5.31□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZFAND3Q9H8U3 227 aa5.31□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa5.31□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 TSGA10IPQ3SY00 556 aa5.3□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 RNF20Q5VTR2 975 aa5.3□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 RNF135Q8IUD6 432 aa5.3□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 UCN2Q96RP3 112 aa5.3□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 DACH1Q9UI36 760 aa5.3□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa5.3□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLFNL1Q499Z3 407 aa5.29□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 ERICH6Q7L0X2 663 aa5.29□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 CRIPAKQ8N1N5 446 aa5.29□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 CHIC2Q9UKJ5 165 aa5.29□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa5.29□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 ARID3CA6NKF2 412 aa5.28□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 AXIN1O15169 862 aa5.28□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 LILRA1O75019 489 aa5.28□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 GSK3AP49840 483 aa5.28□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 CBLBQ13191 982 aa5.28□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 CTC1Q2NKJ3 1217 aa5.28□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa5.28□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa5.28□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 ADD1P35611 737 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 135.6 ms