RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361125.1

SMURF1-201, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1-201ENST00000361125 NCOA1Q15788 1441 aa25.24■■□□□ 1.63
SMURF1-201ENST00000361125 RNF214Q8ND24 703 aa25.24■■□□□ 1.63
SMURF1-201ENST00000361125 KIF14Q15058 1648 aa25.23■■□□□ 1.63
SMURF1-201ENST00000361125 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.23■■□□□ 1.63
SMURF1-201ENST00000361125 CCDC70Q6NSX1 233 aa25.23■■□□□ 1.63
SMURF1-201ENST00000361125 FCHSD2O94868 740 aa25.23■■□□□ 1.63
SMURF1-201ENST00000361125 SLFN5Q08AF3 891 aa25.23■■□□□ 1.63
SMURF1-201ENST00000361125 STK3Q13188 491 aa25.23■■□□□ 1.63
SMURF1-201ENST00000361125 PRDM11Q9NQV5 511 aa25.23■■□□□ 1.63
SMURF1-201ENST00000361125 ABCC5O15440 1437 aa25.22■■□□□ 1.63
SMURF1-201ENST00000361125 RABEP1Q15276 862 aa25.22■■□□□ 1.63
SMURF1-201ENST00000361125 CUL7Q14999 1698 aa25.22■■□□□ 1.63
SMURF1-201ENST00000361125 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
SMURF1-201ENST00000361125 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
SMURF1-201ENST00000361125 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
SMURF1-201ENST00000361125 CD109Q6YHK3 1445 aa25.21■■□□□ 1.63
SMURF1-201ENST00000361125 SDF4Q9BRK5 362 aa25.21■■□□□ 1.63
SMURF1-201ENST00000361125 TMPOP42166 694 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
SMURF1-201ENST00000361125 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
SMURF1-201ENST00000361125 NFE2L2Q16236 605 aa25.21■■□□□ 1.63
SMURF1-201ENST00000361125 OLFM4Q6UX06 510 aa25.21■■□□□ 1.63
SMURF1-201ENST00000361125 CHD1LQ86WJ1 897 aa25.21■■□□□ 1.63
SMURF1-201ENST00000361125 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
SMURF1-201ENST00000361125 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
SMURF1-201ENST00000361125 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.2■■□□□ 1.63
SMURF1-201ENST00000361125 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
SMURF1-201ENST00000361125 PIP4K2BP78356 416 aa25.2■■□□□ 1.62
SMURF1-201ENST00000361125 IFT57Q9NWB7 429 aa25.2■■□□□ 1.62
SMURF1-201ENST00000361125 MCM10Q7L590 875 aa25.19■■□□□ 1.62
SMURF1-201ENST00000361125 AACSQ86V21 672 aa25.19■■□□□ 1.62
SMURF1-201ENST00000361125 SRGAP3O43295 1099 aa25.19■■□□□ 1.62
SMURF1-201ENST00000361125 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.18■■□□□ 1.62
SMURF1-201ENST00000361125 GNAT3A8MTJ3 354 aa25.18■■□□□ 1.62
SMURF1-201ENST00000361125 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP25.18■■□□□ 1.62
SMURF1-201ENST00000361125 CCDC61Q9Y6R9 512 aa25.17■■□□□ 1.62
SMURF1-201ENST00000361125 DCTN1Q14203 1278 aa25.17■■□□□ 1.62
SMURF1-201ENST00000361125 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SMURF1-201ENST00000361125 PDILTQ8N807 584 aa25.17■■□□□ 1.62
SMURF1-201ENST00000361125 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SMURF1-201ENST00000361125 CCDC57Q2TAC2 916 aa25.17■■□□□ 1.62
SMURF1-201ENST00000361125 SKAP1Q86WV1 359 aa25.17■■□□□ 1.62
SMURF1-201ENST00000361125 ADGRL1O94910 1474 aa25.17■■□□□ 1.62
SMURF1-201ENST00000361125 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa25.17■■□□□ 1.62
SMURF1-201ENST00000361125 CCDC39Q9UFE4 941 aa25.17■■□□□ 1.62
SMURF1-201ENST00000361125 C20orf194Q5TEA3 1177 aa25.16■■□□□ 1.62
SMURF1-201ENST00000361125 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SMURF1-201ENST00000361125 MAPKBP1O60336 1514 aa25.16■■□□□ 1.62
SMURF1-201ENST00000361125 TMEM57Q8N5G2 664 aa25.16■■□□□ 1.62
SMURF1-201ENST00000361125 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SMURF1-201ENST00000361125 FIBPO43427 364 aa25.16■■□□□ 1.62
SMURF1-201ENST00000361125 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP25.16■■□□□ 1.62
SMURF1-201ENST00000361125 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa25.16■■□□□ 1.62
SMURF1-201ENST00000361125 MCM2P49736 904 aa25.15■■□□□ 1.62
SMURF1-201ENST00000361125 USHBP1Q8N6Y0 703 aa25.15■■□□□ 1.62
SMURF1-201ENST00000361125 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
SMURF1-201ENST00000361125 GRIN2AQ12879 1464 aa25.14■■□□□ 1.62
SMURF1-201ENST00000361125 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
SMURF1-201ENST00000361125 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
SMURF1-201ENST00000361125 NME9Q86XW9 330 aa25.14■■□□□ 1.61
SMURF1-201ENST00000361125 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
SMURF1-201ENST00000361125 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
SMURF1-201ENST00000361125 MPHOSPH8Q99549 860 aa25.13■■□□□ 1.61
SMURF1-201ENST00000361125 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.12■■□□□ 1.61
SMURF1-201ENST00000361125 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
SMURF1-201ENST00000361125 ATP2B2Q01814 1243 aa25.11■■□□□ 1.61
SMURF1-201ENST00000361125 GPS2Q13227 327 aa25.11■■□□□ 1.61
SMURF1-201ENST00000361125 BICDL1Q6ZP65 573 aa25.11■■□□□ 1.61
SMURF1-201ENST00000361125 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.11■■□□□ 1.61
SMURF1-201ENST00000361125 NUTM1Q86Y26 1132 aa25.11■■□□□ 1.61
SMURF1-201ENST00000361125 CCDC173Q0VFZ6 552 aa25.1■■□□□ 1.61
SMURF1-201ENST00000361125 EPS15P42566 896 aa25.1■■□□□ 1.61
SMURF1-201ENST00000361125 KINO60870 393 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
SMURF1-201ENST00000361125 DUSP27Q5VZP5 1158 aa25.1■■□□□ 1.61
SMURF1-201ENST00000361125 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
SMURF1-201ENST00000361125 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
SMURF1-201ENST00000361125 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.1■■□□□ 1.61
SMURF1-201ENST00000361125 PDCP20941 246 aa25.09■■□□□ 1.61
SMURF1-201ENST00000361125 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
SMURF1-201ENST00000361125 FMNL2Q96PY5 1086 aa25.09■■□□□ 1.61
SMURF1-201ENST00000361125 TSPY26PQ9H489 355 aa25.09■■□□□ 1.61
SMURF1-201ENST00000361125 MBD3O95983 291 aa25.09■■□□□ 1.61
SMURF1-201ENST00000361125 STK38Q15208 465 aa25.09■■□□□ 1.61
SMURF1-201ENST00000361125 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.08■■□□□ 1.61
SMURF1-201ENST00000361125 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
SMURF1-201ENST00000361125 KCNH5Q8NCM2 988 aa25.08■■□□□ 1.6
SMURF1-201ENST00000361125 GRPEL1Q9HAV7 217 aa25.07■■□□□ 1.6
SMURF1-201ENST00000361125 SMC2O95347 1197 aa25.07■■□□□ 1.6
SMURF1-201ENST00000361125 TRIM5Q9C035 493 aa25.07■■□□□ 1.6
SMURF1-201ENST00000361125 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa25.07■■□□□ 1.6
SMURF1-201ENST00000361125 CCDC69A6NI79 296 aa25.06■■□□□ 1.6
SMURF1-201ENST00000361125 MCM4P33991 863 aa25.06■■□□□ 1.6
SMURF1-201ENST00000361125 NACAP1Q9BZK3 213 aa25.06■■□□□ 1.6
SMURF1-201ENST00000361125 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa25.06■■□□□ 1.6
SMURF1-201ENST00000361125 NUP133Q8WUM0 1156 aa25.06■■□□□ 1.6
SMURF1-201ENST00000361125 TTLL5Q6EMB2 1281 aa25.05■■□□□ 1.6
SMURF1-201ENST00000361125 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa25.05■■□□□ 1.6
SMURF1-201ENST00000361125 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
SMURF1-201ENST00000361125 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
SMURF1-201ENST00000361125 ANKRD1Q15327 319 aa25.04■■□□□ 1.6
SMURF1-201ENST00000361125 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
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